Protein–RNA interactions for Protein: Q15306

IRF4, Interferon regulatory factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4Q15306 AC127526.2-201ENST00000426436 775 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
IRF4Q15306 LINC01501-201ENST00000427523 409 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
IRF4Q15306 AC015923.1-201ENST00000435892 305 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
IRF4Q15306 SUMO2P3-201ENST00000438311 288 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
IRF4Q15306 AL353804.1-201ENST00000444482 451 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
IRF4Q15306 RN7SL273P-201ENST00000481561 299 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
IRF4Q15306 NENFP3-201ENST00000503735 313 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
IRF4Q15306 SCGB3A2-202ENST00000504320 440 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
IRF4Q15306 SNHG1-211ENST00000539921 1071 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
IRF4Q15306 AL163195.3-202ENST00000555283 578 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
IRF4Q15306 LINC01895-201ENST00000558690 404 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
IRF4Q15306 AC087477.5-202ENST00000560242 389 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
IRF4Q15306 LCMT1-AS1-204ENST00000569920 474 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
IRF4Q15306 AC011445.2-201ENST00000599274 173 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
IRF4Q15306 LINC01125-220ENST00000599501 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
IRF4Q15306 AC015726.1-202ENST00000602532 475 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
IRF4Q15306 AC009237.12-201ENST00000604755 742 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
IRF4Q15306 AC145423.1-201ENST00000605712 336 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
IRF4Q15306 LINC01125-249ENST00000627399 1067 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
IRF4Q15306 CPA3-201ENST00000296046 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
IRF4Q15306 ZNF638-201ENST00000264447 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
IRF4Q15306 PCGF5-204ENST00000543648 7144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
IRF4Q15306 CARD6-201ENST00000254691 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
IRF4Q15306 CALCOCO2-204ENST00000448105 1916 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.48
IRF4Q15306 OR10A6-204ENST00000642108 6104 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
IRF4Q15306 PDE4D-202ENST00000317118 2599 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
IRF4Q15306 FOXP2-203ENST00000378237 2187 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
IRF4Q15306 ECT2L-205ENST00000541398 4483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
IRF4Q15306 TRPC1-205ENST00000612385 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
IRF4Q15306 C6orf48-208ENST00000395788 815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
IRF4Q15306 RN7SKP286-201ENST00000410894 299 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
IRF4Q15306 AL158817.1-201ENST00000422310 933 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
IRF4Q15306 OR4K3-201ENST00000425829 947 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
IRF4Q15306 AC017074.2-201ENST00000439382 607 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
IRF4Q15306 AC064862.4-201ENST00000442180 334 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
IRF4Q15306 CUBNP2-201ENST00000443534 1139 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
IRF4Q15306 CASP12-206ENST00000446862 1196 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
IRF4Q15306 AL359265.3-201ENST00000456125 579 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
IRF4Q15306 AL157777.1-201ENST00000468100 304 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
IRF4Q15306 EPDR1-204ENST00000476620 555 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
IRF4Q15306 EFCAB10-203ENST00000480514 740 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
IRF4Q15306 AC099521.1-201ENST00000482557 334 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
IRF4Q15306 AC139720.1-201ENST00000509497 512 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
IRF4Q15306 AC008592.4-201ENST00000509999 450 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
IRF4Q15306 AC106872.4-201ENST00000510050 523 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
IRF4Q15306 AC096577.1-202ENST00000515649 448 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
IRF4Q15306 RN7SKP67-201ENST00000515905 235 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
IRF4Q15306 RN7SKP288-201ENST00000516227 268 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
IRF4Q15306 LINC00861-202ENST00000517869 606 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
IRF4Q15306 IGKV1OR22-1-201ENST00000521497 360 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
IRF4Q15306 AP003306.1-201ENST00000529875 353 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
IRF4Q15306 OR4A6P-201ENST00000534364 970 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
IRF4Q15306 AC091078.2-201ENST00000557145 559 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
IRF4Q15306 AC020978.7-201ENST00000575953 1187 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
IRF4Q15306 ATM-229ENST00000639953 587 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
IRF4Q15306 IGLV10-54-202ENST00000640991 351 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
IRF4Q15306 WDCP-201ENST00000295148 3817 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
IRF4Q15306 NAT1-201ENST00000307719 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
IRF4Q15306 GNG2-212ENST00000556752 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
IRF4Q15306 SETDB2-205ENST00000611815 5313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
IRF4Q15306 NBPF14-211ENST00000621070 2701 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
IRF4Q15306 ZNF440-201ENST00000304060 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
IRF4Q15306 OR2AT4-204ENST00000641593 8733 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
IRF4Q15306 RMDN2-201ENST00000234195 1985 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
IRF4Q15306 UNC5C-205ENST00000610318 9403 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
IRF4Q15306 LINC01422-201ENST00000434868 6043 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
IRF4Q15306 KLHL5-202ENST00000261426 3300 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
IRF4Q15306 AASDH-203ENST00000502617 3004 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
IRF4Q15306 MRPS36-201ENST00000256441 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
IRF4Q15306 USMG5-201ENST00000309579 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
IRF4Q15306 OR2G3-201ENST00000320002 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
IRF4Q15306 WFDC11-202ENST00000356562 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
IRF4Q15306 AL626787.1-201ENST00000366136 594 ntTSL 4 BASIC5.82□□□□□ -1.48
IRF4Q15306 AL360271.1-201ENST00000395679 510 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
IRF4Q15306 RN7SKP206-201ENST00000410823 293 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
IRF4Q15306 AC011754.1-201ENST00000415201 491 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
IRF4Q15306 CA1-201ENST00000431316 1232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
IRF4Q15306 LINC01798-204ENST00000433396 682 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
IRF4Q15306 PFN1P6-201ENST00000476786 399 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
IRF4Q15306 AC245041.2-201ENST00000479781 376 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
IRF4Q15306 RPL38P3-201ENST00000484463 213 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
IRF4Q15306 CYCSP22-201ENST00000517555 339 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
IRF4Q15306 LINC02055-205ENST00000521090 774 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
IRF4Q15306 OR5D2P-201ENST00000524390 911 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
IRF4Q15306 LDHC-203ENST00000535809 757 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
IRF4Q15306 MYL6-213ENST00000549017 502 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
IRF4Q15306 PINLYP-205ENST00000569031 557 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
IRF4Q15306 U95743.1-201ENST00000573369 1001 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
IRF4Q15306 AP001496.3-201ENST00000580230 913 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
IRF4Q15306 AC119868.1-202ENST00000584741 347 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
IRF4Q15306 AC011990.1-201ENST00000592809 734 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
IRF4Q15306 AC020909.2-201ENST00000595005 626 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
IRF4Q15306 RN7SL787P-201ENST00000613000 284 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
IRF4Q15306 AL589745.2-201ENST00000616366 555 ntTSL 4 BASIC5.82□□□□□ -1.48
IRF4Q15306 RSU1P2-204ENST00000619977 1240 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
IRF4Q15306 FP236241.1-206ENST00000625005 987 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
IRF4Q15306 MIR193BHG-214ENST00000641765 509 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
IRF4Q15306 AFM-201ENST00000226355 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
IRF4Q15306 AL080276.2-201ENST00000637995 2090 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
IRF4Q15306 CRNDE-212ENST00000613942 2601 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.6 ms