Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 AC016911.1-201ENST00000613297 452 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 AF117829.2-201ENST00000619538 361 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 AC103703.1-201ENST00000634783 663 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 SNW1-204ENST00000554775 1687 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 IL1R1-202ENST00000409329 1862 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 CTDSPL2-204ENST00000558966 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 ANKS1B-216ENST00000549558 2268 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 TLR5-205ENST00000540964 4088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 AP001541.1-201ENST00000623322 1904 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 IQCM-205ENST00000636414 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 NLN-202ENST00000502464 8354 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 NAT1-209ENST00000541942 1948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 GPM6A-201ENST00000280187 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 PSMA3-201ENST00000216455 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 GSTA5-201ENST00000284562 845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 OR8U1-201ENST00000302270 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 OR5M3-201ENST00000312240 1051 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 Y_RNA.62-201ENST00000362840 99 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 AL096711.1-201ENST00000404780 554 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 TOMM7-203ENST00000405021 455 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 AC005529.1-201ENST00000411969 289 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 AL096829.1-201ENST00000413677 457 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 MTATP6P19-201ENST00000413797 659 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 AL583854.1-201ENST00000438818 613 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 AC104457.2-201ENST00000446055 467 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 AC005077.1-201ENST00000449226 375 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 PDCD10-207ENST00000471885 764 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 UBFD1P1-201ENST00000473259 814 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 AC135999.1-201ENST00000478962 479 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 RN7SL193P-201ENST00000491708 276 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 AC091979.1-201ENST00000517595 706 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 AP003469.1-202ENST00000521884 478 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 AP005639.1-201ENST00000526939 192 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 VEPH1-219ENST00000537559 992 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 LINC02454-201ENST00000539116 589 ntTSL 4 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 AC026471.4-201ENST00000569291 449 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 STARD6-202ENST00000577499 696 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 RNU4ATAC-201ENST00000580972 127 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 AL645933.2-201ENST00000606743 1207 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 LINC00484-208ENST00000609752 591 ntTSL 4 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 AL031658.2-201ENST00000616850 651 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 AL161457.2-201ENST00000629181 630 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 DST-205ENST00000370765 8999 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 LGALSL-202ENST00000409537 3298 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 HMMR-204ENST00000432118 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 CCDC190-202ENST00000367911 1395 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 Z95114.1-201ENST00000624264 14574 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 MGAM2-201ENST00000477922 7867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 AL513548.1-201ENST00000562904 1724 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 OR2H1-201ENST00000377132 2253 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 LINC00616-205ENST00000514600 2017 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 NRG3-202ENST00000372142 3136 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 ABI2-204ENST00000295851 22209 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 IPO8-209ENST00000544829 3212 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 CD84-201ENST00000311224 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 OR4K5-201ENST00000315915 1078 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 LINC00626-201ENST00000420691 955 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 BX323845.3-201ENST00000428215 527 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 NDUFS5P5-201ENST00000437256 321 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 AL137186.1-201ENST00000440436 480 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 AC073594.1-201ENST00000462065 364 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 PDC-202ENST00000497198 1174 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 RNU6-362P-201ENST00000516736 90 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 RNA5SP400-201ENST00000517155 111 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 AP000424.2-201ENST00000523784 233 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 GTF2IP11-201ENST00000526931 420 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 LINC02552-203ENST00000545630 583 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 OTX2-203ENST00000554559 715 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 THCAT158-201ENST00000575039 535 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 PSMG2-204ENST00000585331 983 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 AC090236.2-201ENST00000587933 1101 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 VN1R81P-201ENST00000602085 372 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 LINC01320-205ENST00000604250 857 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 AL445465.1-206ENST00000609544 528 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 SSX4B-202ENST00000619890 1092 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 SSX4-202ENST00000620320 1092 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 AL137067.2-201ENST00000621202 131 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 5S_rRNA.28-201ENST00000638107 119 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 PMFBP1-207ENST00000537465 3935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 ADAM20-201ENST00000256389 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 IL1RAP-205ENST00000412504 4875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 ZNF81-202ENST00000338637 7859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 AC109811.1-201ENST00000512833 2807 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 SSX5-201ENST00000311798 1384 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 MAPKAPK5P1-201ENST00000431810 1376 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 EEF1A1P24-201ENST00000451469 1378 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 BLOC1S2-205ENST00000614731 2634 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 NLGN1-202ENST00000401917 1827 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 METTL9-211ENST00000615720 2890 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 CDC42SE2-201ENST00000360515 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 SNW1-205ENST00000555761 1855 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 LGI1-212ENST00000630184 2936 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 PARD3B-214ENST00000622699 7442 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 ZNF735-201ENST00000429565 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 AC011369.2-201ENST00000624423 1567 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 KIF27-202ENST00000334204 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 ZNF28-201ENST00000339844 650 ntTSL 4 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 RPS24-201ENST00000360830 514 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 TRGV10-201ENST00000390341 512 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CHAF1AQ13111 AL096800.1-201ENST00000405326 893 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
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