Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 AC013262.1-201ENST00000426710 252 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 LCE6A-201ENST00000431011 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 MTND2P5-201ENST00000432656 1006 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 LINC01291-203ENST00000435984 565 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 RPS10P18-201ENST00000442662 495 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 HMGN1P2-201ENST00000445197 310 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 MAGI2-AS3-210ENST00000448636 798 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 AC074286.1-201ENST00000452002 544 ntTSL 4 BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 USP9YP10-201ENST00000454868 628 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 CABYRP1-201ENST00000465493 1045 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 RN7SL643P-201ENST00000471845 291 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 RPL12P31-201ENST00000478433 450 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 LINC02224-201ENST00000505706 584 ntTSL 4 BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 AC096754.1-201ENST00000508904 818 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 AC108157.1-201ENST00000510511 539 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 OR51A1P-201ENST00000511110 946 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 USP9YP5-201ENST00000511770 630 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 AC012613.1-201ENST00000522685 387 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 AC105180.1-201ENST00000523317 426 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 OR5M11-201ENST00000528616 1020 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 AC036111.2-201ENST00000533247 901 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 AC073862.1-201ENST00000537998 409 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 AL133481.2-201ENST00000538322 367 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 LINC02406-201ENST00000553029 546 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 AL132857.1-201ENST00000555180 708 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 AC244502.3-201ENST00000555460 457 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 LINC01146-208ENST00000557355 548 ntTSL 4 BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 CAPN3-210ENST00000561817 915 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 LINC00254-201ENST00000563416 662 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 GS1-279B7.1-203ENST00000565520 609 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 NDUFA5P11-201ENST00000567995 343 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 PWRN1-210ENST00000568045 1299 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 LINC02520-201ENST00000570443 537 ntTSL 4 BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 AP001011.1-201ENST00000583546 690 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 APOC2-203ENST00000590360 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 AC005332.4-201ENST00000592752 579 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 PCNAP1-202ENST00000595299 752 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 AC008537.2-201ENST00000596135 482 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 AC010620.1-201ENST00000601088 1102 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 AC002487.1-201ENST00000604565 994 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 AL133507.1-201ENST00000605269 557 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 AC004241.3-201ENST00000611728 517 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 MIR6861-201ENST00000618657 64 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 AC068792.1-201ENST00000621354 417 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 CCL4-203ENST00000621626 552 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 AC011330.2-201ENST00000621680 635 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 AC244517.5-201ENST00000624139 722 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 AL136359.1-201ENST00000625090 565 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 AC099329.1-203ENST00000629885 767 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 SATB1-AS1-269ENST00000630766 591 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 AC092574.2-201ENST00000631198 753 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 LINC00254-202ENST00000633813 439 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 PRKCH-228ENST00000640011 285 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 AC132825.8-201ENST00000640783 297 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 GOLT1B-201ENST00000229314 3227 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 SCARB2-207ENST00000638295 4507 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 AC008040.1-202ENST00000483289 6251 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 AC107067.1-201ENST00000500009 1654 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 NIN-217ENST00000530997 8368 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 AC104162.1-201ENST00000430831 2382 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 PRRC1-202ENST00000442138 5504 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 ERG-202ENST00000398897 4651 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 CASC18-202ENST00000548557 2503 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 MGAM-202ENST00000475668 9172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 RRH-201ENST00000317735 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 LGALS8-220ENST00000526634 1852 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 SPEF2-202ENST00000356031 5681 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 EVI2A-202ENST00000461237 1540 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 OR7D4-203ENST00000641669 4965 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 FOCAD-201ENST00000338382 5765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 AC090673.1-202ENST00000356215 4617 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 CCRL2-201ENST00000357392 1593 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 PBRM1-202ENST00000337303 4825 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 PTK2-201ENST00000340930 4414 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 ZNF836-201ENST00000322146 2811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 SLC14A1-208ENST00000586142 2846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 CLRN1-AS1-201ENST00000465576 2045 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 HSPD1P14-201ENST00000432666 1618 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 AC100858.3-201ENST00000533516 1605 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 GPR89A-213ENST00000534502 1644 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 ALB-220ENST00000621628 1606 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 TAOK1-202ENST00000536202 4068 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 HIST1H1T-201ENST00000338379 718 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 SNORD115-48-201ENST00000364764 76 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 ATP5F1P2-201ENST00000398143 760 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 SMARCE1P6-201ENST00000398372 1216 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 PPP1R7-203ENST00000401987 820 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 RNU6-648P-201ENST00000410190 107 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 AL359636.2-201ENST00000412262 259 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 AC064871.1-202ENST00000413954 382 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 AC009518.1-202ENST00000415393 1229 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 LINC01717-201ENST00000415754 527 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 AC004543.1-201ENST00000418764 369 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 TCEA1P2-201ENST00000420496 906 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 MTCYBP12-201ENST00000440559 1134 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 AC093422.2-201ENST00000452599 686 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 AL133351.3-201ENST00000454998 193 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 VN1R40P-201ENST00000455196 941 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 LINC01072-201ENST00000455848 431 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 LINC01487-202ENST00000490497 423 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
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