Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 SCN2A-202ENST00000375427 8553 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
ACADSBP45954 KIAA2012-204ENST00000498697 3772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.41
ACADSBP45954 LRRK2-201ENST00000298910 9158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
ACADSBP45954 NLN-202ENST00000502464 8354 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.41
ACADSBP45954 BDNF-205ENST00000395981 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
ACADSBP45954 GLIPR1L2-202ENST00000378692 1903 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
ACADSBP45954 SETD2-202ENST00000409792 8142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.41
ACADSBP45954 WDR72-203ENST00000557913 5900 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.41
ACADSBP45954 CRNDE-212ENST00000613942 2601 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.41
ACADSBP45954 AC139426.3-201ENST00000605648 2059 ntBASIC6.21□□□□□ -1.41
ACADSBP45954 MTRNR2L3-201ENST00000543500 1539 ntAPPRIS P1 BASIC6.21□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 PRLR-201ENST00000231423 1679 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 FGG-201ENST00000336098 1659 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 CD84-208ENST00000534968 7885 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 TMEM133-201ENST00000303130 1953 ntAPPRIS P1 BASIC6.21□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 PRSS37-201ENST00000350549 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 RNA5SP273-201ENST00000362484 113 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 RNA5SP477-201ENST00000362639 119 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 TYRP1-201ENST00000381136 872 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 FO393401.1-203ENST00000416260 486 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 ODF2-AS1-201ENST00000420801 407 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 RPS3AP38-201ENST00000435889 763 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 UBE2L5P-201ENST00000436446 465 ntAPPRIS P1 BASIC6.21□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 CYCSP51-201ENST00000443545 318 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 MIS18A-AS1-201ENST00000453549 769 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 RNU1-88P-201ENST00000459274 128 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 AC079080.1-201ENST00000479841 822 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 LYRM4-208ENST00000500576 592 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 TOMM22P4-201ENST00000511318 336 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 NPM1P21-201ENST00000513394 762 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 OR5H7P-201ENST00000514084 930 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 AC096577.1-202ENST00000515649 448 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 snoU109.5-201ENST00000516231 132 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 AC097173.2-201ENST00000518701 474 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 AP000424.2-201ENST00000523784 233 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 PCNAP4-201ENST00000532690 730 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 ASB8-203ENST00000535988 679 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 GARSP1-201ENST00000570895 719 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 TXNP4-201ENST00000575018 310 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 AP001011.1-201ENST00000583546 690 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 AL589935.1-223ENST00000587015 808 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 LINC01206-233ENST00000630063 878 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 UBA3-213ENST00000631029 123 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 AC002429.2-202ENST00000637269 394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 VCAN-203ENST00000343200 9455 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 ZNF415-203ENST00000500065 2496 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC6.21□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 GTF2H5-201ENST00000607778 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 C6orf163-202ENST00000388923 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 UNC5C-205ENST00000610318 9403 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 PTPRR-204ENST00000440835 2818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 SLC7A11-201ENST00000280612 9645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 DDAH1-204ENST00000535924 3909 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 KCNAB1-205ENST00000471742 3301 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 RXFP1-203ENST00000343542 2130 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 C17orf78-203ENST00000611038 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 TNFSF11-202ENST00000358545 1520 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 AC005261.6-201ENST00000623072 1387 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 PCLO-201ENST00000333891 20329 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 LINC02397-201ENST00000504409 10626 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 FRMD6-205ENST00000554167 4176 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 ZFYVE16-206ENST00000510158 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 GKN1-201ENST00000377938 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 AL139008.2-201ENST00000420315 395 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 DEFA9P-201ENST00000433042 285 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 AC023141.8-201ENST00000442554 208 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 CASP5-205ENST00000444749 1237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 GAS5-218ENST00000448718 565 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 RPL38P3-201ENST00000484463 213 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 RN7SL57P-201ENST00000493687 290 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 AC011396.3-201ENST00000508845 512 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 AC010181.1-202ENST00000509191 798 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 Y_RNA.667-201ENST00000516212 107 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 RNA5SP438-201ENST00000516561 112 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 MIR2117-201ENST00000516780 80 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 AC060775.1-201ENST00000518241 520 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 WASHC5-AS1-201ENST00000519140 587 ntTSL 4 BASIC6.2□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 CETN3-206ENST00000522864 738 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 TRIM77BP-201ENST00000524985 1119 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 AC010768.4-201ENST00000528183 520 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 CASP5-209ENST00000531367 879 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 AL121594.2-201ENST00000541658 472 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 OTX2-203ENST00000554559 715 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 AL356801.1-201ENST00000559320 294 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 AL163952.1-202ENST00000569625 600 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 OOSP1P2-201ENST00000579644 351 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 AC091151.1-201ENST00000587369 726 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 AC098617.1-205ENST00000595918 1032 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 AC003682.1-201ENST00000599190 462 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 AL138895.2-201ENST00000603019 178 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 AC067773.1-201ENST00000603284 1094 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 AL137789.1-204ENST00000623503 666 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 OR2A7-202ENST00000641841 2062 ntAPPRIS P1 BASIC6.2□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 CTAGE5-217ENST00000557038 2869 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 AQP4-201ENST00000383168 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 GABRA2-206ENST00000507460 5812 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 HEATR1-203ENST00000366582 8447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 TRIM51-201ENST00000244891 1329 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 SLC9B1P1-201ENST00000331172 1337 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 EEF1A1P21-201ENST00000512363 1344 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 C4orf36-203ENST00000473559 2306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.2 ms