Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 AP4S1-212ENST00000622409 4113 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
TMPOP42166 AC011933.2-201ENST00000578539 2790 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
TMPOP42166 AL139805.2-201ENST00000455305 2433 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
TMPOP42166 ZFX-202ENST00000338565 2906 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
TMPOP42166 HUWE1-203ENST00000342160 14796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
TMPOP42166 NOL4-202ENST00000535384 1853 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
TMPOP42166 OR5B12-201ENST00000302572 1054 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
TMPOP42166 RNA5SP46-201ENST00000362370 120 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
TMPOP42166 RN7SKP279-201ENST00000411383 298 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
TMPOP42166 LINC01203-201ENST00000419566 580 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
TMPOP42166 AL158817.1-201ENST00000422310 933 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
TMPOP42166 PQLC2L-202ENST00000426338 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
TMPOP42166 AC002504.1-201ENST00000438281 691 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
TMPOP42166 SETP4-201ENST00000455717 868 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
TMPOP42166 NDUFB2-210ENST00000475276 539 ntTSL 4 BASIC7.5□□□□□ -1.21
TMPOP42166 EFCAB10-203ENST00000480514 740 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
TMPOP42166 IGLVIV-64-201ENST00000518581 301 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
TMPOP42166 OR4A6P-201ENST00000534364 970 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
TMPOP42166 DCN-210ENST00000547568 823 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
TMPOP42166 OR52B4-201ENST00000624801 1124 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
TMPOP42166 AC009234.1-201ENST00000634985 895 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
TMPOP42166 ZC3H12C-202ENST00000453089 9542 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
TMPOP42166 CTBS-202ENST00000370630 6600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
TMPOP42166 DCN-218ENST00000551354 2924 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
TMPOP42166 TMPRSS15-201ENST00000284885 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
TMPOP42166 PCA3-201ENST00000412654 3922 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
TMPOP42166 ZNF24-201ENST00000261332 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
TMPOP42166 GPR85-202ENST00000424100 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
TMPOP42166 CEACAMP10-201ENST00000489959 1721 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
TMPOP42166 NLGN4X-202ENST00000381092 3750 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
TMPOP42166 NOX4-211ENST00000528341 1899 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
TMPOP42166 TERB1-203ENST00000558713 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
TMPOP42166 RPL23AP82-206ENST00000480246 2987 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
TMPOP42166 LINC02097-201ENST00000419257 2063 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
TMPOP42166 RPL39P5-201ENST00000273411 449 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
TMPOP42166 RN7SKP69-201ENST00000365390 305 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
TMPOP42166 G6PC2-202ENST00000375363 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
TMPOP42166 AL139095.4-201ENST00000379928 500 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
TMPOP42166 SMARCA2-207ENST00000382186 955 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
TMPOP42166 RPL12P16-201ENST00000431098 498 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
TMPOP42166 AC003991.1-210ENST00000434733 1048 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
TMPOP42166 AC015923.1-201ENST00000435892 305 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
TMPOP42166 KRT8P51-201ENST00000438938 274 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
TMPOP42166 EEF1B2P6-201ENST00000445713 673 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
TMPOP42166 OARD1-207ENST00000468811 819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
TMPOP42166 SYPL1-205ENST00000470347 1193 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
TMPOP42166 AC074087.1-201ENST00000512059 724 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
TMPOP42166 IGLV3-24-201ENST00000517477 197 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
TMPOP42166 AL357153.4-201ENST00000620487 1016 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
TMPOP42166 PCDH18-201ENST00000344876 5906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
TMPOP42166 OR8G5-203ENST00000641992 1560 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
TMPOP42166 PCNX4-201ENST00000317623 17339 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
TMPOP42166 GPR87-201ENST00000260843 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
TMPOP42166 GDNF-AS1-202ENST00000510986 1941 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
TMPOP42166 ICE2-201ENST00000261520 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
TMPOP42166 SEC31A-226ENST00000508479 3397 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
TMPOP42166 ZEB1-201ENST00000320985 5423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
TMPOP42166 ATXN2-215ENST00000542287 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
TMPOP42166 DNAL1-202ENST00000553645 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
TMPOP42166 EFNA5-206ENST00000611503 4933 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
TMPOP42166 AXDND1-201ENST00000367618 3642 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
TMPOP42166 LAMTOR3-202ENST00000499666 4226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
TMPOP42166 UPF2-201ENST00000356352 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
TMPOP42166 AGBL4-201ENST00000334103 881 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
TMPOP42166 RN7SKP81-201ENST00000365603 331 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
TMPOP42166 HEATR1-201ENST00000366579 793 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
TMPOP42166 AL512422.1-201ENST00000407033 553 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
TMPOP42166 SDHDP6-201ENST00000414693 480 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
TMPOP42166 AP000221.1-201ENST00000419694 1046 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
TMPOP42166 VN1R21P-201ENST00000426703 765 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
TMPOP42166 AC117944.1-201ENST00000430748 641 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
TMPOP42166 Z84478.1-201ENST00000438230 1219 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
TMPOP42166 AP001604.1-201ENST00000447384 954 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
TMPOP42166 RPS23P2-201ENST00000463671 415 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
TMPOP42166 AC093001.1-201ENST00000489011 551 ntTSL 4 BASIC7.48□□□□□ -1.21
TMPOP42166 RN7SL101P-201ENST00000496350 279 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
TMPOP42166 AC104109.1-201ENST00000498563 436 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
TMPOP42166 AC094108.1-201ENST00000502494 527 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
TMPOP42166 AC011124.1-204ENST00000522265 562 ntTSL 4 BASIC7.48□□□□□ -1.21
TMPOP42166 AC112191.2-201ENST00000522428 333 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
TMPOP42166 AC103855.3-201ENST00000528445 606 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
TMPOP42166 AC078820.1-201ENST00000548702 742 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
TMPOP42166 AC016257.1-201ENST00000550088 641 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
TMPOP42166 CASC22-201ENST00000569713 386 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
TMPOP42166 MMP12-201ENST00000571244 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
TMPOP42166 AC007431.2-201ENST00000577189 563 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
TMPOP42166 PIK3C3-207ENST00000587402 452 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
TMPOP42166 HIRAP1-201ENST00000605318 787 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
TMPOP42166 LINC02343-201ENST00000605909 573 ntTSL 4 BASIC7.48□□□□□ -1.21
TMPOP42166 CU639417.4-201ENST00000623928 207 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
TMPOP42166 AL592430.2-201ENST00000633779 486 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
TMPOP42166 PEAK1-202ENST00000558305 4644 ntTSL 4 BASIC7.48□□□□□ -1.21
TMPOP42166 LINC02421-201ENST00000542219 3135 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
TMPOP42166 DLG1-213ENST00000443183 2516 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
TMPOP42166 LINC02019-201ENST00000608605 2060 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
TMPOP42166 MBNL1-204ENST00000324210 5465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
TMPOP42166 AC073365.1-203ENST00000641055 1992 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
TMPOP42166 UQCC1-208ENST00000397554 3638 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
TMPOP42166 DNHD1-212ENST00000527990 14298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
TMPOP42166 PSG7-201ENST00000406070 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
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