Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

Predictions only

Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 AL391358.1-201ENST00000605342 190 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 NANOGP3-201ENST00000605855 286 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 CSNK1A1-210ENST00000606719 835 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 AC092653.1-201ENST00000608509 531 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 SECISBP2L-201ENST00000261847 6779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 DOCK11-201ENST00000276202 6625 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 GRB10-204ENST00000398812 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 NXF3-201ENST00000395065 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 ADAM29-213ENST00000615367 3386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 MEMO1-202ENST00000379383 1498 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 THOC5-216ENST00000490103 4753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 BEND3-201ENST00000369042 6200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 AC009831.5-201ENST00000624000 3189 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 SIPA1L2-203ENST00000366630 6690 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 CD109-202ENST00000422508 9221 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 ZNF969P-201ENST00000510345 2341 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 BCORL1-201ENST00000218147 6860 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 HNMT-203ENST00000329366 835 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 MRRF-207ENST00000373729 870 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 SIRPD-201ENST00000381621 823 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 SNORA11.2-201ENST00000408318 127 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 SMIM2-IT1-201ENST00000415082 478 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 AC244035.2-201ENST00000425896 630 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 snoU13.20-201ENST00000459180 104 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 AC073288.1-201ENST00000466291 469 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 AC097484.1-201ENST00000471148 389 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 TATDN1-202ENST00000517678 815 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 NSMCE2-206ENST00000519010 848 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 TATDN1-206ENST00000519548 889 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 IGHV1-14-201ENST00000523391 241 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
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PKHD1P08F94 C11orf74-210ENST00000534635 801 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 UBE2FP2-201ENST00000566646 462 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 AC046158.2-201ENST00000568764 707 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 MIR4715-201ENST00000584117 79 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 AC060766.1-201ENST00000590824 627 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 AC105265.3-202ENST00000610188 459 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 CCL14-203ENST00000620991 426 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 LINC00706-201ENST00000628989 699 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 TATDN1-221ENST00000630259 915 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 PINCR-201ENST00000440955 2228 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 CEP350-202ENST00000367607 13491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 PHACTR4-201ENST00000373836 3107 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 NRDC-213ENST00000539524 3417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 OTX2-AS1-201ENST00000534909 2428 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 KLHL5-203ENST00000381930 3288 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 AC104162.1-201ENST00000430831 2382 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 USP9YP3-201ENST00000434481 1766 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 ACOT11-202ENST00000371316 6369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 AJ009632.2-208ENST00000635525 4123 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
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PKHD1P08F94 USP24-201ENST00000294383 10549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
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PKHD1P08F94 MYO7B-202ENST00000409816 6694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 DEFB1-201ENST00000297439 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 TEX41-205ENST00000431734 529 ntTSL 4 BASIC3.49□□□□□ -1.85
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PKHD1P08F94 AP004607.3-201ENST00000530354 3915 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
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PKHD1P08F94 RASGRP3-203ENST00000407811 4210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
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PKHD1P08F94 SLC25A16-207ENST00000609923 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
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PKHD1P08F94 ZNF724-201ENST00000418100 2764 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
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PKHD1P08F94 AL359538.1-201ENST00000453498 1710 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 LINC00550-201ENST00000629293 3434 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 SNORA70.4-201ENST00000365509 134 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 DBIP1-201ENST00000401435 260 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 LINC01820-201ENST00000418415 570 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 DDX39BP1-205ENST00000422507 192 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 AC079760.2-201ENST00000449361 681 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 RPL23AP40-201ENST00000487630 390 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 AC004052.1-201ENST00000514327 567 ntTSL 4 BASIC3.49□□□□□ -1.85
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PKHD1P08F94 SAMD15-202ENST00000533095 412 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 LINC01633-201ENST00000566476 1091 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 CUZD1-205ENST00000368904 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 VPS39-202ENST00000348544 2661 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 IL5RA-204ENST00000418488 5521 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 NLRC5-203ENST00000436936 6724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 FOXN2-203ENST00000616844 1414 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 ROBO2-202ENST00000461745 8946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 MAPK10-366ENST00000641903 2812 ntAPPRIS ALT1 BASIC3.49□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 NOTCH2-201ENST00000256646 11389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 PAK3-201ENST00000262836 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 PAK3-205ENST00000417227 2196 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
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