Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 NCOA4P3-201ENST00000513203 1877 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SGCZQ96LD1 CFAP57-208ENST00000610710 4162 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SGCZQ96LD1 AC107884.1-202ENST00000622955 2703 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SGCZQ96LD1 NAT1-208ENST00000520546 1446 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SGCZQ96LD1 IL5RA-207ENST00000438560 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SGCZQ96LD1 HELLS-205ENST00000394036 3131 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
SGCZQ96LD1 MGC4859-201ENST00000634803 3118 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
SGCZQ96LD1 HBG1-201ENST00000330597 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
SGCZQ96LD1 DEFB128-201ENST00000334391 373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
SGCZQ96LD1 CLEC4A-204ENST00000360500 597 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SGCZQ96LD1 RN7SKP250-201ENST00000363924 321 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SGCZQ96LD1 RNA5SP485-201ENST00000365053 119 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SGCZQ96LD1 RNU6-354P-201ENST00000383862 107 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SGCZQ96LD1 RNU6-610P-201ENST00000384264 107 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SGCZQ96LD1 RNU6-452P-201ENST00000384406 107 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SGCZQ96LD1 RPS27AP11-201ENST00000402798 447 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SGCZQ96LD1 HMGB3P19-201ENST00000403971 560 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SGCZQ96LD1 AL355615.1-201ENST00000406187 641 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SGCZQ96LD1 RN7SKP129-201ENST00000410288 299 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SGCZQ96LD1 RN7SKP221-201ENST00000410420 301 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SGCZQ96LD1 AC009518.1-202ENST00000415393 1229 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SGCZQ96LD1 GNRHR-202ENST00000420975 859 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
SGCZQ96LD1 NFIA-AS2-202ENST00000421455 768 ntTSL 4 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SGCZQ96LD1 HSFY1P1-201ENST00000423928 1178 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SGCZQ96LD1 AC244394.2-201ENST00000425109 735 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SGCZQ96LD1 AC013262.1-201ENST00000426710 252 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SGCZQ96LD1 PRKG1-AS1-202ENST00000426785 1111 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
SGCZQ96LD1 AL158832.1-201ENST00000429661 406 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SGCZQ96LD1 PIK3IP1-AS1-201ENST00000440456 554 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SGCZQ96LD1 C1orf143-201ENST00000443836 762 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SGCZQ96LD1 L29074.1-201ENST00000456072 534 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SGCZQ96LD1 CBX1P5-201ENST00000475330 559 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SGCZQ96LD1 CREM-242ENST00000490511 469 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SGCZQ96LD1 AC139718.2-201ENST00000506068 481 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SGCZQ96LD1 AC021192.1-201ENST00000510169 791 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SGCZQ96LD1 AC138701.1-201ENST00000524329 714 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SGCZQ96LD1 AP003033.2-201ENST00000528901 805 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SGCZQ96LD1 PRH1-204ENST00000539853 837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SGCZQ96LD1 AP002373.2-201ENST00000541631 1060 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SGCZQ96LD1 AC078880.1-201ENST00000546696 553 ntTSL 4 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SGCZQ96LD1 LINC02448-201ENST00000548613 583 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SGCZQ96LD1 AC009387.1-201ENST00000549163 441 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SGCZQ96LD1 LINC02416-201ENST00000550019 540 ntTSL 4 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SGCZQ96LD1 AL161757.3-201ENST00000555316 807 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SGCZQ96LD1 AC099511.1-201ENST00000564561 590 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SGCZQ96LD1 THCAT158-201ENST00000575039 535 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SGCZQ96LD1 SLC14A2-AS1-204ENST00000592899 359 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SGCZQ96LD1 AC007193.1-201ENST00000599645 448 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SGCZQ96LD1 AC004805.3-201ENST00000603178 310 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SGCZQ96LD1 AL356986.1-201ENST00000604085 341 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SGCZQ96LD1 AC011891.2-201ENST00000604949 397 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SGCZQ96LD1 AC019257.2-201ENST00000605539 497 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SGCZQ96LD1 IGKV2OR2-10-201ENST00000613976 311 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SGCZQ96LD1 AC005393.1-201ENST00000617916 584 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SGCZQ96LD1 AL354718.1-201ENST00000619764 589 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SGCZQ96LD1 AC009269.6-201ENST00000621778 588 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SGCZQ96LD1 AC089999.3-201ENST00000622440 577 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SGCZQ96LD1 AC018692.2-201ENST00000624130 348 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SGCZQ96LD1 AC083865.1-201ENST00000636634 831 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SGCZQ96LD1 AC097461.1-201ENST00000568928 2821 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SGCZQ96LD1 GIGYF2-246ENST00000629305 7878 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SGCZQ96LD1 TEX11-202ENST00000374320 2224 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SGCZQ96LD1 MBNL2-201ENST00000343600 4596 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
SGCZQ96LD1 TGIF1-211ENST00000548489 1536 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SGCZQ96LD1 PTK2-201ENST00000340930 4414 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SGCZQ96LD1 TNFAIP8-207ENST00000513374 1385 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SGCZQ96LD1 CSDE1-204ENST00000369530 3774 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
SGCZQ96LD1 CCDC186-203ENST00000369287 7245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.44
SGCZQ96LD1 ATP10D-201ENST00000273859 6655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 CDKL5-205ENST00000623535 12533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 TPTE2P2-202ENST00000605924 2113 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 MTRNR2L8-201ENST00000536684 1303 ntAPPRIS P1 BASIC6.02□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 MAPK10-365ENST00000641902 3825 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 LGALSL-202ENST00000409537 3298 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 ZNF711-202ENST00000360700 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 CYLD-210ENST00000566206 3104 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 GTF2IP4-201ENST00000453092 2054 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 AC005702.3-201ENST00000585345 1447 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 SLC25A12-202ENST00000422440 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 CMAHP-202ENST00000377993 1681 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 MFSD8-219ENST00000641228 2559 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 RACGAP1-221ENST00000551016 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 MSR1-202ENST00000350896 3572 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 OR1A1-201ENST00000304094 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.02□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 OR5T3-202ENST00000313033 969 ntAPPRIS P1 BASIC6.02□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 ARGFX-201ENST00000334384 992 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 SCGB1D4-201ENST00000358585 439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 SPP1-202ENST00000360804 1196 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 FIG4-202ENST00000368941 791 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 RNU6-185P-201ENST00000384421 107 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 PRELID1P1-201ENST00000403549 660 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 AC099535.1-201ENST00000408928 371 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 AL713922.1-201ENST00000416477 747 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 PVALB-204ENST00000417718 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 EIF4A1P1-201ENST00000420241 934 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 IGKV3OR2-268-201ENST00000421835 350 ntAPPRIS P1 BASIC6.02□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 AL139184.1-202ENST00000422303 222 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 AC005189.1-201ENST00000431286 310 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 RPSAP40-201ENST00000442343 891 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
SGCZQ96LD1 CCDC13-AS1-202ENST00000446950 554 ntTSL 4 BASIC6.02□□□□□ -1.45
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