Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 RN7SKP254-201ENST00000410685 310 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 AP001468.1-201ENST00000415026 557 ntTSL 4 BASIC7.23□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 AL449283.1-202ENST00000418249 604 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 OR51A6P-201ENST00000418680 1004 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 NAP1L4P2-201ENST00000425958 899 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 LINC01049-201ENST00000426840 742 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 AC099060.1-201ENST00000427806 448 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 DLEU1-AS1-201ENST00000428276 731 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 MIR181A2HG-201ENST00000429139 662 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 VDAC2P3-201ENST00000430995 828 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 USP9YP24-201ENST00000434374 697 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 AL590399.4-201ENST00000436561 601 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 AC010105.1-201ENST00000437290 385 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 LINC01802-201ENST00000438824 523 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 USP9YP17-201ENST00000444617 696 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 AL031668.1-201ENST00000451556 603 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 AC098826.2-201ENST00000452011 651 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 LINC01312-202ENST00000456347 813 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 ZBTB8OS-205ENST00000465588 548 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 RPL7P40-201ENST00000481703 745 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 RPL21P131-201ENST00000497298 483 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 SNHG27-202ENST00000507933 491 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 SNORA81.2-201ENST00000516868 170 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 LINC00589-202ENST00000518623 938 ntTSL 4 BASIC7.23□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 AP001007.2-201ENST00000525429 593 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 CPSF7-220ENST00000541963 549 ntTSL 4 BASIC7.23□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 LINC01489-201ENST00000542689 605 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 AC078860.1-201ENST00000546601 527 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 ELK3-206ENST00000552142 1242 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 UBE2CP4-201ENST00000561405 535 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 MED31-202ENST00000574128 619 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 AP006587.6-201ENST00000582128 1091 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 LINC01198-204ENST00000594153 552 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 AC108451.2-201ENST00000603875 538 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 AC109809.1-201ENST00000619665 545 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 RSU1P2-204ENST00000619977 1240 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 AC104985.3-201ENST00000623479 597 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 SAMMSON-209ENST00000641222 1100 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 ECI2-204ENST00000380125 1405 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 ZFAND6-213ENST00000559835 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 MFSD8-219ENST00000641228 2559 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 AC013562.1-201ENST00000519427 1722 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 WDR35-201ENST00000281405 6918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 UNC5C-205ENST00000610318 9403 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 ZNF410-211ENST00000555044 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 STN1-202ENST00000369764 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 ANO4-202ENST00000392979 3909 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 MEF2C-225ENST00000625585 3467 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 KCNAB1-205ENST00000471742 3301 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 NXPE4-202ENST00000424261 1687 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 SETX-201ENST00000224140 11100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 PTK2-201ENST00000340930 4414 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 KANTR-203ENST00000604062 4251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 EEF1A1P24-201ENST00000451469 1378 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 BANK1-206ENST00000504592 3544 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 MAGI2-222ENST00000636039 5671 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 TMPRSS11BNL-202ENST00000510782 3202 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 DDX10P2-201ENST00000417796 2614 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 MYPN-204ENST00000540630 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 ERG-202ENST00000398897 4651 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 ENTPD1-AS1-202ENST00000416301 4241 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 IGKV7-3-201ENST00000357453 298 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 RNA5SP188-201ENST00000362916 129 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 RN7SKP47-201ENST00000365347 328 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 RGS8-202ENST00000367556 843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 RN7SKP117-201ENST00000410175 264 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 AC116036.1-201ENST00000412199 367 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 OR51B3P-201ENST00000412287 913 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 LINC00362-201ENST00000414345 264 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 MTND4P3-201ENST00000417829 541 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 AL139415.1-201ENST00000424862 352 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 MTND2P5-201ENST00000432656 1006 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 AC105052.2-201ENST00000434317 794 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 AL035691.1-201ENST00000434562 595 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 ELOCP11-201ENST00000436690 332 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 CRYGGP-201ENST00000443337 145 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 AL353743.2-203ENST00000443630 492 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 ELOCP16-201ENST00000444494 332 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 AC092155.2-201ENST00000454675 477 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 LINC01789-202ENST00000455614 491 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 AC010409.2-201ENST00000505780 478 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 AC106798.1-202ENST00000506819 589 ntTSL 4 BASIC7.22□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 AC093752.1-206ENST00000511823 336 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 LINC01262-201ENST00000513681 879 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 RN7SKP265-201ENST00000516448 223 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 AC026407.1-201ENST00000518369 204 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 PMP2-202ENST00000519260 1264 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 AC090150.2-201ENST00000521869 815 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 AC013644.1-201ENST00000523724 555 ntTSL 4 BASIC7.22□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 IGLV3-6-201ENST00000523937 250 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 LINC01493-201ENST00000530102 460 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 AP002812.4-201ENST00000532139 286 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 AP003049.2-202ENST00000532929 803 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 AC005833.3-202ENST00000544741 770 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 AC013356.3-201ENST00000558601 584 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 AC022405.1-201ENST00000559841 516 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 AC099518.4-204ENST00000567047 380 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 EEF1B2P1-201ENST00000567221 672 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 AC007923.1-201ENST00000577970 505 ntTSL 4 BASIC7.22□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 AC090241.1-201ENST00000587732 621 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.5 ms