Protein–RNA interactions for Protein: Q8N205

SYNE4, Nesprin-4, humanhuman

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Length 404 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4Q8N205 GOLGA6L22-204ENST00000622895 4178 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
SYNE4Q8N205 C14orf105-201ENST00000216445 3082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
SYNE4Q8N205 AL121768.1-201ENST00000613917 2544 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
SYNE4Q8N205 ZNF343-207ENST00000612935 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
SYNE4Q8N205 CRB1-211ENST00000638467 4348 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
SYNE4Q8N205 OR5AN1-202ENST00000641850 8468 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
SYNE4Q8N205 AC061975.7-201ENST00000592016 2692 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
SYNE4Q8N205 UNC13B-210ENST00000636694 8012 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
SYNE4Q8N205 AC008957.3-201ENST00000624112 2242 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
SYNE4Q8N205 WNK3-201ENST00000354646 11341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
SYNE4Q8N205 KLHL5-205ENST00000508137 2926 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
SYNE4Q8N205 FCHSD2-201ENST00000311172 4340 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
SYNE4Q8N205 FOXJ3-209ENST00000545068 5165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
SYNE4Q8N205 CHRDL1-202ENST00000372045 3860 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
SYNE4Q8N205 MYOF-202ENST00000359263 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
SYNE4Q8N205 PDE6A-205ENST00000617647 4039 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
SYNE4Q8N205 ZNF146-201ENST00000443387 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
SYNE4Q8N205 USMG5-201ENST00000309579 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
SYNE4Q8N205 AGBL4-201ENST00000334103 881 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
SYNE4Q8N205 OR6K3-202ENST00000368146 996 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
SYNE4Q8N205 AC016739.1-201ENST00000405359 345 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
SYNE4Q8N205 RPS4XP5-201ENST00000419038 768 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
SYNE4Q8N205 HMGB3P24-201ENST00000433260 622 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
SYNE4Q8N205 LINC02528-202ENST00000434437 535 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
SYNE4Q8N205 CYCSP51-201ENST00000443545 318 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
SYNE4Q8N205 AL353804.1-201ENST00000444482 451 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
SYNE4Q8N205 EEF1B2P6-201ENST00000445713 673 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
SYNE4Q8N205 AL500527.1-201ENST00000448532 255 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
SYNE4Q8N205 AP000547.1-201ENST00000454360 617 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
SYNE4Q8N205 AL356272.1-201ENST00000454538 832 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
SYNE4Q8N205 AL022319.1-201ENST00000458183 1167 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
SYNE4Q8N205 MTND3P6-201ENST00000485242 339 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
SYNE4Q8N205 AC109481.1-201ENST00000509173 282 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
SYNE4Q8N205 RNU6-415P-201ENST00000516252 97 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
SYNE4Q8N205 AC025370.1-201ENST00000523775 583 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
SYNE4Q8N205 GTF2H1-208ENST00000526630 932 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
SYNE4Q8N205 AC134775.1-201ENST00000531268 464 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
SYNE4Q8N205 AP001893.1-201ENST00000532866 362 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
SYNE4Q8N205 AC027544.2-201ENST00000539313 630 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
SYNE4Q8N205 LINC00871-202ENST00000556071 554 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
SYNE4Q8N205 AL109954.2-201ENST00000611020 530 ntTSL 4 BASIC7.41□□□□□ -1.22
SYNE4Q8N205 AL391425.1-202ENST00000617518 774 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
SYNE4Q8N205 AC109780.1-201ENST00000451768 1344 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
SYNE4Q8N205 AC235565.1-201ENST00000456962 1325 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
SYNE4Q8N205 GON4L-204ENST00000437809 7713 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
SYNE4Q8N205 MTND5P12-201ENST00000502851 1449 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
SYNE4Q8N205 ECT2L-203ENST00000423192 4319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
SYNE4Q8N205 AL391261.1-201ENST00000555712 1479 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
SYNE4Q8N205 ZNF138-204ENST00000437743 2574 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
SYNE4Q8N205 AC093829.1-201ENST00000506662 1618 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
SYNE4Q8N205 SCAPER-203ENST00000538941 4853 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
SYNE4Q8N205 RIMS1-219ENST00000523963 3097 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
SYNE4Q8N205 AP1M1-201ENST00000291439 13193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
SYNE4Q8N205 GRIK1-201ENST00000327783 3179 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
SYNE4Q8N205 CNKSR3-205ENST00000607772 21063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
SYNE4Q8N205 PSG1-206ENST00000595356 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
SYNE4Q8N205 PIGN-247ENST00000640540 4720 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
SYNE4Q8N205 ATP1A1-203ENST00000369496 3572 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
SYNE4Q8N205 GPNMB-201ENST00000258733 2862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
SYNE4Q8N205 ADAM20P1-202ENST00000556964 3034 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
SYNE4Q8N205 MAPK10-261ENST00000641050 3109 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
SYNE4Q8N205 ENTPD1-AS1-212ENST00000458228 3274 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
SYNE4Q8N205 KLRC3-202ENST00000396439 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
SYNE4Q8N205 OR2AT2P-201ENST00000413438 905 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
SYNE4Q8N205 GSTM2-205ENST00000414179 982 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
SYNE4Q8N205 AC063965.1-201ENST00000416679 499 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
SYNE4Q8N205 BMS1P17-202ENST00000416720 316 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
SYNE4Q8N205 AC007562.1-201ENST00000421819 517 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
SYNE4Q8N205 AC007557.4-201ENST00000421907 430 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
SYNE4Q8N205 MAGI2-AS3-204ENST00000426835 738 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
SYNE4Q8N205 AC011742.2-201ENST00000443818 352 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
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SYNE4Q8N205 AL133445.1-201ENST00000467051 452 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
SYNE4Q8N205 AL157777.1-201ENST00000468100 304 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
SYNE4Q8N205 UBA52P7-201ENST00000486088 380 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
SYNE4Q8N205 AC092916.1-201ENST00000497896 411 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
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SYNE4Q8N205 UBE2D3-217ENST00000504211 578 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
SYNE4Q8N205 COL6A4P2-205ENST00000509855 506 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
SYNE4Q8N205 AC106744.2-201ENST00000513955 898 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
SYNE4Q8N205 SNORA43.3-201ENST00000517240 103 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
SYNE4Q8N205 AC091564.3-201ENST00000527398 429 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
SYNE4Q8N205 RERGL-203ENST00000538724 973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
SYNE4Q8N205 AC068775.2-201ENST00000539033 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
SYNE4Q8N205 AC100821.2-201ENST00000565668 440 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
SYNE4Q8N205 LYRM1-211ENST00000569023 769 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
SYNE4Q8N205 MTND1P8-201ENST00000571424 950 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
SYNE4Q8N205 TXNP4-201ENST00000575018 310 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
SYNE4Q8N205 AC018371.1-201ENST00000584560 640 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
SYNE4Q8N205 AC091151.1-201ENST00000587369 726 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
SYNE4Q8N205 GMFG-212ENST00000602185 423 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
SYNE4Q8N205 HCG18-243ENST00000602498 327 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
SYNE4Q8N205 AC015726.1-202ENST00000602532 475 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
SYNE4Q8N205 RN7SL544P-201ENST00000617232 284 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
SYNE4Q8N205 ATP13A5-205ENST00000620313 709 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
SYNE4Q8N205 RN7SL763P-201ENST00000620922 284 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
SYNE4Q8N205 AC092725.2-201ENST00000567658 1389 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
SYNE4Q8N205 DSC1-202ENST00000257198 4225 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
SYNE4Q8N205 PLEKHA5-202ENST00000424268 4391 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
SYNE4Q8N205 CDYL2-207ENST00000570137 8159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
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