Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 CU633906.1-201ENST00000621924 2380 ntTSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 ZMYM2-210ENST00000610343 10200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 SCP2-212ENST00000488965 3926 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 SOX6-208ENST00000527619 2699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 MORF4L2-206ENST00000433176 1965 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 ARCN1-202ENST00000359415 4038 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 AL353763.1-201ENST00000624467 1628 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 OPRM1-217ENST00000522236 2459 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 TYRP1-201ENST00000381136 872 ntTSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 SNORA40.4-201ENST00000390971 128 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 AL109941.1-201ENST00000401925 229 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 LYST-AS1-201ENST00000412098 521 ntTSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 VDAC1P2-201ENST00000423609 850 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 VDAC1P6-201ENST00000430062 855 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 OR52B5P-201ENST00000435337 951 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 AC245047.2-201ENST00000441060 530 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 KCNQ5-IT1-201ENST00000445310 563 ntTSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 MGAT2P1-201ENST00000449718 797 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 LDHBP2-201ENST00000456969 1005 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 AC117386.2-203ENST00000489690 557 ntTSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 KCTD9P6-201ENST00000522306 950 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 LINC02274-201ENST00000555539 1174 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 NOP10-202ENST00000557912 436 ntTSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 AC087477.5-202ENST00000560242 389 ntTSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 AC100821.2-201ENST00000565668 440 ntTSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 AC090079.2-201ENST00000575289 768 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 ARL2BPP3-202ENST00000580773 420 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 AC119403.2-201ENST00000590960 598 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 AL163952.1-201ENST00000612704 916 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 OR52B5P-202ENST00000641118 1110 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 AC008560.1-201ENST00000510585 1766 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 AC010894.3-202ENST00000412835 1405 ntTSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 MYO6-202ENST00000369977 5597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 CERS3-203ENST00000538112 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 ADA2-210ENST00000610390 4137 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 MED28-201ENST00000237380 10868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 KRT39-201ENST00000355612 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 SMAD5-211ENST00000545279 7012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 VANGL1-202ENST00000355485 8691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 LGALS8-222ENST00000527974 1349 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 PTK2-201ENST00000340930 4414 ntTSL 2 BASIC7.82□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 TMCO5A-205ENST00000559502 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.82□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 AL355306.2-206ENST00000635233 1903 ntTSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 GNG2-212ENST00000556752 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 UNC5D-201ENST00000287272 8662 ntTSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 PIH1D2-201ENST00000280350 1241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 ACSL5-203ENST00000356116 3353 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 RNA5SP319-201ENST00000362768 119 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 LEMD1-203ENST00000367152 741 ntTSL 2 BASIC7.82□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 DCDC2-201ENST00000378450 3684 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 TRBV24-1-201ENST00000390397 381 ntAPPRIS P1 BASIC7.82□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 RNU11-6P-201ENST00000391127 133 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 RN7SKP166-201ENST00000410812 305 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 GABARAPL3-201ENST00000412799 354 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 MTND4LP21-201ENST00000415303 295 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 RPS26P13-201ENST00000419030 330 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 RPS4XP5-201ENST00000419038 768 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 ITGA9-AS1-202ENST00000420870 581 ntTSL 4 BASIC7.82□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 AC008753.1-201ENST00000423096 284 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 SRSF1P1-201ENST00000424058 520 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 AL162727.2-201ENST00000428429 395 ntTSL 3 BASIC7.82□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 ITGA9-AS1-203ENST00000429532 702 ntTSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 PIH1D2-202ENST00000431456 1245 ntTSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
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VPS72Q15906 AL390879.2-204ENST00000438602 582 ntTSL 3 BASIC7.82□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 AC003685.1-201ENST00000440430 466 ntTSL 2 BASIC7.82□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 AL359091.1-201ENST00000449048 1734 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
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VPS72Q15906 RPS3AP15-201ENST00000483874 781 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 CASC8-203ENST00000502082 1420 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 GYPB-202ENST00000502664 521 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 SCARNA6.1-201ENST00000516989 238 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 AF117829.1-208ENST00000521996 915 ntTSL 3 BASIC7.82□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 CARD18-202ENST00000530950 652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
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VPS72Q15906 LINC01619-209ENST00000552277 571 ntTSL 4 BASIC7.82□□□□□ -1.16
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VPS72Q15906 LINC02129-201ENST00000564381 692 ntTSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 RBM22P12-201ENST00000567098 1255 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 AC145423.1-201ENST00000605712 336 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 AC012467.1-201ENST00000607740 256 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 CENPJ-206ENST00000616936 5020 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 NADK2-211ENST00000617628 744 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 AC112255.1-201ENST00000624070 2493 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 AL138960.2-201ENST00000625145 535 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 AC010328.1-201ENST00000596769 4060 ntTSL 2 BASIC7.82□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 NLRP8-201ENST00000291971 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 AF131216.1-201ENST00000498997 5856 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 HSFY1P1-202ENST00000425038 1381 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 PAK3-202ENST00000360648 2241 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 LINC01684-203ENST00000453784 2908 ntTSL 2 BASIC7.82□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 LGI1-212ENST00000630184 2936 ntTSL 2 BASIC7.82□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 MAPK6-201ENST00000261845 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 ABLIM1-207ENST00000392955 7408 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 ECT2-206ENST00000417960 4363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 IGF1-206ENST00000456098 7370 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 ERCC6L-202ENST00000373657 4344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.81□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 DHX32-201ENST00000284690 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
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