Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 MALAT1-209ENST00000616691 587 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 AL158163.2-201ENST00000619110 700 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 AC079906.1-201ENST00000621214 815 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 AL157770.1-201ENST00000623049 439 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 AC079248.2-201ENST00000623779 326 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 AC010608.2-201ENST00000624830 470 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 STOM-201ENST00000286713 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 PPP2R3A-202ENST00000334546 2196 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 C15orf41-202ENST00000437989 2240 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 BRD8-201ENST00000230901 3198 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 ADGRL3-209ENST00000508693 5009 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 LY75-201ENST00000263636 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 LRRC39-202ENST00000370137 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 MTND4P26-201ENST00000415971 1359 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 AC005154.1-228ENST00000454922 1405 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 HKR1-223ENST00000591471 3472 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 TMX2-202ENST00000378312 1521 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 TRIQK-201ENST00000378861 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 CDH13-201ENST00000268613 2722 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 NCOA4P2-201ENST00000340589 1813 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 RSC1A1-201ENST00000345034 1854 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 CXCR4-202ENST00000409817 1895 ntAPPRIS P3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 KCNH7-205ENST00000621889 1893 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 POF1B-202ENST00000373145 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 MORF4L2-206ENST00000433176 1965 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 BPIFC-203ENST00000397452 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 ASB4-202ENST00000325885 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 ARPP21-203ENST00000396482 2416 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 AC008555.1-201ENST00000561778 2757 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 PATJ-203ENST00000371158 8505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 GDA-209ENST00000545168 5362 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 CCL2-201ENST00000225831 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 OR4S2-201ENST00000312422 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 PDXDC1-201ENST00000325823 1113 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 RNU1-87P-201ENST00000363727 170 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 RNA5SP77-201ENST00000365394 120 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 FABP3-201ENST00000373713 725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 FABP12P1-201ENST00000401911 322 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 AL359715.1-201ENST00000404330 555 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 IGKV1OR2-3-201ENST00000411475 288 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 AC092687.1-201ENST00000418835 389 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 ELMO1-AS1-201ENST00000419535 528 ntTSL 4 BASIC7.4□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 RAC1P8-201ENST00000427086 527 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 AC097721.1-201ENST00000427150 1253 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 AC010153.1-201ENST00000432862 727 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 AL353706.1-201ENST00000436728 494 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 AC016644.1-201ENST00000438553 434 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 AC023512.1-201ENST00000444513 499 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 MTOR-AS1-202ENST00000445982 705 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 AL050341.1-201ENST00000447743 313 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 MTND2P19-201ENST00000449129 1012 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 AC092164.1-201ENST00000452212 726 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 MTCO2P18-201ENST00000457151 658 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 RN7SL177P-201ENST00000476596 299 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 PDCD10-214ENST00000487947 716 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 AC097512.1-203ENST00000506425 957 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 MTND5P13-201ENST00000513046 1079 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 AP003438.1-201ENST00000518704 435 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 PTK2-220ENST00000520151 573 ntTSL 4 BASIC7.4□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 TEX12-202ENST00000530752 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 SOX9-AS1-214ENST00000540802 578 ntTSL 4 BASIC7.4□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 LINC02402-201ENST00000550337 1212 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 AC005519.1-201ENST00000554490 601 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 AC127522.1-201ENST00000560531 751 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 AC016134.1-201ENST00000565259 701 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 NUDT7-206ENST00000568787 678 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 AC015853.3-201ENST00000570974 478 ntTSL 4 BASIC7.4□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 AC012146.1-201ENST00000571138 462 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 IGKV1OR2-9-201ENST00000603957 287 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 IGKV1OR2-11-201ENST00000604120 287 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 AC021749.1-201ENST00000604322 607 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 AC064872.1-201ENST00000604823 1072 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 AC013468.1-201ENST00000608680 598 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 TFG-209ENST00000615993 1244 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 OAZ3-211ENST00000639906 708 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 PPP2R5C-226ENST00000557095 1307 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 ANKS1B-207ENST00000546960 1383 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 ZNF521-203ENST00000538137 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 AC005702.3-201ENST00000585345 1447 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 CASC19-205ENST00000641013 1411 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 ALB-203ENST00000415165 1483 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 GPX5-201ENST00000412168 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 ANGPT1-205ENST00000520052 1523 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 GPC3-204ENST00000631057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 DNAJC5G-203ENST00000404433 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 AC093909.5-201ENST00000621839 1799 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 STON1-202ENST00000406226 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 DNAH10-210ENST00000638045 13678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 ANAPC5-204ENST00000441917 2147 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 FCGR3B-208ENST00000613418 2251 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 LINC02209-201ENST00000521245 2651 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 OR2AH1P-202ENST00000641232 2744 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 TNFSF15-201ENST00000374044 2789 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 SLC6A16-202ENST00000454748 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 PGAP1-201ENST00000354764 11114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 ANKRD17-203ENST00000509867 8105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 ZNF718-201ENST00000510175 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 TDRKH-201ENST00000368822 3093 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 MAPK10-347ENST00000641762 2856 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 AC009166.2-201ENST00000624410 2833 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
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