Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 PRSS37-201ENST00000350549 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 RN7SKP275-201ENST00000364626 301 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 RN7SKP78-201ENST00000364711 318 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 SUGT1P2-201ENST00000379452 992 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 YAF2-202ENST00000380790 1211 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 BPY2C-201ENST00000382287 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 BPY2B-201ENST00000382392 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 DNAJA1P3-201ENST00000399417 1194 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 ODF2-AS1-201ENST00000420801 407 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 CRIP1P1-201ENST00000427567 185 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 AC008063.2-201ENST00000432251 619 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 AC007283.1-201ENST00000434645 445 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 NDUFS5P5-201ENST00000437256 321 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 EIF5AP4-201ENST00000441206 465 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 AL353804.1-201ENST00000444482 451 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 GAS5-218ENST00000448718 565 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 AL359839.1-201ENST00000451975 1160 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 AC004129.2-201ENST00000457229 287 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 LINC02339-201ENST00000472649 752 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 AC117386.2-203ENST00000489690 557 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 AC008448.1-201ENST00000505109 584 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 AP000424.2-201ENST00000523784 233 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 OR5D2P-201ENST00000524390 911 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 BCAS2P1-201ENST00000528022 632 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 RERG-AS1-201ENST00000541243 337 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 DPPA3P2-202ENST00000557188 1219 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 RMDN2-AS1-203ENST00000601029 613 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 AC018690.1-201ENST00000608144 626 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 AL031658.2-201ENST00000616850 651 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 AC092683.1-207ENST00000620051 837 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 AC092574.2-201ENST00000631198 753 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 ZNF268-205ENST00000536435 13475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 ZNF160-203ENST00000429604 4336 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 AL136985.3-202ENST00000636386 2708 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 AC084816.1-210ENST00000540895 1920 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 AL603840.1-201ENST00000422374 4063 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 AC006600.2-201ENST00000624834 2506 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 LINC01152-201ENST00000472655 3578 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 GPR85-202ENST00000424100 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 AC130360.2-201ENST00000533477 1556 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 AC010099.4-201ENST00000424515 1453 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 FRMD6-205ENST00000554167 4176 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 ZNF506-201ENST00000443905 4095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 NAT2-201ENST00000286479 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 AC117409.1-201ENST00000470499 1310 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 EEF1A1P21-201ENST00000512363 1344 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 CXADRP1-201ENST00000398098 1095 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 RN7SKP29-201ENST00000410957 272 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 LINC01980-201ENST00000414382 543 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 AC019205.1-201ENST00000421830 730 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 ATP5A1P8-201ENST00000423669 1291 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 SDCBP-203ENST00000424270 1277 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 AL353608.2-201ENST00000425587 340 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 AL583854.1-201ENST00000438818 613 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 LINC02006-201ENST00000488210 524 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 PRB1-202ENST00000500254 775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 RNU6ATAC39P-201ENST00000516309 149 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 RN7SKP70-201ENST00000516655 271 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 AC010768.4-201ENST00000528183 520 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 AC103855.3-201ENST00000528445 606 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 AC134511.1-201ENST00000535721 192 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 AP001007.3-201ENST00000560744 356 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 AC018558.1-201ENST00000562591 459 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 AC134669.1-201ENST00000581275 672 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 AL136084.2-213ENST00000585704 690 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 ZNF208-204ENST00000599916 740 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 AC073218.2-202ENST00000605962 617 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 AL133481.2-203ENST00000607558 139 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 CXADRP3-202ENST00000617265 1100 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 UGP2-232ENST00000640075 567 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 FAM205BP-203ENST00000455647 3752 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 TDRD5-202ENST00000367614 3632 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 LINC02397-201ENST00000504409 10626 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
TAF1AQ15573 KIAA1841-205ENST00000453873 4294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
TAF1AQ15573 MRC1-201ENST00000569591 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
TAF1AQ15573 AC011503.1-201ENST00000596326 1585 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.48
TAF1AQ15573 CLEC12A-201ENST00000304361 1549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
TAF1AQ15573 DDX4-202ENST00000354991 2324 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TAF1AQ15573 RFX3-212ENST00000617270 9253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TAF1AQ15573 LINC00906-206ENST00000589921 3444 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
TAF1AQ15573 APBB2-230ENST00000543538 6992 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TAF1AQ15573 ARIH1-201ENST00000379887 21681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
TAF1AQ15573 NBPF20-205ENST00000622803 3689 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TAF1AQ15573 MFSD8-239ENST00000641590 2479 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TAF1AQ15573 RCAN2-201ENST00000306764 3240 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
TAF1AQ15573 SLC9B1P1-201ENST00000331172 1337 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TAF1AQ15573 KYNUP3-201ENST00000574386 1341 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TAF1AQ15573 WASHC4-202ENST00000332180 5812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
TAF1AQ15573 FASTKD2-201ENST00000236980 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
TAF1AQ15573 UGT2A1-206ENST00000514019 2376 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TAF1AQ15573 OR56A3-201ENST00000329564 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TAF1AQ15573 RNA5SP500-201ENST00000364486 119 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TAF1AQ15573 FIGN-202ENST00000409634 746 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TAF1AQ15573 HAO2-IT1-201ENST00000419144 311 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TAF1AQ15573 NME1P1-201ENST00000420914 382 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TAF1AQ15573 AL136131.2-201ENST00000424283 348 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TAF1AQ15573 AC073283.2-202ENST00000426892 591 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TAF1AQ15573 FGF12-202ENST00000430714 603 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TAF1AQ15573 AC126120.1-201ENST00000431082 470 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TAF1AQ15573 HNRNPA1P18-201ENST00000433537 927 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.7 ms