Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 HYPM-201ENST00000341016 501 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 C1orf105-201ENST00000367725 888 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 S100A9-201ENST00000368738 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 RNU6-83P-201ENST00000384568 112 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 SNORA40.2-201ENST00000390847 128 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 AC008171.1-201ENST00000395058 200 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 AL445238.1-204ENST00000400311 463 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 AL139100.1-201ENST00000408001 498 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 AL049765.1-201ENST00000416237 573 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 AC106870.2-201ENST00000421411 691 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 NFIA-AS2-202ENST00000421455 768 ntTSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 MTND4P20-201ENST00000424125 869 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 BX119904.4-201ENST00000424402 301 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 AL133268.4-201ENST00000424868 472 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 OR5AW1P-201ENST00000426334 1006 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 LINC01728-201ENST00000428529 524 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 LINC01522-201ENST00000428999 429 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 AC093639.1-201ENST00000441026 473 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 PA2G4P1-201ENST00000442248 1197 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 AL050303.1-201ENST00000444356 458 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 HMGB1P48-201ENST00000446155 598 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 AL357514.1-201ENST00000446322 488 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 AL133217.1-201ENST00000450980 425 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 AL034399.1-201ENST00000451535 380 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 AC019080.2-201ENST00000453859 394 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 MBNL1-213ENST00000465907 945 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 RPS14P8-201ENST00000478778 369 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 AC131233.1-201ENST00000479200 955 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 CFLAR-223ENST00000479953 1230 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 AC105391.1-201ENST00000503155 1045 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 NDUFB4P12-201ENST00000513465 390 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 LINC01030-201ENST00000517505 738 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 AC105999.2-201ENST00000521363 881 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 AC013546.1-201ENST00000523232 564 ntTSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 AC090458.1-203ENST00000527757 546 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 AC084816.1-202ENST00000536744 647 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 HPS5-207ENST00000537258 1275 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 LYZ-202ENST00000548839 558 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 POLR2KP1-201ENST00000553226 168 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 NBEAP1-201ENST00000554452 979 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 TIMM9-206ENST00000555593 796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 AC079075.2-201ENST00000557964 449 ntTSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 AC068831.6-201ENST00000560522 795 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 AC087465.1-201ENST00000560574 245 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 NDUFA3P4-201ENST00000560814 250 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 AC023827.2-201ENST00000566880 1061 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 AC006441.4-202ENST00000577621 510 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 AC011193.2-201ENST00000582638 367 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 MIR4470-201ENST00000583453 72 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 AC010327.4-201ENST00000585911 857 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 EIF1P6-201ENST00000600054 334 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 AC015726.1-201ENST00000602353 681 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 AC012557.2-201ENST00000605919 418 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 AC007671.1-201ENST00000616957 830 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 AC078909.2-201ENST00000620584 398 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 FP475955.2-201ENST00000623720 458 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 AC007490.1-201ENST00000624321 703 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 LGI1-209ENST00000627699 664 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 IGF2BP3-201ENST00000258729 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 C5orf24-201ENST00000338051 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 BTK-209ENST00000618050 2417 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 LRMP-204ENST00000547044 2208 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 ZHX3-205ENST00000432768 3551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 IL2RA-203ENST00000379959 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 ATP13A5-201ENST00000342358 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 DCDC1-207ENST00000452803 1706 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 YES1P1-201ENST00000418510 1628 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 SCAPER-203ENST00000538941 4853 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 HAUS3-201ENST00000243706 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 GIF-201ENST00000257248 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 KLHL41-201ENST00000284669 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 SLC3A1-206ENST00000409740 1418 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 AC010894.3-202ENST00000412835 1405 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 ATG12-202ENST00000500945 1430 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 MGAM-202ENST00000475668 9172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 LPAR4-205ENST00000614823 2155 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 RPL7L1-201ENST00000304734 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 CNTN5-202ENST00000418526 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 LY86-AS1-202ENST00000435641 2819 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 RORA-201ENST00000261523 1951 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 AC138393.1-206ENST00000540997 1886 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 DTNA-221ENST00000591182 1787 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 ADGRB3-203ENST00000546190 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 ZEB2-244ENST00000638007 9140 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 PIGN-220ENST00000638167 4195 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 PMFBP1-202ENST00000355636 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 RLIMP2-201ENST00000427891 1563 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 AC006042.3-201ENST00000454684 1469 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 SLC2A14-201ENST00000340749 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 GDNF-AS1-202ENST00000510986 1941 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 MAPK1IP1L-201ENST00000395468 6480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 TMSB4XP2-201ENST00000335179 210 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 RNU6-1339P-201ENST00000363574 91 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 AL591503.1-201ENST00000366224 477 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 SMPX-201ENST00000379494 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 SERPINB12-202ENST00000382768 1278 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 RPS3AP5-201ENST00000389400 821 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 TRBV19-201ENST00000390393 552 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 TRAV38-1-201ENST00000390464 353 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PDCD1Q15116 TP63-205ENST00000392461 1251 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.9 ms