Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 AC105243.1-201ENST00000563172 1165 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 AC009121.2-202ENST00000572706 505 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 FCGR1CP-201ENST00000579737 1127 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 MIR4258-201ENST00000580920 91 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 AC008109.1-201ENST00000583163 826 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 AC008507.3-201ENST00000585753 472 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 AC098847.2-201ENST00000588088 528 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 RPL7AP69-201ENST00000595306 806 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 LINC02112-203ENST00000606169 419 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 AC015712.7-201ENST00000615211 635 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 MALAT1-209ENST00000616691 587 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 AC244100.1-201ENST00000618141 407 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 BRCC3-209ENST00000620502 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 AC005355.2-201ENST00000625064 484 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 AL049767.1-201ENST00000636811 514 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 LINC01541-202ENST00000568095 3105 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 ADGRL2-209ENST00000370727 5164 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 AC063923.1-201ENST00000478982 1619 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 LINC01787-201ENST00000435311 1994 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 ZFAND6-223ENST00000616533 1653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 DDX4-202ENST00000354991 2324 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 FASTKD1-204ENST00000453153 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 MS4A6A-213ENST00000530839 1383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 FOXN2-201ENST00000340553 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 LINC01355-201ENST00000566551 5444 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 WDR63-202ENST00000326813 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 CLUL1-205ENST00000579494 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 TOPBP1-201ENST00000260810 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 MYO9A-209ENST00000564571 8111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 CFAP70-202ENST00000340329 1403 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 RBPJP7-201ENST00000442803 1447 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 RBPJP5-201ENST00000449433 1447 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 ZNF189-201ENST00000259395 3115 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 ZNF160-203ENST00000429604 4336 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 SCG5-201ENST00000300175 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 SAR1A-201ENST00000373236 437 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 STMN1-202ENST00000374291 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 TPT1-204ENST00000379060 764 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 TRAV23DV6-201ENST00000390451 409 ntAPPRIS P1 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 AC026310.1-201ENST00000396004 378 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 PPIAP23-201ENST00000420099 497 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 PRUNEP1-201ENST00000425846 705 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 RPS7P14-201ENST00000426405 583 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 TNKS2-AS1-201ENST00000432246 609 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 AL731544.1-201ENST00000436500 370 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 AL138767.3-201ENST00000438082 495 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 AC019185.3-201ENST00000438805 323 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 AL592114.2-201ENST00000440142 532 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 GTF2IP14-201ENST00000441415 586 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 RPS7P4-201ENST00000444127 582 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 AL589765.3-201ENST00000446084 462 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 AC003035.2-201ENST00000448948 696 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 AC002553.2-201ENST00000453217 340 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 CBX1P2-201ENST00000453841 458 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 FRG2FP-204ENST00000453982 852 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 RPL12P39-201ENST00000455456 496 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 AC108866.1-203ENST00000504106 529 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 AL158068.2-201ENST00000510632 563 ntTSL 4 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 AC012055.1-201ENST00000511346 1144 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 Y_RNA.710-201ENST00000516975 110 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 AC078899.1-201ENST00000521432 1185 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 IGHVII-49-1-201ENST00000521760 224 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 AC023080.1-201ENST00000551663 931 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 OTX2-203ENST00000554559 715 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 AC010266.1-201ENST00000568962 442 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 AC024361.3-201ENST00000570919 333 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 MIR4472-2-201ENST00000582069 67 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 AC011824.3-201ENST00000585093 563 ntTSL 4 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 AC239809.3-206ENST00000596091 741 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 ZNF738-205ENST00000597810 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 ZNF415-218ENST00000599261 601 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 AC008555.7-201ENST00000605008 583 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 AL589743.6-201ENST00000611025 117 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 RDM1-226ENST00000619828 687 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 AC244517.6-202ENST00000623884 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 SKIV2L-216ENST00000628157 210 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 AC006453.3-201ENST00000635891 377 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 KCNJ1-204ENST00000392665 4074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 DLX6-AS1-201ENST00000430027 15364 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 PDCD1LG2-201ENST00000397747 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 LYPD6B-202ENST00000409029 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 INSIG2-208ENST00000614681 1347 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 CWF19L2-201ENST00000282251 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 EYA4-211ENST00000525849 3456 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 ZNF559-ZNF177-201ENST00000434737 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 LINC01470-202ENST00000506723 2193 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 AC010894.1-201ENST00000313760 361 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 XAGE3-201ENST00000346279 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 FAS-203ENST00000355279 983 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 RNA5SP308-201ENST00000362532 115 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 RNU1-5P-201ENST00000362684 144 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 RNA5SP375-201ENST00000362975 119 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 APOOL-201ENST00000373173 1279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 AC233289.1-201ENST00000403700 508 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 RN7SKP97-201ENST00000410966 333 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 RN7SKP247-201ENST00000411094 308 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 TRGV5P-201ENST00000419915 354 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 LINC01501-201ENST00000427523 409 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 AL162408.1-201ENST00000428853 433 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 PCBP1-AS1-224ENST00000429599 1045 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
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