Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 AL157831.2-201ENST00000564681 3095 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 GRIA4-212ENST00000530497 5059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 ZNF415-204ENST00000594011 2630 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 AC004520.1-201ENST00000608362 1413 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 RBM11-201ENST00000400577 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 GRIK2-206ENST00000413795 4876 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 KIAA0040-202ENST00000444639 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 KNL1-201ENST00000346991 9573 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 KLHL2-209ENST00000514860 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 C1orf100-201ENST00000308105 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 OR8B3-201ENST00000354597 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 RNA5SP382-201ENST00000363355 112 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 RN7SKP130-201ENST00000364924 301 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 MIR421-201ENST00000365696 85 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 LINC01317-201ENST00000366209 779 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 OR8B2-201ENST00000375013 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 DEFB121-202ENST00000376314 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 AP000812.1-201ENST00000378140 477 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 MIR191-201ENST00000384873 92 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 AL136310.1-201ENST00000404926 654 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 AL033519.1-201ENST00000407266 307 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 CoTC_ribozyme.1-201ENST00000408104 192 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 RN7SKP205-201ENST00000410999 307 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 ELOCP9-201ENST00000418624 239 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 AC006509.1-201ENST00000420788 634 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 AC021876.1-201ENST00000425959 359 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 AL583785.1-201ENST00000428006 512 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 AL138733.2-201ENST00000431947 804 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 GTF2IP3-201ENST00000433887 494 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 AL109807.1-201ENST00000438222 569 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 AC114812.2-201ENST00000439336 663 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 MTND5P2-201ENST00000442927 1142 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 AL391361.2-203ENST00000443380 413 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 AC005297.1-201ENST00000444765 862 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 PPIA-203ENST00000451562 544 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 AC010878.1-201ENST00000456500 1047 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 RPL6P9-201ENST00000466502 859 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 THOC7-AS1-201ENST00000468961 673 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 RN7SL390P-201ENST00000470634 284 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 AC083795.2-201ENST00000510034 610 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 VCAN-AS1-201ENST00000512090 424 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 RN7SKP34-201ENST00000516142 244 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 RNU2-30P-201ENST00000516209 141 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 MAL2-207ENST00000522828 603 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 AC124293.1-201ENST00000530034 493 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 BTG1P1-201ENST00000540396 508 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 LINC02413-201ENST00000549914 723 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 RNASE9-204ENST00000553541 1136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 AC010401.2-202ENST00000570663 396 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 AC099850.2-201ENST00000577660 557 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 AC024267.2-201ENST00000582737 417 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 AC005242.1-201ENST00000585658 438 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 RSL24D1P11-201ENST00000591045 491 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 LINC02028-206ENST00000593326 810 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 UBE2E3-208ENST00000602632 446 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 AL583832.1-201ENST00000603227 784 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 AC007255.2-201ENST00000604053 631 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 AC116651.1-201ENST00000609724 556 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 AC004448.4-210ENST00000610229 833 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 DAOA-AS1_1.1-201ENST00000613021 201 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 HMGN2-210ENST00000619352 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 AC211486.4-201ENST00000621495 113 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 AC091931.1-201ENST00000623488 728 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 AC130448.2-201ENST00000624082 374 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 FRG1DP-201ENST00000635586 771 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 SLC36A2-201ENST00000335244 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 SPATA6-202ENST00000371843 2297 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 KLRD1-201ENST00000336164 3258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 DCHS2-207ENST00000623607 8912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 PTPN3-203ENST00000412145 8765 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 LINC00690-201ENST00000429949 1365 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 MTND4P23-201ENST00000447723 1363 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 AC018992.1-201ENST00000523778 2149 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 PSG1-203ENST00000403380 1722 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 TLR1-201ENST00000308979 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 PHKB-201ENST00000299167 5464 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 EPHA6-204ENST00000502694 1582 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 ATXN2-202ENST00000389153 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 LINC00269-201ENST00000399711 2173 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 AP000547.3-204ENST00000588548 2523 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SSPNQ14714 AC021078.1-201ENST00000499521 8636 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
SSPNQ14714 GUCY2C-201ENST00000261170 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
SSPNQ14714 ABL2-201ENST00000344730 6910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
SSPNQ14714 HSD17B13-202ENST00000328546 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
SSPNQ14714 CYP19A1-202ENST00000396404 2388 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
SSPNQ14714 VRK2-203ENST00000417641 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
SSPNQ14714 ATXN3-204ENST00000429774 6713 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
SSPNQ14714 APOOL-202ENST00000613473 6445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
SSPNQ14714 POLA1-202ENST00000379068 5486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
SSPNQ14714 ADAM2-201ENST00000265708 2672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
SSPNQ14714 TET1P1-201ENST00000426627 2301 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SSPNQ14714 AL357568.1-201ENST00000421530 1963 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
SSPNQ14714 LINC00698-203ENST00000468072 1957 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
SSPNQ14714 SLC38A1-211ENST00000612161 1607 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
SSPNQ14714 FAS-205ENST00000357339 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
SSPNQ14714 Y_RNA.88-201ENST00000363029 99 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SSPNQ14714 PAGE2B-201ENST00000374971 493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
SSPNQ14714 PFKFB1-201ENST00000374992 1156 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
SSPNQ14714 XAGE3-202ENST00000375491 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
SSPNQ14714 SNORD94-201ENST00000386037 137 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.9 ms