Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 AC087477.5-202ENST00000560242 389 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 NPM1P42-201ENST00000560329 862 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 U95743.1-201ENST00000573369 1001 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 AC134669.1-201ENST00000581275 672 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 TEX26-AS1-204ENST00000585582 853 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 AC079315.1-201ENST00000602952 623 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 AL499605.1-201ENST00000604628 403 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 AL589745.2-201ENST00000616366 555 ntTSL 4 BASIC6.07□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 AL445670.1-201ENST00000618889 801 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 AC245187.2-201ENST00000631520 475 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 CHN1-201ENST00000295497 2047 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 LINC01422-201ENST00000434868 6043 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 AC020633.1-201ENST00000468439 2247 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 CTAGE5-204ENST00000341749 2912 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 MAPK10-370ENST00000641943 4117 ntAPPRIS P2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 ASAH2-203ENST00000443575 1942 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 PTPN3-202ENST00000374541 6703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 RBM41-201ENST00000372479 1662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 DNM1P47-202ENST00000561463 15043 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 MCM3AP-AS1-204ENST00000432735 2302 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 AL080276.2-201ENST00000637995 2090 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 POGZ-213ENST00000491586 4130 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 LMOD3-201ENST00000420581 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 RNF6-202ENST00000381570 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 AP002001.1-201ENST00000526101 1759 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 KIAA1328-201ENST00000280020 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 KYNUP3-201ENST00000574386 1341 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 NBPF19-201ENST00000369227 3670 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 NBPF20-203ENST00000594479 3670 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 NBPF14-210ENST00000621066 3670 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 CNTN1-208ENST00000551295 5557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 RNFT1P3-201ENST00000340898 1052 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 AC090616.2-201ENST00000358484 431 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 RN7SKP128-201ENST00000364270 303 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 AC011752.1-203ENST00000417609 582 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 LINC01762-201ENST00000423907 454 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 AC007283.1-201ENST00000434645 445 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 CST12P-201ENST00000457644 362 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 AL122020.1-201ENST00000472287 459 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 AC117386.1-201ENST00000474444 606 ntTSL 4 BASIC6.06□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 CR383656.1-201ENST00000484916 377 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 AC025458.1-201ENST00000506046 166 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 AC022140.1-201ENST00000511029 565 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 IGKV1OR22-1-201ENST00000521497 360 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 WBP1LP3-201ENST00000523033 208 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 AC027369.2-201ENST00000528030 440 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 ANP32E-205ENST00000533654 908 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 AC244502.2-201ENST00000543361 851 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 LINC01906-201ENST00000582962 499 ntTSL 4 BASIC6.06□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 AC117569.1-201ENST00000584482 739 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 ZNF528-211ENST00000598192 625 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 AL109954.2-201ENST00000611020 530 ntTSL 4 BASIC6.06□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 Metazoa_SRP.70-201ENST00000612622 273 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 AL512356.3-201ENST00000623005 461 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 CACNB4-234ENST00000636785 3787 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 CSNK1G1-204ENST00000606793 1658 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 DTNA-227ENST00000597599 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 ZBTB25-201ENST00000394715 2094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 AC022164.1-201ENST00000568767 2673 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 OR4F17-202ENST00000585993 2669 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 AL355488.2-201ENST00000609909 2850 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 LRRC37A3-204ENST00000400877 3273 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 SCN1A-217ENST00000637988 8562 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 ZNF436-201ENST00000314011 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 VPS13B-203ENST00000358544 14094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 BX322639.1-201ENST00000609841 6590 ntTSL 4 BASIC6.06□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 OBSCN-201ENST00000284548 20432 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 PMFBP1-207ENST00000537465 3935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 AC116158.1-201ENST00000560231 2129 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 CLDN12-203ENST00000394605 3488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 AC027088.4-201ENST00000611559 1947 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 RIMS1-219ENST00000523963 3097 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 MYO3B-202ENST00000408978 5529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 TAF9-205ENST00000506736 1331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 DNAH3-201ENST00000261383 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 C3orf67-209ENST00000482387 2617 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 FGG-201ENST00000336098 1659 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 PAPD4-203ENST00000428308 2204 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 IFNE-201ENST00000448696 1475 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 AC008163.1-201ENST00000636281 1455 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 PRSS37-201ENST00000350549 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 RBMS3-AS2-201ENST00000366321 582 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 LINC01620-202ENST00000372910 649 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 RN7SKP17-201ENST00000411242 351 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 LINC01980-201ENST00000414382 543 ntTSL 4 BASIC6.05□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 RPS4XP5-201ENST00000419038 768 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 LINC01760-201ENST00000423410 382 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 AC000095.2-201ENST00000424407 768 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 TRGC2-201ENST00000436911 1013 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 AL049649.1-201ENST00000444792 1105 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 REG1CP-206ENST00000447469 496 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 AC068633.1-202ENST00000476460 458 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 PFN1P6-201ENST00000476786 399 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 AC093719.1-201ENST00000480427 441 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 Metazoa_SRP.158-201ENST00000487171 294 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 RN7SL193P-201ENST00000491708 276 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 HAND2-AS1-235ENST00000515376 951 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 AC097173.2-201ENST00000518701 474 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 AL162464.1-201ENST00000557642 554 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 AC018558.1-201ENST00000562591 459 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.2 ms