Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,029 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 AP000873.2-205ENST00000529031 435 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 AC084121.1-201ENST00000533882 835 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 AC068339.2-201ENST00000534395 618 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 AC020611.2-201ENST00000535594 671 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 AC026826.3-201ENST00000561747 158 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 AC020978.2-201ENST00000563203 428 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 AC007496.2-201ENST00000564801 547 ntTSL 4 BASIC6.15□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 AC023813.1-201ENST00000565055 306 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 RAB27A-212ENST00000569493 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 AC011921.2-201ENST00000589465 152 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 AC006116.7-201ENST00000590141 756 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 AL355816.2-201ENST00000610049 647 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 OR1N1-202ENST00000619659 939 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 AL133370.2-201ENST00000619934 439 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 AP000943.4-201ENST00000622912 357 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 AC097460.3-201ENST00000623099 442 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 GCSAML-206ENST00000527084 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 CX3CR1-202ENST00000399220 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 NCOA7-208ENST00000438495 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 GLRA2-204ENST00000443437 3182 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 AC011346.1-201ENST00000638059 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 RAD54B-201ENST00000297592 1879 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 PSG6-204ENST00000402603 1412 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 GDA-209ENST00000545168 5362 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 FASTKD1-204ENST00000453153 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 IL5RA-209ENST00000446632 2514 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 MYCBP2-212ENST00000612956 1542 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 STK3-216ENST00000523601 3107 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 CHD2-215ENST00000628375 3202 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 SCN1A-203ENST00000409050 5946 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 BICD1-204ENST00000548411 8811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 ZNF266-207ENST00000592904 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 GABRA3-204ENST00000535043 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 IFIT1-202ENST00000546318 4613 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 RYR2-201ENST00000360064 14850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 AC092070.2-203ENST00000598377 3644 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 TCF4-284ENST00000637169 7553 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 ANAPC10-201ENST00000309439 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 PKIB-203ENST00000368446 556 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 YWHAZP6-201ENST00000399764 738 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 AL512363.1-201ENST00000425089 586 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 AL138789.1-201ENST00000425820 960 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 PQLC2L-202ENST00000426338 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 UBE2D3P3-201ENST00000426992 425 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 AC024601.1-201ENST00000427247 524 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 MTCO1P51-201ENST00000427672 1060 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 AL157387.1-201ENST00000436077 335 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 RPL12P11-201ENST00000439970 501 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 POU5F1P5-201ENST00000445059 658 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 FCF1P6-201ENST00000456841 595 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 IQCJ-SCHIP1-AS1-201ENST00000460574 508 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 AP002884.1-201ENST00000479691 655 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 AC018645.1-201ENST00000505003 109 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 AC011352.2-201ENST00000514574 1016 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 AC103833.1-201ENST00000517442 172 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 AC022915.3-201ENST00000518620 594 ntTSL 4 BASIC6.14□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 AC097173.2-201ENST00000518701 474 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 AC008429.2-201ENST00000523057 864 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 DDHD2-219ENST00000529845 945 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 C11orf74-210ENST00000534635 801 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 LINC00944-204ENST00000544499 366 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 AC004217.2-201ENST00000547401 751 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 AC233266.2-201ENST00000567067 528 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 AP003115.1-201ENST00000569849 463 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 ZNF174-204ENST00000572544 1002 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 PPIAL4A-201ENST00000577856 660 ntAPPRIS P1 BASIC6.14□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 AP001011.1-201ENST00000583546 690 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 AC243756.1-201ENST00000584068 660 ntAPPRIS P1 BASIC6.14□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 AC135178.4-201ENST00000585275 548 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 AC005242.1-201ENST00000585658 438 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 DYNLL1P1-201ENST00000595442 269 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 AC097467.3-216ENST00000599555 1293 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 IGKV2OR2-1-201ENST00000605129 304 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 AC017076.1-201ENST00000607613 578 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 AC091768.1-201ENST00000609258 930 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 AL135999.3-201ENST00000610501 812 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 AC015922.4-201ENST00000612568 690 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 AC025016.1-201ENST00000616746 682 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 AP001052.1-201ENST00000626421 99 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 TRAT1-201ENST00000295756 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 TTTY4B-201ENST00000420149 1346 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 TTTY4-201ENST00000436568 1346 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 TTTY4C-201ENST00000456123 1346 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 AL731532.1-201ENST00000623972 4236 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 RGS6-204ENST00000404301 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 RGS6-206ENST00000407322 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 LINC01422-201ENST00000434868 6043 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 LINC01441-201ENST00000433766 2290 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 GIF-201ENST00000257248 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 WDR95P-201ENST00000425638 1542 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 AC130360.2-201ENST00000533477 1556 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 CHD6-202ENST00000373222 2477 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 ZFP62-201ENST00000502412 3415 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 TMEM209-201ENST00000397622 3545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 KLHL13-202ENST00000371876 5331 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 GLIPR1L2-202ENST00000378692 1903 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 BACH1-202ENST00000399921 5769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 TRPC4-210ENST00000625583 3009 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 ASXL2-203ENST00000435504 12878 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
ATP1A4Q13733 CDH13-209ENST00000567109 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
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