Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 LINC01760-201ENST00000423410 382 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 AL355339.1-201ENST00000434386 435 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 RPL23AP19-201ENST00000436229 369 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 AC108066.1-201ENST00000437261 596 ntTSL 4 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 AL512637.1-201ENST00000439523 1231 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 LINC01781-202ENST00000443104 591 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 AL358612.1-201ENST00000452911 481 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 RABGAP1L-214ENST00000478442 648 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 AC099521.1-201ENST00000482557 334 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 PSMA2P2-201ENST00000504319 686 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 AC022826.1-201ENST00000519383 805 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 HGNC:24955-208ENST00000521585 1260 ntTSL 4 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 AC062004.1-202ENST00000524014 246 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 RPLP0-225ENST00000552292 720 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 AC027808.1-201ENST00000560873 683 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 GARSP1-201ENST00000570895 719 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 AC119868.1-202ENST00000584741 347 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 LINC01050-201ENST00000604485 760 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 AC015574.1-205ENST00000611285 524 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 PCA3_2.1-201ENST00000612507 409 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 CCL4-202ENST00000615863 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 AC026124.2-201ENST00000621847 656 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 AC018659.2-201ENST00000624690 715 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 AL139220.2-221ENST00000628123 395 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 AL357060.1-201ENST00000638039 977 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 YES1-203ENST00000577961 4554 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 ADGB-205ENST00000397944 5325 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 TESPA1-212ENST00000532804 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 MACF1-232ENST00000567887 24319 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 TTC39B-207ENST00000507993 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 CLCC1-204ENST00000369968 4151 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 AASDH-203ENST00000502617 3004 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 ZNF26-202ENST00000534834 4853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 LGI1-219ENST00000636155 1618 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 KCNJ1-204ENST00000392665 4074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 AL603840.1-201ENST00000422374 4063 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 CALN1-204ENST00000405452 8571 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 CUZD1-205ENST00000368904 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 AC007159.1-201ENST00000566529 4706 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 CDC42SE2-201ENST00000360515 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 TLR2-201ENST00000260010 4200 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 OR56A3-201ENST00000329564 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 RPS3AP2-201ENST00000407190 754 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 BCL11A-205ENST00000409351 756 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 AL162408.1-201ENST00000428853 433 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 LINC01773-201ENST00000437598 787 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 AL663074.2-201ENST00000440621 479 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 CUBNP2-201ENST00000443534 1139 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 PFN1P6-201ENST00000476786 399 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 SNORA70.20-201ENST00000516848 126 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 AC022616.2-201ENST00000523185 300 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 AC009396.2-201ENST00000555954 700 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 AC087477.5-202ENST00000560242 389 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 AC009097.1-201ENST00000567077 406 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 AC136944.1-201ENST00000567464 560 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 TMEM159-205ENST00000572599 713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 PIK3C3-207ENST00000587402 452 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 UBE2E3-208ENST00000602632 446 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 AL589745.2-201ENST00000616366 555 ntTSL 4 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 AL445670.1-201ENST00000618889 801 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 LINC01587-204ENST00000623565 873 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 AC008691.1-209ENST00000642094 814 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 RBMY1F-201ENST00000303766 1887 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 KLHL41-201ENST00000284669 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 ZNF184-202ENST00000377419 2899 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 OR6C4-202ENST00000641569 5141 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 NDUFA5-207ENST00000471770 5608 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 CDKL4-201ENST00000378803 1567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 SLC39A12-201ENST00000377369 2808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 IL15-204ENST00000477265 6026 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 RPE65-201ENST00000262340 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 C17orf78-203ENST00000611038 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 PLEKHA1-201ENST00000368988 3872 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 SEMA3A-201ENST00000265362 8225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 NAT1-201ENST00000307719 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 PAGE2-202ENST00000374968 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 KRTAP29-1-201ENST00000391353 1026 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 AL031985.1-201ENST00000392713 418 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 TOMM7-203ENST00000405021 455 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 AK4P4-201ENST00000419465 646 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 CATSPER2P1-205ENST00000446479 419 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 RPL31P15-201ENST00000449770 338 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 AL445665.1-202ENST00000452436 324 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 BIRC6-AS1-201ENST00000455572 697 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 AC008945.1-201ENST00000505144 499 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 LINC02057-202ENST00000511794 577 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 AC108727.2-201ENST00000512277 392 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 GYPB-213ENST00000513128 360 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 RN7SKP288-201ENST00000516227 268 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 LINC02310-201ENST00000556762 572 ntTSL 4 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 SSX4B-201ENST00000595235 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 SSX4-201ENST00000595689 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 ZNF43-209ENST00000598288 560 ntTSL 4 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 AC145423.1-201ENST00000605712 336 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 AL354950.1-201ENST00000614150 568 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 AP003789.1-201ENST00000617737 605 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 AJ009632.2-209ENST00000634853 933 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 CDON-206ENST00000531738 5803 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 MOSPD2-201ENST00000380492 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 AC106872.5-201ENST00000508856 1416 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
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