Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 SEPT7P3-201ENST00000455017 621 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 PSPC1P2-201ENST00000455130 225 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 BX323845.2-201ENST00000458382 234 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 AC067817.2-201ENST00000459965 387 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 AC084754.1-201ENST00000463466 464 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 TUBBP11-201ENST00000472255 252 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 RPS10P28-201ENST00000480396 498 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 PLS1-AS1-201ENST00000485338 346 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 RN7SL306P-201ENST00000492941 296 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 OR2A3P-201ENST00000493774 953 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 AC097467.1-201ENST00000513660 370 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 Y_RNA.695-201ENST00000516715 107 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 AC037450.1-201ENST00000518129 647 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 AC103957.1-202ENST00000519814 735 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 AC011333.1-201ENST00000520587 436 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 YWHAZ-220ENST00000522819 875 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 AP004607.5-201ENST00000532034 217 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 AHI1-217ENST00000534469 680 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 PDCL3P1-201ENST00000534575 734 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 AC068643.2-201ENST00000547418 852 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 AC074031.1-201ENST00000550634 734 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 AC087883.1-201ENST00000551882 391 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 AL355102.4-201ENST00000553638 738 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 NBEAP1-201ENST00000554452 979 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 AL356022.1-202ENST00000555433 379 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 FAM30C-201ENST00000561158 410 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 MT1B-202ENST00000562399 351 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 AC136619.2-201ENST00000563361 631 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 AC087463.3-201ENST00000570105 415 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 MIR4470-201ENST00000583453 72 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 AC010327.4-201ENST00000585911 857 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 TTN-AS1-245ENST00000592182 749 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 AP002884.5-201ENST00000595053 1132 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 AC100767.2-201ENST00000604840 693 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 AC027506.1-201ENST00000621395 198 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 LINC01440-208ENST00000627300 699 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 INTS2-201ENST00000251334 4255 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 NUP43-201ENST00000340413 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 NUMB-229ENST00000557597 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 DCX-206ENST00000496551 1320 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 AL049647.1-201ENST00000319682 1789 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 KLHL5-204ENST00000504108 2690 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 QRSL1-202ENST00000369046 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 IRAK4-203ENST00000448290 1381 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 PRRC1-202ENST00000442138 5504 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 AL606516.1-201ENST00000455438 1861 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 VEPH1-201ENST00000362010 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 SMG1-210ENST00000565224 2372 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 PSG9-206ENST00000593948 1429 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 CUL3-216ENST00000617432 1426 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 RPGRIP1L-206ENST00000564374 3877 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 PBLD-203ENST00000336578 2449 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 AC121758.1-201ENST00000557452 3942 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 TTC41P-203ENST00000548527 1475 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 PPFIA2-205ENST00000541570 2976 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 ADAL-203ENST00000428046 3514 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 SLC16A4-202ENST00000369781 2082 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 SLC2A14-201ENST00000340749 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 HBS1L-206ENST00000415177 2636 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 SGO1P2-201ENST00000429458 1589 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 CEP41-213ENST00000489512 3161 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 TCEANC2-201ENST00000234827 10436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 EPS8-207ENST00000540613 2204 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 AC004023.1-201ENST00000561473 1744 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 VEZF1-204ENST00000584396 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 NEDD9-216ENST00000620854 4086 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 CYP19A1-202ENST00000396404 2388 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 AL132656.2-201ENST00000482985 1837 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 LPAL2-203ENST00000454031 2498 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 DNM1L-203ENST00000381000 4397 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 SORBS2-230ENST00000448662 4356 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 OR11G2-203ENST00000641879 4415 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 NUP93-202ENST00000542526 8257 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 IL5-201ENST00000231454 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 OR5A1-201ENST00000302030 1051 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 CLEC7A-202ENST00000304084 1130 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 LINC00301-201ENST00000320202 852 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 RNFT1P3-201ENST00000340898 1052 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 RNU4-51P-201ENST00000364206 140 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 RN7SKP257-201ENST00000364525 309 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 RNA5SP302-201ENST00000364896 100 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 RNA5SP355-201ENST00000365317 135 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 TRGV3-201ENST00000390346 537 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 Y_RNA.578-201ENST00000390903 88 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 AC019178.1-201ENST00000392337 440 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 AL137058.2-203ENST00000398039 825 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 LL22NC01-81G9.3-201ENST00000400221 992 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 MTERF4-205ENST00000407095 799 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 NPM1P11-201ENST00000417106 855 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 AC008173.1-201ENST00000418901 264 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 AL121781.1-201ENST00000419863 168 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 AL359633.1-201ENST00000421403 310 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 MTCO2P34-201ENST00000421994 607 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 AC012519.1-201ENST00000424588 610 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 UQCRHP1-204ENST00000424609 274 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 MTND1P32-201ENST00000433043 938 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 AL354983.1-201ENST00000434580 906 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 PTGES3P1-201ENST00000439531 483 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 HMGB3P6-201ENST00000444896 598 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 CYCSP44-201ENST00000448560 313 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
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