Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 ARL14EPL-201ENST00000601302 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
TCOF1Q13428 TDRD5-202ENST00000367614 3632 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.67□□□□□ -1.02
TCOF1Q13428 ALG2-202ENST00000319033 1627 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
TCOF1Q13428 ETV1-210ENST00000430479 6740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
TCOF1Q13428 ZFP37-201ENST00000374227 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
TCOF1Q13428 MDM4-217ENST00000621032 5592 ntTSL 2 BASIC8.66□□□□□ -1.02
TCOF1Q13428 NCOR1-205ENST00000395857 9501 ntTSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
TCOF1Q13428 SLC17A2-203ENST00000377850 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
TCOF1Q13428 ZSCAN12-201ENST00000361028 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
TCOF1Q13428 AKAP13-203ENST00000394518 13215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
TCOF1Q13428 GCNT1-202ENST00000442371 5972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
TCOF1Q13428 USP37-201ENST00000258399 8032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
TCOF1Q13428 ADGB-205ENST00000397944 5325 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
TCOF1Q13428 U3.2-201ENST00000362981 210 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
TCOF1Q13428 F9-202ENST00000394090 1272 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
TCOF1Q13428 AL121977.1-201ENST00000401636 979 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
TCOF1Q13428 AL109941.1-201ENST00000401925 229 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
TCOF1Q13428 USP24P1-201ENST00000433802 779 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
TCOF1Q13428 PSMD10P3-201ENST00000437000 448 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
TCOF1Q13428 GSTA7P-201ENST00000438425 448 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
TCOF1Q13428 AC019185.1-201ENST00000442718 389 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
TCOF1Q13428 DAP3-209ENST00000465375 729 ntTSL 2 BASIC8.66□□□□□ -1.02
TCOF1Q13428 RN7SL583P-201ENST00000475692 287 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
TCOF1Q13428 AC109481.1-201ENST00000509173 282 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
TCOF1Q13428 LINC02147-201ENST00000509367 807 ntTSL 2 BASIC8.66□□□□□ -1.02
TCOF1Q13428 AP006259.1-201ENST00000528520 561 ntTSL 2 BASIC8.66□□□□□ -1.02
TCOF1Q13428 AC139697.1-201ENST00000548429 745 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
TCOF1Q13428 AL049872.1-201ENST00000556323 322 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
TCOF1Q13428 AL118522.2-201ENST00000616045 615 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
TCOF1Q13428 AP000550.3-201ENST00000637734 379 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
TCOF1Q13428 CLSPN-202ENST00000318121 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
TCOF1Q13428 PHIP-201ENST00000275034 10460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
TCOF1Q13428 SCAF11-212ENST00000549162 3934 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
TCOF1Q13428 C1orf21-201ENST00000235307 10265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
TCOF1Q13428 CSNK1G1-204ENST00000606793 1658 ntTSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
TCOF1Q13428 NDUFA9-201ENST00000266544 8363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
TCOF1Q13428 AC009948.3-201ENST00000603415 1798 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
TCOF1Q13428 KAT7-201ENST00000259021 9644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
TCOF1Q13428 DIS3-201ENST00000377767 10604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
TCOF1Q13428 SH3D19-201ENST00000304527 5273 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.65□□□□□ -1.02
TCOF1Q13428 PTER-202ENST00000378000 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
TCOF1Q13428 BDNF-207ENST00000395986 3979 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
TCOF1Q13428 U8.4-201ENST00000363626 134 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
TCOF1Q13428 FAR2P2-201ENST00000413041 594 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
TCOF1Q13428 RPL35AP24-201ENST00000413846 330 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
TCOF1Q13428 FAR2P4-202ENST00000425399 584 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
TCOF1Q13428 VN1R54P-201ENST00000435210 1049 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
TCOF1Q13428 OR6D1P-201ENST00000436165 939 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
TCOF1Q13428 AL161629.1-201ENST00000446201 457 ntTSL 3 BASIC8.65□□□□□ -1.02
TCOF1Q13428 FAR2P1-206ENST00000449736 709 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
TCOF1Q13428 CYP4F62P-203ENST00000455215 552 ntTSL 4 BASIC8.65□□□□□ -1.02
TCOF1Q13428 OR2AO1P-201ENST00000476497 403 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
TCOF1Q13428 AC087672.1-201ENST00000479876 766 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
TCOF1Q13428 AC114954.1-201ENST00000506656 820 ntTSL 3 BASIC8.65□□□□□ -1.02
TCOF1Q13428 AC113208.4-201ENST00000563568 206 ntTSL 3 BASIC8.65□□□□□ -1.02
TCOF1Q13428 AC007346.2-201ENST00000564816 892 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
TCOF1Q13428 BLOC1S6-209ENST00000565409 616 ntTSL 4 BASIC8.65□□□□□ -1.02
TCOF1Q13428 AC025574.2-201ENST00000615621 514 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
TCOF1Q13428 MILR1-204ENST00000616498 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
TCOF1Q13428 AL731566.2-201ENST00000618971 317 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
TCOF1Q13428 OR2G6-203ENST00000641804 6084 ntAPPRIS P1 BASIC8.65□□□□□ -1.02
TCOF1Q13428 AC022819.1-201ENST00000563495 3910 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
TCOF1Q13428 NIN-204ENST00000382043 4216 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
TCOF1Q13428 OR2T7-201ENST00000641057 3463 ntAPPRIS P1 BASIC8.65□□□□□ -1.02
TCOF1Q13428 ELAVL4-202ENST00000371819 2467 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.65□□□□□ -1.03
TCOF1Q13428 CUZD1-205ENST00000368904 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
TCOF1Q13428 AC083899.1-201ENST00000454465 3819 ntBASIC8.65□□□□□ -1.03
TCOF1Q13428 CLCN3-201ENST00000347613 3635 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
TCOF1Q13428 REV3L-203ENST00000368805 10461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.03
TCOF1Q13428 NEK11-201ENST00000356918 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.03
TCOF1Q13428 CLIP4-202ENST00000401605 2322 ntTSL 2 BASIC8.65□□□□□ -1.03
TCOF1Q13428 SENP8-202ENST00000542035 1672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.65□□□□□ -1.03
TCOF1Q13428 CLEC4D-201ENST00000299665 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
TCOF1Q13428 NEXMIF-203ENST00000616200 10624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
TCOF1Q13428 DCDC1-207ENST00000452803 1706 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
TCOF1Q13428 CRYBG3-201ENST00000389622 10729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
TCOF1Q13428 AC106870.1-201ENST00000359823 200 ntTSL 3 BASIC8.64□□□□□ -1.03
TCOF1Q13428 AC005042.1-201ENST00000393397 800 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
TCOF1Q13428 GAPDHP42-201ENST00000406848 981 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
TCOF1Q13428 METTL15P3-201ENST00000415522 1221 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
TCOF1Q13428 ITGA9-AS1-202ENST00000420870 581 ntTSL 4 BASIC8.64□□□□□ -1.03
TCOF1Q13428 ITGA9-AS1-203ENST00000429532 702 ntTSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
TCOF1Q13428 AL160271.1-201ENST00000444708 829 ntTSL 3 BASIC8.64□□□□□ -1.03
TCOF1Q13428 AC013733.1-201ENST00000449835 985 ntTSL 4 BASIC8.64□□□□□ -1.03
TCOF1Q13428 RPL7P61-201ENST00000451721 751 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
TCOF1Q13428 CDC42P3-201ENST00000518493 633 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
TCOF1Q13428 AC103853.1-201ENST00000520588 649 ntTSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
TCOF1Q13428 AL163952.1-202ENST00000569625 600 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
TCOF1Q13428 MIR4311-201ENST00000580794 100 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
TCOF1Q13428 LINC01835-202ENST00000589345 450 ntTSL 3 BASIC8.64□□□□□ -1.03
TCOF1Q13428 AC090510.2-201ENST00000617465 629 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
TCOF1Q13428 MIR8080-201ENST00000622224 89 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
TCOF1Q13428 LINC01587-204ENST00000623565 873 ntTSL 2 BASIC8.64□□□□□ -1.03
TCOF1Q13428 NBPF9-203ENST00000610300 2930 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
TCOF1Q13428 MIR4435-2HG-207ENST00000439362 1522 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
TCOF1Q13428 NSUN4-208ENST00000498008 3867 ntTSL 2 BASIC8.64□□□□□ -1.03
TCOF1Q13428 MTUS1-202ENST00000297488 3731 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
TCOF1Q13428 PSMD6-202ENST00000394431 1349 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
TCOF1Q13428 RTL9-201ENST00000465301 5426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
TCOF1Q13428 RNF6-202ENST00000381570 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102 ms