Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 MOB4-207ENST00000448447 1021 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SRSF5Q13243 LINC01831-201ENST00000449772 493 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SRSF5Q13243 LRRC37A14P-201ENST00000452297 462 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SRSF5Q13243 AC007386.1-201ENST00000455212 582 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SRSF5Q13243 AC011225.1-201ENST00000457751 369 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SRSF5Q13243 RN7SL727P-201ENST00000482164 296 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SRSF5Q13243 NENFP3-201ENST00000503735 313 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SRSF5Q13243 BX510359.5-201ENST00000515651 304 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SRSF5Q13243 LINC00534-203ENST00000523406 812 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SRSF5Q13243 GTF2H1-208ENST00000526630 932 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SRSF5Q13243 AP002754.2-201ENST00000542121 462 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SRSF5Q13243 AC010761.5-201ENST00000579468 287 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SRSF5Q13243 AC114488.3-201ENST00000581333 480 ntTSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SRSF5Q13243 IMMP1LP3-201ENST00000604197 224 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SRSF5Q13243 AL445647.2-201ENST00000615170 130 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SRSF5Q13243 MIR7155-201ENST00000615925 56 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SRSF5Q13243 AL137067.2-201ENST00000621202 131 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SRSF5Q13243 MED12L-206ENST00000474524 10744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SRSF5Q13243 PTPRO-208ENST00000542557 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SRSF5Q13243 DAZ2-202ENST00000382306 3781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SRSF5Q13243 VEGFD-201ENST00000297904 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SRSF5Q13243 CRB1-211ENST00000638467 4348 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SRSF5Q13243 PUS10-203ENST00000407787 1820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SRSF5Q13243 METTL9-211ENST00000615720 2890 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SRSF5Q13243 NSF-206ENST00000575068 2667 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SRSF5Q13243 ZNF658B-201ENST00000602828 3408 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SRSF5Q13243 SETDB2-205ENST00000611815 5313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SRSF5Q13243 SCN1A-204ENST00000423058 8191 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SRSF5Q13243 ESRRG-203ENST00000361395 5216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SRSF5Q13243 ESRRG-209ENST00000408911 5216 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SRSF5Q13243 ING3-204ENST00000431467 1447 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SRSF5Q13243 ROR1-AS1-202ENST00000424995 2189 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SRSF5Q13243 PIGN-247ENST00000640540 4720 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SRSF5Q13243 TNKS-206ENST00000518281 3897 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SRSF5Q13243 KIAA0232-201ENST00000307659 7841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
SRSF5Q13243 A1CF-206ENST00000395489 9517 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SRSF5Q13243 AC025809.2-201ENST00000625085 1802 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SRSF5Q13243 USMG5-201ENST00000309579 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
SRSF5Q13243 ZNF385D-AS1-201ENST00000412369 705 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SRSF5Q13243 AL596448.1-201ENST00000415024 392 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SRSF5Q13243 BMS1P17-202ENST00000416720 316 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SRSF5Q13243 AL034345.2-202ENST00000416948 830 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SRSF5Q13243 RPS15AP30-201ENST00000420976 390 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SRSF5Q13243 AL391704.3-201ENST00000425365 831 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SRSF5Q13243 HMGB3P24-201ENST00000433260 622 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SRSF5Q13243 Z84478.1-201ENST00000438230 1219 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SRSF5Q13243 AL451063.1-201ENST00000450164 1133 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SRSF5Q13243 AC093166.4-201ENST00000457867 318 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SRSF5Q13243 AC023245.1-201ENST00000468501 517 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SRSF5Q13243 AC114728.1-201ENST00000488289 483 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SRSF5Q13243 AC093763.2-201ENST00000505334 1223 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SRSF5Q13243 AC006499.3-201ENST00000506077 748 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SRSF5Q13243 AC092436.4-201ENST00000510905 483 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SRSF5Q13243 LGALS8-217ENST00000525042 903 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
SRSF5Q13243 SOX9-AS1-208ENST00000529667 340 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SRSF5Q13243 GPATCH2L-203ENST00000553588 776 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SRSF5Q13243 AC009396.2-201ENST00000555954 700 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SRSF5Q13243 AC023906.4-201ENST00000557898 895 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SRSF5Q13243 HMGN2P47-201ENST00000559378 272 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SRSF5Q13243 AC138907.7-201ENST00000568972 358 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SRSF5Q13243 AL136311.1-213ENST00000586466 520 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SRSF5Q13243 FKBP1AP1-201ENST00000594588 318 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SRSF5Q13243 Metazoa_SRP.134-201ENST00000610965 327 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SRSF5Q13243 AL137246.2-201ENST00000613439 662 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SRSF5Q13243 AL359513.1-201ENST00000614364 557 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SRSF5Q13243 AC024255.1-201ENST00000614376 102 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SRSF5Q13243 AC037198.3-201ENST00000616754 526 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SRSF5Q13243 RN7SL544P-201ENST00000617232 284 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SRSF5Q13243 RN7SL763P-201ENST00000620922 284 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SRSF5Q13243 KCNJ1-204ENST00000392665 4074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
SRSF5Q13243 PCDH15-213ENST00000395445 5917 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
SRSF5Q13243 TTC39B-207ENST00000507993 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SRSF5Q13243 TRIQK-206ENST00000518748 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
SRSF5Q13243 MARVELD2-204ENST00000454295 4376 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
SRSF5Q13243 CERS3-203ENST00000538112 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
SRSF5Q13243 OFD1P8Y-201ENST00000449148 1433 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SRSF5Q13243 AC027279.1-201ENST00000568885 4284 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SRSF5Q13243 SLC16A6-201ENST00000327268 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
SRSF5Q13243 PATJ-203ENST00000371158 8505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SRSF5Q13243 RIMS1-205ENST00000414192 1787 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SRSF5Q13243 AC037459.2-201ENST00000514980 4076 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SRSF5Q13243 CHD6-202ENST00000373222 2477 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
SRSF5Q13243 DPH5-203ENST00000370109 1316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
SRSF5Q13243 WASHC4-214ENST00000620430 5807 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
SRSF5Q13243 AC005674.2-201ENST00000561486 3510 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
SRSF5Q13243 CYP2C8-201ENST00000371270 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
SRSF5Q13243 LINC01951-201ENST00000377300 1925 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SRSF5Q13243 YTHDC1-207ENST00000579690 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SRSF5Q13243 AP001541.1-201ENST00000623322 1904 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SRSF5Q13243 FAM13A-AS1-201ENST00000500765 3210 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SRSF5Q13243 GNS-202ENST00000418919 4877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
SRSF5Q13243 SREK1-203ENST00000380918 2433 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
SRSF5Q13243 PIK3C2A-201ENST00000265970 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
SRSF5Q13243 ZBTB21-205ENST00000398511 5608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
SRSF5Q13243 ACOD1-202ENST00000449753 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SRSF5Q13243 ZNF585B-205ENST00000532828 6210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
SRSF5Q13243 PDE4B-203ENST00000371045 3982 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
SRSF5Q13243 CLCN3-211ENST00000613795 5874 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SRSF5Q13243 CHRM5-201ENST00000383263 5410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SRSF5Q13243 ZNF233-205ENST00000592581 2938 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 148.5 ms