Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 VTI1BP4-201ENST00000427516 527 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
FAM3AP98173 BX276092.6-201ENST00000430476 250 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
FAM3AP98173 AC073410.1-201ENST00000435125 589 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
FAM3AP98173 AC096632.2-201ENST00000438139 1239 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
FAM3AP98173 OR52I1-201ENST00000450052 1050 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
FAM3AP98173 AC099344.3-201ENST00000454489 626 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
FAM3AP98173 BX276092.8-201ENST00000455722 250 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
FAM3AP98173 AL603882.1-201ENST00000463059 681 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
FAM3AP98173 AC091874.2-201ENST00000505889 720 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
FAM3AP98173 snoU109.5-201ENST00000516231 132 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
FAM3AP98173 AC090572.3-201ENST00000519041 804 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
FAM3AP98173 CREBZF-209ENST00000534224 545 ntTSL 4 BASIC5.14□□□□□ -1.59
FAM3AP98173 AL133240.1-201ENST00000553537 580 ntTSL 4 BASIC5.14□□□□□ -1.59
FAM3AP98173 AC092332.1-201ENST00000563684 829 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
FAM3AP98173 AC007346.2-201ENST00000564816 892 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
FAM3AP98173 AC022872.1-201ENST00000568391 781 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
FAM3AP98173 SEPT4-AS1-202ENST00000580589 653 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
FAM3AP98173 AC243756.1-201ENST00000584068 660 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
FAM3AP98173 LINC01533-201ENST00000585739 616 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
FAM3AP98173 AC107993.1-201ENST00000591343 684 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
FAM3AP98173 APOC2-205ENST00000592257 444 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
FAM3AP98173 TMSB15B-207ENST00000598087 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
FAM3AP98173 AC008750.7-201ENST00000600765 559 ntTSL 4 BASIC5.14□□□□□ -1.59
FAM3AP98173 AC068768.2-201ENST00000602352 343 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
FAM3AP98173 LINC02362-201ENST00000608785 516 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
FAM3AP98173 LINC02362-202ENST00000610683 724 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
FAM3AP98173 DARS-AS1-225ENST00000615163 824 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
FAM3AP98173 MALAT1-214ENST00000618925 424 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
FAM3AP98173 ELSPBP1-206ENST00000619003 893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
FAM3AP98173 LINC01125-249ENST00000627399 1067 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
FAM3AP98173 FHL1-218ENST00000543669 2878 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
FAM3AP98173 CTAGE5-204ENST00000341749 2912 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
FAM3AP98173 SULT1C2-205ENST00000437390 1359 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
FAM3AP98173 ARHGAP20-204ENST00000528829 5880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
FAM3AP98173 DCDC1-203ENST00000406071 4758 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
FAM3AP98173 EBF1-211ENST00000622875 4430 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
FAM3AP98173 ZNF81-202ENST00000338637 7859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
FAM3AP98173 CRNDE-212ENST00000613942 2601 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
FAM3AP98173 FGF1-214ENST00000612258 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
FAM3AP98173 ZNF559-201ENST00000317221 2732 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
FAM3AP98173 PCGF5-205ENST00000614189 7037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
FAM3AP98173 RAB3GAP1-207ENST00000539493 3161 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
FAM3AP98173 HSPD1P9-201ENST00000420325 1636 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
FAM3AP98173 NOL8-214ENST00000535387 3390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
FAM3AP98173 MEPE-202ENST00000395102 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
FAM3AP98173 GCNT1P4-201ENST00000404096 329 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
FAM3AP98173 HNRNPA1P29-201ENST00000426409 879 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
FAM3AP98173 LINC01501-201ENST00000427523 409 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
FAM3AP98173 AL162408.1-201ENST00000428853 433 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
FAM3AP98173 NPSR1-AS1-206ENST00000439852 710 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
FAM3AP98173 RPS7P3-201ENST00000443360 580 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
FAM3AP98173 AC097463.1-201ENST00000447288 481 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
FAM3AP98173 AL445466.1-201ENST00000448432 357 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
FAM3AP98173 PFN1P6-201ENST00000476786 399 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
FAM3AP98173 RABGAP1L-216ENST00000486220 772 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
FAM3AP98173 MOSPD2-206ENST00000497603 775 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
FAM3AP98173 AC093801.1-201ENST00000504017 307 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
FAM3AP98173 ST13P12-201ENST00000508958 1094 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
FAM3AP98173 AC018797.1-201ENST00000510791 255 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
FAM3AP98173 AC027117.1-201ENST00000520646 667 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
FAM3AP98173 OR4A42P-201ENST00000531397 938 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
FAM3AP98173 ASB8-203ENST00000535988 679 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
FAM3AP98173 AP000593.3-201ENST00000546065 578 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
FAM3AP98173 AC073964.1-201ENST00000558938 308 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
FAM3AP98173 THSD4-AS1-201ENST00000561571 554 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
FAM3AP98173 AC100821.2-201ENST00000565668 440 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
FAM3AP98173 AC145285.4-201ENST00000568183 540 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
FAM3AP98173 TEX41-218ENST00000596540 882 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
FAM3AP98173 AC011468.3-201ENST00000597886 332 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
FAM3AP98173 AC243967.1-201ENST00000598976 578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
FAM3AP98173 LINC01435-212ENST00000601212 742 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
FAM3AP98173 AC124916.2-201ENST00000604416 224 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
FAM3AP98173 AL161457.2-201ENST00000629181 630 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
FAM3AP98173 TEX41-293ENST00000630451 690 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
FAM3AP98173 AC002429.2-202ENST00000637269 394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
FAM3AP98173 AC099654.15-201ENST00000639802 509 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
FAM3AP98173 TTBK2-201ENST00000267890 10905 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
FAM3AP98173 ZNF33A-203ENST00000432900 3994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
FAM3AP98173 SLC28A3-201ENST00000376238 4887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
FAM3AP98173 PAK3-202ENST00000360648 2241 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
FAM3AP98173 ZNF300P1-202ENST00000520773 3115 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
FAM3AP98173 C4orf36-203ENST00000473559 2306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
FAM3AP98173 MUT-201ENST00000274813 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
FAM3AP98173 RBPJP7-201ENST00000442803 1447 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
FAM3AP98173 RBPJP5-201ENST00000449433 1447 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
FAM3AP98173 AC015971.1-203ENST00000426549 1948 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
FAM3AP98173 DDAH1-204ENST00000535924 3909 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
FAM3AP98173 PIGN-239ENST00000639902 4439 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
FAM3AP98173 AP005432.1-201ENST00000580891 3485 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
FAM3AP98173 KLRC4-KLRK1-201ENST00000539300 1507 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
FAM3AP98173 LINC02225-201ENST00000510444 4069 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
FAM3AP98173 ITCH-201ENST00000262650 3089 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
FAM3AP98173 DST-205ENST00000370765 8999 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
FAM3AP98173 KIAA1328-201ENST00000280020 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
FAM3AP98173 PARP8-212ENST00000505697 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
FAM3AP98173 SLC16A6-201ENST00000327268 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
FAM3AP98173 C1orf112-201ENST00000286031 4355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
FAM3AP98173 GNG2-212ENST00000556752 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
FAM3AP98173 AC008627.1-201ENST00000517511 1704 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FAM3AP98173 SEPT7-203ENST00000399035 4066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80 ms