Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 IFNK-201ENST00000276943 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 GPR151-201ENST00000311104 3088 ntAPPRIS P1 BASIC7.82□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 RNA5SP433-201ENST00000364491 114 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 TINAG-202ENST00000370864 692 ntTSL 2 BASIC7.82□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 AL354864.1-201ENST00000373226 539 ntTSL 2 BASIC7.82□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 PPARG-204ENST00000397000 1122 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 ESCO2-202ENST00000397418 720 ntTSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 SUPT7L-202ENST00000404798 4114 ntTSL 2 BASIC7.82□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 CEBPZOS-205ENST00000406711 687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 AL133264.1-201ENST00000407157 562 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 AC096669.1-202ENST00000413708 616 ntTSL 2 BASIC7.82□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 MTND4P3-201ENST00000417829 541 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 OPRM1-206ENST00000419506 1402 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 AL512363.1-201ENST00000425089 586 ntTSL 2 BASIC7.82□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 PRKG1-AS1-202ENST00000426785 1111 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 AC115283.1-201ENST00000427353 400 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 AL356277.3-201ENST00000432484 618 ntTSL 3 BASIC7.82□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 CFAP58-AS1-201ENST00000435434 795 ntTSL 2 BASIC7.82□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 AC000041.1-201ENST00000439655 175 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 AC064874.1-202ENST00000440101 287 ntTSL 3 BASIC7.82□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 CATSPER2P1-205ENST00000446479 419 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 RNF148-202ENST00000447240 839 ntTSL 2 BASIC7.82□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 OTX2P1-201ENST00000450956 354 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 AC093899.1-201ENST00000457984 376 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 AC129807.1-201ENST00000471614 591 ntTSL 4 BASIC7.82□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 RPS4XP6-201ENST00000477670 797 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 RPS14P8-201ENST00000478778 369 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 C5orf64-204ENST00000507461 535 ntTSL 4 BASIC7.82□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 RNU6-232P-201ENST00000517144 64 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 AC022915.3-201ENST00000518620 594 ntTSL 4 BASIC7.82□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 AC123767.1-201ENST00000519537 1439 ntTSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 AP003472.1-201ENST00000519844 644 ntTSL 3 BASIC7.82□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 CHCHD7-210ENST00000521524 703 ntTSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 AP003486.1-201ENST00000525716 3994 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 RERGL-202ENST00000536890 367 ntTSL 3 BASIC7.82□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 ERP27-202ENST00000540097 993 ntTSL 2 BASIC7.82□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 AC087260.1-201ENST00000546118 401 ntTSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 APAF1-211ENST00000552268 1143 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 AC068831.6-201ENST00000560522 795 ntTSL 3 BASIC7.82□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 AL031716.1-201ENST00000569106 530 ntTSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 ZNF174-204ENST00000572544 1002 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 MIR4502-201ENST00000580432 81 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 AC005726.4-201ENST00000582858 458 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 AL031985.2-201ENST00000600955 480 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 LINC01435-212ENST00000601212 742 ntTSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 AC073648.5-201ENST00000603502 305 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 AL135999.3-201ENST00000610501 812 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 AC026951.2-201ENST00000613847 241 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 CKLF-CMTM1-206ENST00000616804 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.82□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 AC092656.1-203ENST00000624134 423 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 AC104581.5-201ENST00000624171 7141 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 OR2AK2-202ENST00000641852 1008 ntAPPRIS P2 BASIC7.82□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 CASC19-281ENST00000642118 1554 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 ADH1B-201ENST00000305046 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 ERBB4-205ENST00000436443 12084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 VIRMA-202ENST00000421249 3924 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 AC006305.1-201ENST00000382897 2558 ntTSL 2 BASIC7.82□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 CD163-209ENST00000541972 3590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 MCM8-201ENST00000265187 3442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 EBLN2-201ENST00000533473 1679 ntAPPRIS P1 BASIC7.82□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 AC131649.2-201ENST00000624925 4439 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 PKIB-207ENST00000392491 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 AC104662.2-201ENST00000512921 1388 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.82□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 NDRG3-203ENST00000373773 2098 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 AC121758.1-201ENST00000557452 3942 ntTSL 2 BASIC7.82□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 SLA-201ENST00000338087 3451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 NAALAD2-201ENST00000321955 3035 ntTSL 2 BASIC7.81□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 CNOT6LP1-201ENST00000559681 1462 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 FAM13A-218ENST00000511976 3579 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 SLC9A4-201ENST00000295269 4138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 SPECC1L-207ENST00000541492 3525 ntTSL 2 BASIC7.81□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 AL355306.2-202ENST00000634380 2281 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 AC107983.2-201ENST00000425211 4735 ntTSL 2 BASIC7.81□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 KPNA1-201ENST00000344337 6830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 INTS4-209ENST00000534064 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 TTLL5-207ENST00000554510 2624 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 HIST1H2BA-201ENST00000274764 516 ntAPPRIS P1 BASIC7.81□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 S100A1-202ENST00000368696 522 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 EEF1AKMT1-201ENST00000382754 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 TRAV10-201ENST00000390432 379 ntAPPRIS P1 BASIC7.81□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 HSPD1P16-201ENST00000402302 394 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 AL663061.1-201ENST00000416625 580 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 AC006366.1-201ENST00000422002 759 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 NAP1L4P2-201ENST00000425958 899 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 AC239367.3-201ENST00000428996 814 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 BX119904.1-201ENST00000432026 348 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 NANOGP2-201ENST00000435391 727 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 AC245517.2-201ENST00000442890 346 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 COX4I1P2-201ENST00000447446 547 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 Z95152.1-201ENST00000453556 656 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 Z83838.1-202ENST00000456225 839 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 SLC9A9-AS2-201ENST00000490153 327 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 RPS10P20-201ENST00000494130 463 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 LINC01596-201ENST00000503609 592 ntTSL 2 BASIC7.81□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 AC018645.1-201ENST00000505003 109 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 AC105919.1-201ENST00000507203 393 ntTSL 3 BASIC7.81□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 LINC01609-201ENST00000519506 424 ntTSL 3 BASIC7.81□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 AC020937.1-201ENST00000519677 1013 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 AC087897.1-201ENST00000550134 156 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 AC005225.1-201ENST00000553394 937 ntTSL 3 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.1 ms