Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 AFP-202ENST00000395792 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 UVRAG-205ENST00000528420 2463 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 CYBB-201ENST00000378588 4324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 PLRG1-202ENST00000499023 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 KANTR-203ENST00000604062 4251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 ST7-204ENST00000393444 2113 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 IQCJ-SCHIP1-205ENST00000527095 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 C17orf78-203ENST00000611038 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF630-202ENST00000409324 2455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 GIGYF2-246ENST00000629305 7878 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 CACNB4-245ENST00000637284 2423 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 ZFP42-201ENST00000326866 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC2A14-203ENST00000431042 3458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 RWDD2A-201ENST00000369724 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 GPM6A-201ENST00000280187 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 ELOC-201ENST00000284811 683 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 SSX3-201ENST00000298396 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 OR51Q1-201ENST00000300778 1096 ntAPPRIS P1 BASIC6.07□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 SNX24-202ENST00000395451 1050 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 MRPL53P1-201ENST00000414323 319 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 AK4P4-201ENST00000419465 646 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 AC079355.1-201ENST00000421770 223 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 SUMO2P3-201ENST00000438311 288 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 HCG14-201ENST00000444986 413 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 AC099521.1-201ENST00000482557 334 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 AC018709.1-201ENST00000509111 700 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC02485-202ENST00000511899 770 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 AC011389.1-203ENST00000513790 573 ntTSL 4 BASIC6.07□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 CYCSP22-201ENST00000517555 339 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 RRM2B-206ENST00000519317 420 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 AC025366.1-201ENST00000523264 202 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 HMGN2P36-201ENST00000529541 409 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 LDHC-205ENST00000537486 583 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 GARSP1-201ENST00000570895 719 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 TULP3P1-203ENST00000606237 586 ntTSL 4 BASIC6.07□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 AC004477.3-201ENST00000614061 590 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 AL139099.4-201ENST00000614802 114 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 Xist_exon4.1-201ENST00000615964 126 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR6886-201ENST00000619864 61 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 AJ009632.2-209ENST00000634853 933 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 OR51Q1-202ENST00000641085 1096 ntAPPRIS P1 BASIC6.07□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 OR11H2-202ENST00000641517 1085 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC7A11-201ENST00000280612 9645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 ANK3-216ENST00000503366 5792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 KLHL28-202ENST00000396128 6545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 IFNE-201ENST00000448696 1475 ntAPPRIS P1 BASIC6.07□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 MOSPD2-201ENST00000380492 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 PPFIA2-219ENST00000550359 3808 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 MTND5P12-201ENST00000502851 1449 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 RIMS1-219ENST00000523963 3097 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 ANKRD26P1-204ENST00000571006 4741 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 AC005480.1-202ENST00000555916 3548 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 RAD54B-201ENST00000297592 1879 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 NOS1-201ENST00000317775 12158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 CYLD-201ENST00000311559 5371 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 ODF2-205ENST00000393527 3653 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 AL121768.1-201ENST00000613917 2544 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC02523-201ENST00000423208 2963 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 APBB2-230ENST00000543538 6992 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 LUZP2-201ENST00000336930 3553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM161B-211ENST00000512429 1796 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 AC006511.3-201ENST00000624929 1783 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 MECOM-202ENST00000433243 3508 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01787-201ENST00000435311 1994 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC02183-201ENST00000637822 1732 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC02119-201ENST00000508853 2573 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 KCNJ1-204ENST00000392665 4074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 ECHDC1-202ENST00000368289 909 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 FAIM-204ENST00000393035 946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 RN7SKP229-201ENST00000410465 302 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 RN7SKP29-201ENST00000410957 272 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 SDHDP6-201ENST00000414693 480 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 RPS17P17-201ENST00000419392 409 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01762-201ENST00000423907 454 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 AL390115.1-201ENST00000425271 423 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 AC017074.2-201ENST00000439382 607 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 AC023141.9-201ENST00000458734 412 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 SYPL1-205ENST00000470347 1193 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 NENFP3-201ENST00000503735 313 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 AC008592.4-201ENST00000509999 450 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 IGLV3-30-201ENST00000524362 298 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 ANKRD49-206ENST00000540349 573 ntTSL 4 BASIC6.06□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 AC105036.1-201ENST00000566222 271 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 SNORD95-201ENST00000579879 68 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 TEX26-AS1-204ENST00000585582 853 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR132-201ENST00000591554 101 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 AC010463.2-201ENST00000597592 661 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR6768-201ENST00000610734 72 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 RNA5SP440-201ENST00000612665 119 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 AC010099.4-201ENST00000424515 1453 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 AP002478.1-201ENST00000577848 1455 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 AC016907.2-203ENST00000455424 3563 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 HECTD4-211ENST00000550722 15450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 OR13C1P-202ENST00000641378 2919 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 PSG5-210ENST00000599812 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 HMMR-204ENST00000432118 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 FRMD7-202ENST00000370879 2864 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 CLMN-201ENST00000298912 12747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 FTO-204ENST00000463855 3056 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 AL158064.2-205ENST00000640346 4082 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.7 ms