Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

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Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 AC011493.1-201ENST00000596753 1632 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 FCRL5-201ENST00000361835 5390 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 ATG13-203ENST00000524625 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 MUCL1-201ENST00000308796 470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 TTTY13-201ENST00000330337 659 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-702P-201ENST00000364982 107 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 Y_RNA.307-201ENST00000365022 117 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 DEFB109C-201ENST00000382575 264 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 DEFB109B-201ENST00000382656 264 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 Y_RNA.384-201ENST00000383909 102 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-43P-201ENST00000384302 107 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 MIR181C-201ENST00000384881 110 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 RNA5SP18-201ENST00000390935 121 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 CYCSP45-201ENST00000402289 315 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 XKRYP4-201ENST00000414395 483 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 AC068481.1-201ENST00000415520 530 ntTSL 4 BASIC10.19□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 AC245054.2-201ENST00000415639 319 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 AC021035.1-201ENST00000421597 427 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 AL590783.1-201ENST00000424138 456 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 RIMKLBP2-201ENST00000424737 654 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 AL353052.1-201ENST00000428673 818 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 AC023590.1-205ENST00000430457 676 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 GAPDHP32-201ENST00000433816 998 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 AC092167.1-201ENST00000435466 495 ntTSL 4 BASIC10.19□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 EMC3-AS1-205ENST00000438698 534 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 AC007879.4-201ENST00000440545 361 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 SNX18P9-201ENST00000440580 835 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 AL158214.1-201ENST00000444423 404 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 AL139135.2-201ENST00000445040 433 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 XKRYP5-201ENST00000449659 483 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 ATP5G1P6-201ENST00000451206 412 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 L1TD1-201ENST00000498273 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 AL445187.1-201ENST00000502685 260 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 LINC02118-201ENST00000505899 407 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 AC006070.1-201ENST00000508151 193 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 AC109811.2-201ENST00000509609 452 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-1281P-201ENST00000516223 105 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 RN7SKP2-201ENST00000517003 319 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 OR8A2P-201ENST00000528631 952 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 AP000662.1-201ENST00000530952 487 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 AC013799.1-201ENST00000531157 348 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 AL132780.1-202ENST00000548322 591 ntTSL 4 BASIC10.19□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 AC066612.1-202ENST00000561094 518 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 AC092720.1-203ENST00000563921 550 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 BLOC1S6-209ENST00000565409 616 ntTSL 4 BASIC10.19□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 ARL17A-205ENST00000573185 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 ARL17B-206ENST00000575698 581 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 AC007431.2-201ENST00000577189 563 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 AC006120.1-201ENST00000579375 546 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 AC090125.1-201ENST00000581541 493 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 GLUD1P2-201ENST00000583339 201 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 GLUD1P8-201ENST00000585063 203 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 AC005884.1-201ENST00000588604 429 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 MIR7515HG-250ENST00000592565 856 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 ZRANB2-AS2-215ENST00000596952 624 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 AC113194.1-201ENST00000606037 500 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 LINC00649-214ENST00000609132 668 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 uc_338.5-201ENST00000611839 155 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 AP003068.4-201ENST00000623192 802 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 MTPN-201ENST00000393085 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 RBM12B-202ENST00000517700 6001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 SLC9A6-207ENST00000636092 4697 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 TMEM167A-201ENST00000502346 4630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 AL136985.3-201ENST00000637377 2219 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 CD46-208ENST00000367042 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 AL359547.1-201ENST00000419168 2190 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 FLG-AS1-202ENST00000392688 2995 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 NNT-AS1-204ENST00000513560 4769 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 RSRC2-201ENST00000331738 3520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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TRIM35Q9UPQ4 TRIM16-212ENST00000578237 3206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 EGFLAM-AS4-201ENST00000512496 1579 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 LINC00622-201ENST00000562811 1570 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 PPP1R1C-202ENST00000409137 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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TRIM35Q9UPQ4 WDR11-201ENST00000263461 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 BTBD3-214ENST00000618296 4582 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 MAP4K4-212ENST00000456652 3855 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 OR5F1-201ENST00000278409 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 PRAC1-201ENST00000290294 386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-549P-201ENST00000384433 107 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 IGKV6D-41-201ENST00000390271 371 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 USP32P1-202ENST00000393005 3846 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 RPL23A-203ENST00000394938 688 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 SMIM2-201ENST00000400419 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 RN7SKP261-201ENST00000410948 278 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 AC009302.1-201ENST00000417147 390 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 CCNB1IP1P1-201ENST00000428976 839 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 OR2B7P-201ENST00000429302 934 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 AL021707.2-201ENST00000431924 786 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 HBBP1-201ENST00000433329 439 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 CYP2C56P-201ENST00000440076 291 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 AL672167.1-201ENST00000441381 464 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 LINC00113-203ENST00000442550 572 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 AL035443.1-202ENST00000442841 586 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 snoU109.1-201ENST00000459339 135 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
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