Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 AL135999.3-201ENST00000610501 812 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
USP18Q9UMW8 PCA3_2.1-201ENST00000612507 409 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
USP18Q9UMW8 AL096712.1-201ENST00000614561 159 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
USP18Q9UMW8 MRPL57P1-201ENST00000621486 265 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
USP18Q9UMW8 MEG8-222ENST00000637332 1237 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
USP18Q9UMW8 OR8G5-202ENST00000641707 1156 ntAPPRIS P1 BASIC6.82□□□□□ -1.32
USP18Q9UMW8 ENTPD1-201ENST00000371205 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
USP18Q9UMW8 HSDL2-201ENST00000398803 2983 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
USP18Q9UMW8 SEL1L3-203ENST00000502949 3500 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
USP18Q9UMW8 NUP210L-201ENST00000271854 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
USP18Q9UMW8 CASP5-201ENST00000260315 1414 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
USP18Q9UMW8 RARSP1-201ENST00000542842 1418 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
USP18Q9UMW8 C16orf62-202ENST00000417362 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
USP18Q9UMW8 SMC1A-202ENST00000375340 9930 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
USP18Q9UMW8 ZNF233-205ENST00000592581 2938 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
USP18Q9UMW8 SLAMF6-203ENST00000368059 2743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
USP18Q9UMW8 RABGAP1L-218ENST00000489615 6821 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
USP18Q9UMW8 CPED1-201ENST00000310396 5340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
USP18Q9UMW8 NBPF25P-202ENST00000619932 3827 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
USP18Q9UMW8 GPATCH2L-201ENST00000261530 14007 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
USP18Q9UMW8 ZNF484-202ENST00000375495 2867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
USP18Q9UMW8 EEF1A1P24-201ENST00000451469 1378 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
USP18Q9UMW8 MATR3-215ENST00000510056 3040 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
USP18Q9UMW8 ZCCHC6-206ENST00000375963 5379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
USP18Q9UMW8 CYP3A5-201ENST00000222982 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
USP18Q9UMW8 HBS1L-206ENST00000415177 2636 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
USP18Q9UMW8 MLLT10-217ENST00000631589 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
USP18Q9UMW8 MYPN-202ENST00000358913 6013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
USP18Q9UMW8 NPHP3-AS1-202ENST00000504440 2507 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
USP18Q9UMW8 IQCM-205ENST00000636414 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
USP18Q9UMW8 LINC01520-201ENST00000441457 1487 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
USP18Q9UMW8 ESRRG-212ENST00000463665 3359 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
USP18Q9UMW8 LRRC37B-202ENST00000341671 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
USP18Q9UMW8 NUP107-211ENST00000539906 3004 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
USP18Q9UMW8 CDC7-201ENST00000234626 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
USP18Q9UMW8 NOP10-201ENST00000328848 554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
USP18Q9UMW8 TAF13-201ENST00000338366 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
USP18Q9UMW8 RNA5SP77-201ENST00000365394 120 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
USP18Q9UMW8 LCN1P2-201ENST00000372030 223 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
USP18Q9UMW8 GCNT1P4-201ENST00000404096 329 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
USP18Q9UMW8 RPL12P23-201ENST00000405880 490 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
USP18Q9UMW8 C9orf147-201ENST00000412934 584 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
USP18Q9UMW8 AL035401.1-201ENST00000420572 871 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
USP18Q9UMW8 AL451047.1-201ENST00000424451 814 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
USP18Q9UMW8 MTND4LP13-201ENST00000425022 298 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
USP18Q9UMW8 MKLN1-204ENST00000429546 572 ntTSL 4 BASIC6.81□□□□□ -1.32
USP18Q9UMW8 AKR1D1-203ENST00000432161 1236 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
USP18Q9UMW8 GAPDHP75-201ENST00000433910 943 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
USP18Q9UMW8 AF130359.1-201ENST00000444868 438 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
USP18Q9UMW8 SPANXB1-201ENST00000449283 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
USP18Q9UMW8 RPL32P14-201ENST00000463196 378 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
USP18Q9UMW8 SOX2-OT-210ENST00000487240 751 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
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USP18Q9UMW8 AC097103.2-204ENST00000510068 569 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
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USP18Q9UMW8 COX6B1P4-201ENST00000519826 484 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
USP18Q9UMW8 AC090802.1-201ENST00000520870 445 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
USP18Q9UMW8 AP002498.1-201ENST00000530190 568 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
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USP18Q9UMW8 LINC02329-201ENST00000554753 511 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
USP18Q9UMW8 RNASE11-208ENST00000555841 886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
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USP18Q9UMW8 BNIP3P32-201ENST00000600015 554 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
USP18Q9UMW8 AL683813.2-201ENST00000605245 502 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
USP18Q9UMW8 ASNSD1-209ENST00000607829 581 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
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USP18Q9UMW8 CCL4-203ENST00000621626 552 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
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USP18Q9UMW8 TRAF5-201ENST00000261464 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
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USP18Q9UMW8 SLC1A2-202ENST00000395750 11538 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
USP18Q9UMW8 OR7D4-203ENST00000641669 4965 ntAPPRIS P1 BASIC6.81□□□□□ -1.32
USP18Q9UMW8 SEPT7-AS1-203ENST00000437235 3810 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
USP18Q9UMW8 ZNF507-203ENST00000544431 5764 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
USP18Q9UMW8 NUDT13-206ENST00000537969 2151 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
USP18Q9UMW8 AC073342.2-201ENST00000595842 1800 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
USP18Q9UMW8 DNAJC16-202ENST00000375847 6069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
USP18Q9UMW8 LPAR6-201ENST00000345941 2428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
USP18Q9UMW8 ELMO2-203ENST00000372176 3678 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
USP18Q9UMW8 AP004289.1-201ENST00000436307 2205 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
USP18Q9UMW8 CCDC77-201ENST00000239830 2371 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
USP18Q9UMW8 ZNF836-201ENST00000322146 2811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
USP18Q9UMW8 PUM2-201ENST00000319801 6002 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
USP18Q9UMW8 PLCB1-202ENST00000378637 3864 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
USP18Q9UMW8 JCHAIN-201ENST00000254801 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
USP18Q9UMW8 ANKRD46-201ENST00000335659 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
USP18Q9UMW8 RN7SKP74-201ENST00000362849 309 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
USP18Q9UMW8 SOHLH2-202ENST00000379881 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
USP18Q9UMW8 U3.52-201ENST00000384034 216 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
USP18Q9UMW8 AC004386.1-201ENST00000393214 761 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
USP18Q9UMW8 ANAPC10P1-201ENST00000395991 556 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
USP18Q9UMW8 AL512422.1-201ENST00000407033 553 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
USP18Q9UMW8 RANP6-201ENST00000413691 644 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
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