Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 RANBP3L-204ENST00000515759 1532 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 RNA5SP232-201ENST00000364144 119 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 PRR9-201ENST00000368744 1229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 MRRF-203ENST00000373723 1176 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 PRELID1P1-201ENST00000403549 660 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 ATF2-205ENST00000409499 801 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 AC084816.1-201ENST00000413794 565 ntTSL 4 BASIC6.27□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 CDY17P-201ENST00000414121 1282 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 AC073464.3-201ENST00000422564 712 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 AL139158.1-201ENST00000424719 340 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 AL139415.1-201ENST00000424862 352 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 AL590399.2-201ENST00000427536 309 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 CDY8P-201ENST00000428380 1279 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 Z68868.1-201ENST00000429048 544 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 LINC02522-201ENST00000431401 256 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 AKR1D1-203ENST00000432161 1236 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 SDR42E1P3-201ENST00000438345 502 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 CDY20P-201ENST00000447528 1279 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 MTND6P5-201ENST00000448266 512 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 AC131392.1-201ENST00000506490 633 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 AC025768.1-201ENST00000510057 267 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 IGHVII-60-1-201ENST00000519079 256 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 IGHV3-57-201ENST00000520143 280 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 AF117829.1-205ENST00000524190 383 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 OR5D2P-201ENST00000524390 911 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 AC135983.3-201ENST00000528049 1226 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 AP003049.1-201ENST00000529418 457 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 KLRC1-204ENST00000536188 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 LINC00944-204ENST00000544499 366 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 AL118556.1-201ENST00000555257 502 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 AC013652.2-202ENST00000558948 910 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 AC092868.3-201ENST00000560515 784 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 AC022872.1-201ENST00000568391 781 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 AC005291.1-201ENST00000577743 641 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 MIR3154-201ENST00000577829 84 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 MIR4310-201ENST00000582950 57 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 AC005856.1-201ENST00000585921 286 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 AC002069.2-201ENST00000603580 883 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 AC024589.2-201ENST00000605642 1294 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 AC012213.4-201ENST00000606457 354 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 uc_338.29-201ENST00000615099 168 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 AP003499.2-201ENST00000624100 483 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 ZNF138-206ENST00000440598 2230 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 ATP8B5P-203ENST00000430846 3962 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 AQP9-201ENST00000219919 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 MID1-206ENST00000380787 5973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 TMEM200A-202ENST00000392429 5017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 AC005261.2-201ENST00000593427 4258 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 CASP1-215ENST00000533400 2001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 CASC19-228ENST00000641414 1684 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 OR10G4-202ENST00000641521 3623 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 ZNF675-201ENST00000359788 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 RRN3P1-201ENST00000514813 3645 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 SPATA9-201ENST00000274432 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 EEF1AKMT1-201ENST00000382754 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 NACAP7-201ENST00000407371 609 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 AL731575.1-201ENST00000413564 418 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 AL160163.1-201ENST00000417465 403 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 IGKV3OR2-268-201ENST00000421835 350 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 DPYD-IT1-201ENST00000424982 401 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 GTF3AP6-201ENST00000432585 986 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 FAM53B-AS1-201ENST00000432699 558 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 Z99127.2-201ENST00000441426 334 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 AC007383.1-201ENST00000445875 636 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 AP002856.1-201ENST00000447864 562 ntTSL 4 BASIC6.26□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 AC097359.1-201ENST00000447946 463 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 AC022498.1-201ENST00000449845 696 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 AC136489.1-203ENST00000450246 736 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 AL358876.1-201ENST00000453364 1075 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 KBTBD8-202ENST00000460576 984 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 RN7SL39P-201ENST00000462264 297 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 CMAHP-205ENST00000471416 1118 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 RN7SL170P-201ENST00000487098 295 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 AC078785.1-205ENST00000491578 482 ntTSL 4 BASIC6.26□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 NPM1P28-201ENST00000492269 840 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 SSR3-208ENST00000496050 579 ntTSL 4 BASIC6.26□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 SERF1B-203ENST00000503931 569 ntTSL 4 BASIC6.26□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 SERF1A-204ENST00000504458 569 ntTSL 4 BASIC6.26□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 IGHV7-34-1-201ENST00000519200 350 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 AL133399.1-201ENST00000527476 298 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 OR4R2P-201ENST00000530815 597 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 OR52K3P-201ENST00000531655 943 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 AC022075.3-201ENST00000539009 649 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 AC006518.1-201ENST00000541449 943 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 AL135838.1-201ENST00000556080 235 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 AC040977.1-201ENST00000573222 343 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 AL133410.1-201ENST00000574939 546 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 PPIAL4A-201ENST00000577856 660 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 AC006305.2-201ENST00000589617 552 ntTSL 4 BASIC6.26□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 MIR7515HG-235ENST00000590865 918 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 AC015574.1-202ENST00000616588 456 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 MIR6085-201ENST00000618314 110 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 LINC00284-211ENST00000620454 534 ntTSL 4 BASIC6.26□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 AP001264.1-201ENST00000620602 703 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 AL355480.1-201ENST00000629041 99 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 AP000550.3-201ENST00000637734 379 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 LINC01277-201ENST00000419957 2398 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 FIGN-201ENST00000333129 9536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 SP110-204ENST00000392048 1937 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 WDR72-208ENST00000614174 4224 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.8 ms