Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 AC004160.1-210ENST00000599875 689 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
GTF3C6Q969F1 LINC00484-208ENST00000609752 591 ntTSL 4 BASIC6.9□□□□□ -1.3
GTF3C6Q969F1 AC016590.3-201ENST00000611171 753 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
GTF3C6Q969F1 MIR6809-201ENST00000612189 116 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
GTF3C6Q969F1 ELSPBP1-206ENST00000619003 893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
GTF3C6Q969F1 FBXL21-201ENST00000297158 1305 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
GTF3C6Q969F1 AL162726.3-201ENST00000637606 1301 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
GTF3C6Q969F1 FAM229B-201ENST00000368656 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 PDE4D-202ENST00000317118 2599 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 HSPD1P9-201ENST00000420325 1636 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 SEC22A-201ENST00000309934 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 NCOA4P2-201ENST00000340589 1813 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 ADGRE1-202ENST00000312053 3128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 SPATA17-201ENST00000366933 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 FBXO9-201ENST00000244426 4559 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 CEACAM1-201ENST00000161559 3519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 KBTBD3-201ENST00000526793 3751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 AP001157.1-201ENST00000550837 2339 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 GCSAML-202ENST00000366489 4030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 PGBD4-201ENST00000397766 6612 ntAPPRIS P1 BASIC6.89□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 KCNT2-203ENST00000451324 3146 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 UNC5C-205ENST00000610318 9403 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 MOCS2-201ENST00000361377 3568 ntTSL 4 BASIC6.89□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 PYROXD1-205ENST00000538582 3639 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 RN7SKP78-201ENST00000364711 318 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 C1orf194-202ENST00000369945 534 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 RAD23B-202ENST00000416373 3835 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 LINC02246-202ENST00000418954 717 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 AC244033.1-201ENST00000426826 870 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 GAPDHP34-201ENST00000432112 823 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 GEMIN2P1-201ENST00000454246 752 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 AC019084.1-201ENST00000457337 432 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 AC092865.4-201ENST00000477936 615 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 AC090058.1-201ENST00000498788 435 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 AC018680.1-201ENST00000513332 875 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 PRMT5P1-201ENST00000514351 598 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 LACTB2-AS1-203ENST00000518553 817 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 AC009879.1-201ENST00000520029 839 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 AC084855.1-201ENST00000528696 572 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 A2MP1-201ENST00000543404 1201 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 TCEANC-205ENST00000544987 1146 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 AC073941.1-201ENST00000559148 539 ntTSL 4 BASIC6.89□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 AC020704.1-201ENST00000559394 454 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 PWRN1-206ENST00000565512 433 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 AC145285.4-201ENST00000568183 540 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 MTATP6P25-201ENST00000574491 261 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 AC243756.1-201ENST00000584068 660 ntAPPRIS P1 BASIC6.89□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 CT45A1-202ENST00000594565 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 LINC01435-212ENST00000601212 742 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 AC096708.4-201ENST00000620563 552 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 AC069542.2-201ENST00000624816 216 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 FP236241.1-206ENST00000625005 987 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 PCBP1-AS1-282ENST00000625783 826 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 DAZ2-203ENST00000382424 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 DCN-204ENST00000425043 1438 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 RANBP3L-204ENST00000515759 1532 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 SAMD3-205ENST00000457563 1877 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 NFAT5-212ENST00000627621 5875 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 HORMAD2-202ENST00000403975 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 BTLA-201ENST00000334529 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 PPP2R5E-202ENST00000422769 3478 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 LRRC8B-201ENST00000330947 7593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 FRK-201ENST00000606080 13230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 MAGI2-222ENST00000636039 5671 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 AASDH-210ENST00000602986 3480 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 AC232271.1-201ENST00000602455 2715 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 CPS1-IT1-201ENST00000628368 2306 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 TOPBP1-201ENST00000260810 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 LRRC36-202ENST00000435835 1765 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 AC006288.1-201ENST00000565320 1463 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 CRB1-211ENST00000638467 4348 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 AC090616.2-201ENST00000358484 431 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 RNA5SP232-201ENST00000364144 119 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 U3.10-201ENST00000364459 214 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 PTPN20-208ENST00000395727 790 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 TMBIM4-203ENST00000398033 844 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 SNORA81-201ENST00000408493 178 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 AL354890.1-201ENST00000413730 346 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 NFYAP1-201ENST00000431953 972 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 CCDC17-203ENST00000445048 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 RPL12P39-201ENST00000455456 496 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 SNRPCP3-201ENST00000474888 476 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 AC006539.1-201ENST00000481419 501 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 HSD3BP3-201ENST00000514706 994 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 AC069208.1-201ENST00000540811 676 ntTSL 4 BASIC6.88□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 AC090519.2-201ENST00000559034 655 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 AC092123.1-202ENST00000565310 405 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 AL163952.1-202ENST00000569625 600 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 AC011478.1-201ENST00000593140 554 ntTSL 4 BASIC6.88□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 RMDN2-AS1-203ENST00000601029 613 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 AC092266.1-201ENST00000610958 165 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 FAM49B-229ENST00000615041 750 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 AC063952.1-203ENST00000634410 658 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 UGP2-232ENST00000640075 567 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 PROM1-201ENST00000447510 3977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 LMO3-225ENST00000541295 3498 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 LINC00906-206ENST00000589921 3444 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 PARD3B-214ENST00000622699 7442 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 ASAH2-202ENST00000395526 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
GTF3C6Q969F1 ZNF107-201ENST00000344930 5174 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 140.7 ms