Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 AL359091.1-201ENST00000449048 1734 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 HMBOX1-211ENST00000524238 1731 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 HYDIN2-203ENST00000614586 13885 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 ARHGAP21-202ENST00000376410 3526 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 MIA3-201ENST00000340535 2735 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 OR51E1-201ENST00000396952 3612 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 ZNF407-203ENST00000577538 5794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 LRMDA-208ENST00000496424 3923 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 FTO-215ENST00000636491 1676 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 RAG1-201ENST00000299440 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 SENP1-201ENST00000448372 4679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 GREM1-203ENST00000622074 14606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 AP1M1-201ENST00000291439 13193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 SETDB1-201ENST00000271640 4437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 MDM4-207ENST00000454264 9926 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 TMEM167B-201ENST00000338272 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 GCNT2-201ENST00000265012 4214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 FCHSD2-201ENST00000311172 4340 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 PROX1-AS1-202ENST00000433082 5266 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 PROX1-202ENST00000366958 8240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 ADGRB3-203ENST00000546190 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 YOD1-202ENST00000367084 6291 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 PIH1D2-201ENST00000280350 1241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 RNA5SP319-201ENST00000362768 119 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 AL390774.1-201ENST00000411924 246 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 FAR2P2-201ENST00000413041 594 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 HMGA1P8-201ENST00000414130 321 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 LINC01687-201ENST00000416327 795 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 FAR2P4-202ENST00000425399 584 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 AL162727.2-201ENST00000428429 395 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 PIH1D2-202ENST00000431456 1245 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 AL162427.1-201ENST00000450399 439 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 CYP4F62P-203ENST00000455215 552 ntTSL 4 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 RPS18P6-201ENST00000476880 458 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 MGST2-204ENST00000506797 634 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 RPL37-204ENST00000508493 553 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 LINC00861-202ENST00000517869 606 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 SOX9-AS1-208ENST00000529667 340 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 OR6M2P-201ENST00000529831 871 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 TNFRSF17-201ENST00000053243 994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 AC025580.2-202ENST00000558536 715 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 AC079075.1-201ENST00000559543 878 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 RBM22P12-201ENST00000567098 1255 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 PINLYP-205ENST00000569031 557 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 MIR4646-201ENST00000580775 63 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 AC008109.1-201ENST00000583163 826 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 AC120349.1-201ENST00000599498 282 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 AL139099.4-201ENST00000614802 114 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 MIR8089-201ENST00000620165 82 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 AC132068.1-201ENST00000623805 459 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 CTNND1-223ENST00000529986 5727 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 FLRT3-201ENST00000341420 3971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 LINC01505-205ENST00000636028 2298 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 DLG2-203ENST00000376104 5139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 AC068733.2-201ENST00000605434 1418 ntBASIC7.52□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 VWA5A-203ENST00000392748 3419 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 TBC1D32-204ENST00000398212 3824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 BTRC-204ENST00000408038 5982 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 TNPO1P2-201ENST00000426249 2665 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 PDE4D-202ENST00000317118 2599 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 HSD17B13-202ENST00000328546 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 IFIT1B-201ENST00000371809 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 DPYD-202ENST00000370192 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 AL353751.1-201ENST00000354541 495 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 RNA5SP333-201ENST00000363466 118 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 RNA5SP334-201ENST00000364825 118 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 TPT1-204ENST00000379060 764 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 RNU6ATAC18P-201ENST00000408413 101 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 RAD23B-202ENST00000416373 3835 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 C7orf69-201ENST00000418326 675 ntTSL 4 BASIC7.52□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 AC099677.3-201ENST00000427081 395 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 RPSAP41-201ENST00000439695 860 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 MIR4435-2HG-209ENST00000441075 704 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 LINC00366-201ENST00000441430 435 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 HIGD1AP8-201ENST00000453927 274 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 RPL7P45-201ENST00000455851 743 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 RPL7P39-201ENST00000481157 744 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 RPS3AP15-201ENST00000483874 781 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 AC092436.4-201ENST00000510905 483 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 LINC02234-202ENST00000513288 705 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 AL049779.2-201ENST00000553847 315 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 HSPE1P2-201ENST00000554777 306 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 MRPS21P7-201ENST00000566937 238 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 AC139493.1-201ENST00000604368 397 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 LINC02246-206ENST00000630211 712 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 NBPF19-206ENST00000621744 14425 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 SLC16A4-201ENST00000369779 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 ZNF761-203ENST00000454407 3967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 LINC02532-208ENST00000602621 2232 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 ADGRL3-214ENST00000511324 5042 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 ZC3H11A-204ENST00000367214 3451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 SEC31A-226ENST00000508479 3397 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 TMED10-201ENST00000303575 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 OFD1P17-201ENST00000437639 3018 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 SPATA31C1-201ENST00000420021 3895 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 SYT4-201ENST00000255224 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 IL21-AS1-201ENST00000417927 3748 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 SLC24A5-204ENST00000482911 2984 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 KCNN3-205ENST00000618040 13057 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 AC004852.2-201ENST00000614289 2218 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
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