Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 RNA5SP308-201ENST00000362532 115 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
USF2Q15853 RNU1-5P-201ENST00000362684 144 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
USF2Q15853 SNORD35A-201ENST00000363389 86 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
USF2Q15853 BMS1P3-201ENST00000372011 932 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
USF2Q15853 SLC3A1-203ENST00000409294 792 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
USF2Q15853 LINC01821-201ENST00000419786 1084 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
USF2Q15853 AL157884.1-201ENST00000424561 454 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
USF2Q15853 AL589794.1-201ENST00000424971 390 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
USF2Q15853 BX276092.6-201ENST00000430476 250 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
USF2Q15853 PSMD8P1-201ENST00000436275 769 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
USF2Q15853 AC003685.1-201ENST00000440430 466 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
USF2Q15853 AL663074.2-201ENST00000440621 479 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
USF2Q15853 BMS1P11-201ENST00000442351 885 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
USF2Q15853 AL139161.1-201ENST00000443207 190 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
USF2Q15853 AL020997.1-201ENST00000446554 349 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
USF2Q15853 AL022237.1-201ENST00000446663 358 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
USF2Q15853 BX276092.8-201ENST00000455722 250 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
USF2Q15853 BMS1P9-201ENST00000457640 885 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
USF2Q15853 AL445687.2-201ENST00000458156 728 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
USF2Q15853 GTPBP8-204ENST00000467752 686 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
USF2Q15853 AC020779.1-201ENST00000478757 796 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
USF2Q15853 AC008410.1-201ENST00000483777 339 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
USF2Q15853 RN7SL655P-201ENST00000486087 298 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
USF2Q15853 AC078785.1-205ENST00000491578 482 ntTSL 4 BASIC4.91□□□□□ -1.62
USF2Q15853 AC093870.1-201ENST00000506837 213 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
USF2Q15853 AP002981.1-201ENST00000517692 975 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
USF2Q15853 AC107918.3-201ENST00000533272 382 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
USF2Q15853 TAS2R46-201ENST00000533467 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.91□□□□□ -1.62
USF2Q15853 AC090651.1-201ENST00000567865 634 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
USF2Q15853 C16orf97-205ENST00000568524 406 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
USF2Q15853 CHMP1B-AS1-201ENST00000586474 553 ntTSL 4 BASIC4.91□□□□□ -1.62
USF2Q15853 AC012254.2-203ENST00000588705 561 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
USF2Q15853 AC087468.1-201ENST00000604365 630 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
USF2Q15853 LINC00635-219ENST00000608506 482 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
USF2Q15853 CDC37L1-AS1-202ENST00000609131 235 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
USF2Q15853 AL139407.1-201ENST00000613826 1175 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
USF2Q15853 AL009031.1-202ENST00000632370 886 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
USF2Q15853 SUPT3H-206ENST00000637763 498 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
USF2Q15853 AL445623.2-201ENST00000640307 4805 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
USF2Q15853 MMP12-201ENST00000571244 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
USF2Q15853 IPO5-201ENST00000261574 6003 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
USF2Q15853 PHTF2-208ENST00000450574 2516 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
USF2Q15853 MTHFD2L-201ENST00000325278 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
USF2Q15853 CXCL8-201ENST00000307407 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
USF2Q15853 EEF1A1P21-201ENST00000512363 1344 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
USF2Q15853 PCDH9-203ENST00000456367 5072 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
USF2Q15853 PTPRO-203ENST00000442921 3030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
USF2Q15853 RLIMP2-201ENST00000427891 1563 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
USF2Q15853 HSPA8P17-201ENST00000427029 1382 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
USF2Q15853 AC004076.2-201ENST00000620532 3323 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
USF2Q15853 AC087473.1-201ENST00000561320 2471 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
USF2Q15853 PHC3-217ENST00000497658 2087 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
USF2Q15853 AC005702.3-201ENST00000585345 1447 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
USF2Q15853 N4BP2L1-209ENST00000530622 1897 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
USF2Q15853 OR10A6-203ENST00000641238 6052 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.62
USF2Q15853 EDA2R-202ENST00000374719 3418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
USF2Q15853 AC138409.2-201ENST00000514048 5001 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
USF2Q15853 FMN1-202ENST00000334528 12355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
USF2Q15853 AASDH-201ENST00000205214 3590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
USF2Q15853 XAGE3-201ENST00000346279 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
USF2Q15853 SLC30A7-201ENST00000357650 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
USF2Q15853 AC022826.2-201ENST00000358757 776 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.9□□□□□ -1.63
USF2Q15853 SNORD16-201ENST00000362803 99 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
USF2Q15853 ATP5EP2-201ENST00000381026 385 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
USF2Q15853 SNORA7A-201ENST00000384765 139 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
USF2Q15853 AC026310.1-201ENST00000396004 378 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
USF2Q15853 MTND4LP21-201ENST00000415303 295 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
USF2Q15853 AL139184.1-202ENST00000422303 222 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
USF2Q15853 AC083862.1-201ENST00000427378 1242 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
USF2Q15853 RPS27AP6-201ENST00000427962 448 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
USF2Q15853 MED28P4-201ENST00000433137 572 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
USF2Q15853 LRRC23-208ENST00000436789 796 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
USF2Q15853 AL138767.3-201ENST00000438082 495 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
USF2Q15853 LINC01449-201ENST00000440213 1220 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
USF2Q15853 RPL5P25-201ENST00000441148 775 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
USF2Q15853 COL11A2P1-205ENST00000441798 676 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
USF2Q15853 MTND4LP12-201ENST00000448237 295 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
USF2Q15853 NPM1P39-201ENST00000449818 867 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
USF2Q15853 AC006947.1-201ENST00000457168 484 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
USF2Q15853 AC018450.1-202ENST00000465880 529 ntTSL 4 BASIC4.9□□□□□ -1.63
USF2Q15853 RN7SL221P-201ENST00000466190 281 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
USF2Q15853 FAM107B-217ENST00000478076 790 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.9□□□□□ -1.63
USF2Q15853 AC124242.1-202ENST00000499554 1052 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
USF2Q15853 LINC01598-206ENST00000513381 499 ntTSL 4 BASIC4.9□□□□□ -1.63
USF2Q15853 LNX1-AS1-204ENST00000514364 495 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
USF2Q15853 ATP6V0E1-202ENST00000517669 502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
USF2Q15853 AC010834.1-201ENST00000517998 696 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
USF2Q15853 AZIN1-AS1-211ENST00000520455 480 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
USF2Q15853 OR4A40P-201ENST00000533878 948 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
USF2Q15853 AC006065.4-204ENST00000537478 654 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
USF2Q15853 AC006065.4-203ENST00000541065 526 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
USF2Q15853 OR4C49P-201ENST00000563891 900 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
USF2Q15853 AC133552.4-201ENST00000576103 676 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
USF2Q15853 RN7SL32P-201ENST00000580514 281 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
USF2Q15853 AP001381.1-201ENST00000584109 534 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
USF2Q15853 ZNF814-214ENST00000600634 461 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
USF2Q15853 AC022001.1-201ENST00000605193 268 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
USF2Q15853 WDR11-AS1-204ENST00000608667 522 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
USF2Q15853 Metazoa_SRP.134-201ENST00000610965 327 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
USF2Q15853 AC103703.1-201ENST00000634783 663 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
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