Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 DGKB-203ENST00000403951 6917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 KBTBD3-201ENST00000526793 3751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 SSX3-201ENST00000298396 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 AC107977.1-201ENST00000355745 939 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 RNA5SP273-201ENST00000362484 113 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 RNA5SP433-201ENST00000364491 114 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 APOOL-201ENST00000373173 1279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 STMN1-202ENST00000374291 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 TYRP1-201ENST00000381136 872 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 RNU2-18P-201ENST00000411224 162 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 FO393401.1-203ENST00000416260 486 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 RPL24P2-201ENST00000421023 475 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 DPYD-IT1-201ENST00000424982 401 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 LINC01363-202ENST00000428030 930 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 TSSK4-203ENST00000428351 576 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 RPL34P27-201ENST00000428810 349 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 DEFA9P-201ENST00000433042 285 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 LINC00383-201ENST00000433664 817 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 AL391097.2-201ENST00000435057 485 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 KRT8P51-201ENST00000438938 274 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 AL158850.1-201ENST00000441249 914 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 CASP5-205ENST00000444749 1237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 RSU1P1-201ENST00000453416 441 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 AL021940.1-201ENST00000454271 677 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 AL157777.1-201ENST00000468100 304 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 WASHC5-AS1-201ENST00000519140 587 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 AC246817.1-201ENST00000520024 610 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 CASP5-209ENST00000531367 879 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 PCNAP4-201ENST00000532690 730 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 AC009396.2-201ENST00000555954 700 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 AL356801.1-201ENST00000559320 294 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 Six3os1_2.1-201ENST00000616963 217 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 AL157762.1-201ENST00000619612 415 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 AC129778.1-202ENST00000623812 261 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 PCBP1-AS1-282ENST00000625783 826 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 MAPKBP1-217ENST00000627631 210 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 AL591379.1-207ENST00000635982 261 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 AMYH02020865.1-205ENST00000636189 261 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 OR11H2-202ENST00000641517 1085 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 CNTNAP4-205ENST00000476707 4355 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 KIF27-204ENST00000413982 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 PSG4-201ENST00000244295 1629 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 GPN1-205ENST00000458167 1618 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 KRT222-202ENST00000394052 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 SLC39A12-201ENST00000377369 2808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 INPP4B-214ENST00000508116 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 MECOM-202ENST00000433243 3508 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 CHST9-203ENST00000618847 11388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 PSD3-204ENST00000440756 11690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 ESRRG-224ENST00000616180 5194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 PHC3-214ENST00000494943 5030 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 MMP13-201ENST00000260302 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 ASXL2-203ENST00000435504 12878 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 ZNF682-201ENST00000358523 2161 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 FBXL21-201ENST00000297158 1305 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 CLEC2D-202ENST00000261340 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 CRYGS-201ENST00000307944 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 RNA5SP477-201ENST00000362639 119 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 AL356476.1-201ENST00000421481 480 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 AC015983.1-201ENST00000441577 373 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 MEOX2-AS1-201ENST00000442176 697 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 MIS18A-AS1-201ENST00000453549 769 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 FRG2FP-204ENST00000453982 852 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 AC006539.1-201ENST00000481419 501 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 RN7SL57P-201ENST00000493687 290 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 CBX1-205ENST00000495350 550 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 OR5H7P-201ENST00000514084 930 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 HAND2-AS1-235ENST00000515376 951 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 Y_RNA.667-201ENST00000516212 107 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 RNA5SP438-201ENST00000516561 112 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 CETN3-206ENST00000522864 738 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 NEDD8-203ENST00000524927 653 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 TOMM20P1-201ENST00000534518 427 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 LINC02319-201ENST00000555852 349 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 AC006530.1-201ENST00000555980 571 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 LINC02345-203ENST00000558897 405 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 AC090826.1-203ENST00000569235 490 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 TMEM159-205ENST00000572599 713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 AP001011.1-201ENST00000583546 690 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 AC025262.3-201ENST00000623666 360 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 ATM-229ENST00000639953 587 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 HEATR1-203ENST00000366582 8447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 OR5AS1-202ENST00000641320 7860 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 LINC00309-201ENST00000431020 3307 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 SLC7A11-201ENST00000280612 9645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 OR2AT4-202ENST00000641504 8661 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 GTDC1-207ENST00000409298 2209 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 ZNF480-204ENST00000490272 2238 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 TBC1D15-201ENST00000319106 2159 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 PDE10A-203ENST00000539869 4401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 VCAN-203ENST00000343200 9455 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 ZNF23-207ENST00000564528 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 CDC42BPA-201ENST00000334218 10134 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 ZNF850-202ENST00000591344 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 ELOVL6-202ENST00000394607 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 VPS13B-203ENST00000358544 14094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 CDKAL1-201ENST00000274695 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 CPS1-IT1-201ENST00000628368 2306 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 PDZK1P1-202ENST00000425209 1350 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 BPY2-201ENST00000331070 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
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