Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 AC012005.2-201ENST00000624333 397 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 SPTY2D1-AS1-206ENST00000636011 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 AC096921.2-201ENST00000561507 1916 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 ZFY-207ENST00000625061 2273 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 CCNT2P1-201ENST00000423082 1315 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 HDAC9-203ENST00000406072 4102 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 AL512283.1-201ENST00000606756 1384 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 HHLA2-209ENST00000489514 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 PNISR-202ENST00000438806 3142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 AASDH-210ENST00000602986 3480 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 DECR1-215ENST00000522161 1766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 AC068870.3-201ENST00000625077 2536 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 TCF7L2-222ENST00000627217 3680 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 CLASP2-205ENST00000461133 4814 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 LINC02227-201ENST00000619068 3748 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 CEP44-206ENST00000503780 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 ZNF679-202ENST00000421025 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 GRXCR2-201ENST00000377976 2002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 AC007842.1-201ENST00000597336 2039 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 ZNF436-201ENST00000314011 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 LINC01478-201ENST00000587877 2068 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 AL358975.1-203ENST00000413352 2932 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 MAP3K19-204ENST00000392915 5030 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 PCGF5-204ENST00000543648 7144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 LALBA-201ENST00000301046 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 CLEC7A-203ENST00000310002 425 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 OR13F1-201ENST00000334726 960 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 MIR133A2-201ENST00000347538 102 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 SEC61G-201ENST00000352861 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 ATP6V1E1-203ENST00000399798 994 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 AL136131.1-201ENST00000406079 803 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 AL353692.2-201ENST00000407054 335 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 GNRHR-202ENST00000420975 859 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 RPL23AP85-201ENST00000421838 433 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 C14orf105-202ENST00000422976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 AL354766.1-201ENST00000423396 542 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 ETF1P1-206ENST00000427296 984 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 AL357832.1-201ENST00000427460 420 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 RPL3P11-201ENST00000434028 1146 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 ARPP21-218ENST00000438071 1103 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 SCAND3P1-201ENST00000439854 1060 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 AL357052.1-201ENST00000443504 381 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
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BRD3Q15059 AC003991.1-202ENST00000447058 777 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 AC147651.1-201ENST00000453149 572 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 AL049829.1-201ENST00000465411 156 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
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BRD3Q15059 AC020611.2-201ENST00000535594 671 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 RACGAP1-216ENST00000548961 387 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 TMEM116-208ENST00000549537 1229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 UBE2N-204ENST00000549833 960 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 AC078814.2-201ENST00000552996 535 ntTSL 4 BASIC6.66□□□□□ -1.34
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BRD3Q15059 RMDN2-AS1-207ENST00000627614 765 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 TEX41-279ENST00000629149 609 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 MIR325HG-208ENST00000630388 1043 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
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BRD3Q15059 FRAS1-207ENST00000512123 15624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
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BRD3Q15059 C9-201ENST00000263408 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 UGGT1-201ENST00000259253 10650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
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BRD3Q15059 MROH2B-203ENST00000506092 3745 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 ZNF638-201ENST00000264447 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 AQP9-202ENST00000536493 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 PTPRT-201ENST00000356100 12480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
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BRD3Q15059 PTPRT-203ENST00000373187 12453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 LINC01422-201ENST00000434868 6043 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 IL1R1-204ENST00000409929 1858 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 OR52H1-201ENST00000322653 1057 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 SULT1C3-201ENST00000329106 915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 CD200R1L-201ENST00000398214 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 OR2A25-201ENST00000408898 1014 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 AC010082.1-201ENST00000411797 546 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 NR1I3-208ENST00000412844 989 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 AC114752.1-201ENST00000448204 289 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 MTND2P6-201ENST00000455337 1030 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 AL117382.2-201ENST00000455642 403 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 ST13P12-201ENST00000508958 1094 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 LINC01088-208ENST00000511895 795 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 SNORA26.10-201ENST00000516427 141 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 AC008632.1-202ENST00000518605 452 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 AC023866.2-201ENST00000521378 387 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 BAALC-AS1-208ENST00000523614 582 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 AP001978.1-201ENST00000526851 834 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 BCAS2P1-201ENST00000528022 632 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
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