Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 LINC01340-201ENST00000504012 724 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 SMR3B-202ENST00000504825 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 AC093815.1-201ENST00000508637 280 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 AC005699.1-204ENST00000509244 747 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 LINC02353-201ENST00000515181 849 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 RN7SKP141-201ENST00000516167 338 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 IGHVII-51-2-201ENST00000519778 259 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 AP001636.2-201ENST00000525517 696 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 AP003717.3-201ENST00000544832 1180 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 LINC02327-205ENST00000550990 472 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 IQCK-206ENST00000564186 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 AP003115.1-201ENST00000569849 463 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 RN7SL131P-201ENST00000579043 256 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 AC012254.4-201ENST00000588843 273 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 AC004223.2-201ENST00000590309 544 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 SIGLECL1-205ENST00000597824 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 NIFKP6-201ENST00000598115 845 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 AL353804.2-201ENST00000603360 347 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 AL159169.2-201ENST00000610061 1269 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 AC009283.1-201ENST00000615852 645 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 AC008115.4-201ENST00000619780 775 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 ASB8-218ENST00000629941 278 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 AC125613.1-204ENST00000636224 1248 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 OR1S2-202ENST00000641683 941 ntAPPRIS P1 BASIC6.11□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 ATP10D-201ENST00000273859 6655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 AJ009632.2-208ENST00000635525 4123 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 IL23R-201ENST00000347310 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 ZNF449-201ENST00000339249 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 SNW1-205ENST00000555761 1855 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 CHD8-202ENST00000430710 7420 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 PAIP1-202ENST00000338972 1814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 TRPC4-207ENST00000426868 2709 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 TRIM64-201ENST00000533122 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 ACPP-202ENST00000351273 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 AC005725.1-201ENST00000577346 2607 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 CASP10-208ENST00000448480 1603 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 AL391704.1-201ENST00000422206 2368 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 WDR35-201ENST00000281405 6918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 AP002800.1-201ENST00000624982 2225 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 ZNF233-205ENST00000592581 2938 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 ZNF737-201ENST00000427401 2867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 MFSD8-220ENST00000641243 1422 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 TMEM209-201ENST00000397622 3545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 MPDZ-219ENST00000546205 6342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 MAGI2-205ENST00000519748 3316 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 SV2B-202ENST00000394232 11279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 LINC01205-201ENST00000489670 1331 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 TBC1D5-201ENST00000253692 7854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
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RAB39AQ14964 RNA5SP429-201ENST00000363688 109 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 RNA5SP302-201ENST00000364896 100 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
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RAB39AQ14964 AL359922.1-201ENST00000404796 935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
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RAB39AQ14964 AP003472.2-201ENST00000523554 639 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 MIR4800-201ENST00000537353 80 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 LINC02454-201ENST00000539116 589 ntTSL 4 BASIC6.1□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 SPIC-201ENST00000551346 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 C14orf119-202ENST00000554203 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 RNASE11-208ENST00000555841 886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 AC013652.1-204ENST00000558209 489 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
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RAB39AQ14964 AC068020.1-201ENST00000594215 661 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 ZNF677-211ENST00000601828 719 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 AC130352.1-201ENST00000602979 661 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 AL365400.2-201ENST00000605604 902 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 GBA3-207ENST00000613293 1233 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 EDRF1-AS1-214ENST00000622798 526 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 AC120349.3-201ENST00000624377 529 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 MIR665-201ENST00000635949 72 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 CLVS1-203ENST00000518592 2880 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 OR8G5-203ENST00000641992 1560 ntAPPRIS P1 BASIC6.1□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 PUM1-207ENST00000440538 3936 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 VRK2-206ENST00000435505 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
RAB39AQ14964 ERAP2-202ENST00000437043 5705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
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