Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 AC006511.3-201ENST00000624929 1783 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 ZNF605-204ENST00000392321 6156 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 NCOA7-201ENST00000229634 2998 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 FBXO40-201ENST00000338040 5929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 ZNF254-206ENST00000611359 3982 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 TNKS-206ENST00000518281 3897 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 HSDL2-201ENST00000398803 2983 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 VTI1A-201ENST00000393077 4131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 FSHR-202ENST00000406846 2784 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 SPATA31C1-201ENST00000420021 3895 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 FGFR2-205ENST00000357555 3690 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 FAM32BP-201ENST00000344033 333 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 SNRPEP6-201ENST00000407465 277 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 SLC35E1P1-201ENST00000419313 864 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 AL360081.1-201ENST00000428299 555 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 AC092967.1-201ENST00000449016 481 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 AC096736.3-201ENST00000510753 993 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 LINC00534-203ENST00000523406 812 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 AC119868.1-202ENST00000584741 347 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 uc_338.26-201ENST00000612659 160 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 LINC01415-201ENST00000587320 4071 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 SRPX2-201ENST00000373004 6679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 PAX8-AS1-202ENST00000422956 11799 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 LINC01138-208ENST00000639159 1521 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 TRAPPC3L-201ENST00000356128 2421 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 ZNF484-202ENST00000375495 2867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 PSG1-206ENST00000595356 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 RAB27B-201ENST00000262094 7281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 FAM66C-201ENST00000372173 678 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 MIR765-201ENST00000390226 114 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 AC025946.1-201ENST00000413286 430 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 AC078960.1-201ENST00000422160 177 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 AL139415.1-201ENST00000424862 352 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 AL133329.1-201ENST00000437466 478 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 CYCSP12-201ENST00000437729 300 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 RN7SL269P-201ENST00000467795 305 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 RN7SL57P-201ENST00000493687 290 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 AC072052.1-201ENST00000496556 306 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 LNX1-AS1-204ENST00000514364 495 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 LINC02441-201ENST00000543651 552 ntTSL 4 BASIC7.37□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 AL929601.2-201ENST00000549951 381 ntTSL 4 BASIC7.37□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 MORF4L1-205ENST00000558502 855 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 AC096996.1-201ENST00000563813 325 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 AC055855.3-201ENST00000564269 578 ntTSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 AL023583.1-201ENST00000607518 1143 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 Metazoa_SRP.193-201ENST00000622007 277 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 THAP6-201ENST00000311638 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 KNL1-201ENST00000346991 9573 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 ADAM18-201ENST00000265707 2388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 EPS15P1-202ENST00000459691 2071 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 RAPH1-204ENST00000418114 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 RAPH1-205ENST00000419464 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 PRLR-208ENST00000509140 1610 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 SYT4-201ENST00000255224 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 GON4L-203ENST00000368331 7823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 OR1E1-201ENST00000322608 1307 ntAPPRIS P1 BASIC7.37□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 CNTNAP4-209ENST00000622250 3783 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 FASTKD2-203ENST00000403094 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 MAPK10-341ENST00000641657 3860 ntAPPRIS P2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 OR51B6-201ENST00000380219 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.37□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 AC016739.1-201ENST00000405359 345 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 AL096829.1-201ENST00000413677 457 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 AL359378.2-201ENST00000415575 746 ntTSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 SEPT14P12-201ENST00000442280 560 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 CUBNP2-201ENST00000443534 1139 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 RPS3AP15-201ENST00000483874 781 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 GCSAM-204ENST00000484193 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 RN7SL205P-201ENST00000490174 284 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 AC010343.2-201ENST00000510162 224 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 AC109361.2-202ENST00000512514 483 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 RNA5SP400-201ENST00000517155 111 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 MFAP5-205ENST00000535336 566 ntTSL 4 BASIC7.37□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 AC209154.1-201ENST00000582156 337 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 RN7SL52P-201ENST00000584271 284 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 Z98949.1-210ENST00000597548 766 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 SUGT1P3-202ENST00000604259 383 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 RN7SL722P-201ENST00000617780 284 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 RN7SL565P-201ENST00000618246 284 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 CTNND1-204ENST00000361796 6226 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 NLRP8-201ENST00000291971 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 PSG5-210ENST00000599812 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 AC119674.1-213ENST00000641177 1386 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 OR5AU1-202ENST00000641039 8232 ntAPPRIS P1 BASIC7.36□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 TIAM2-208ENST00000461783 6981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 NBPF12-204ENST00000613714 2701 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 GCNT3-201ENST00000396065 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 GOLGB1-202ENST00000393667 11198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 PLRG1-202ENST00000499023 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 AC096921.2-201ENST00000561507 1916 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 CD200R1-201ENST00000295863 1692 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 TRIM38-201ENST00000357085 9413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 OR2A12-202ENST00000641592 4163 ntAPPRIS P1 BASIC7.36□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 ING3-204ENST00000431467 1447 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 SPRY3-201ENST00000302805 9019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 TBC1D32-201ENST00000275159 4431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 CLIP4-202ENST00000401605 2322 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 AL133325.1-201ENST00000421090 382 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 AC108066.1-201ENST00000437261 596 ntTSL 4 BASIC7.36□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 AC016292.1-201ENST00000438344 235 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
CHD4Q14839 AC139720.1-201ENST00000509497 512 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.6 ms