Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 AC010643.1-201ENST00000599433 3263 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 THBS4-204ENST00000511733 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 EMP1-201ENST00000256951 5921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 SRP19-204ENST00000505459 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 RASSF2-202ENST00000379400 5427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 ZNF43-202ENST00000357491 5249 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 COL6A3-201ENST00000295550 10749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 CHODL-206ENST00000400135 2136 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 ADAM20P3-201ENST00000508710 2106 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 BHLHB9-205ENST00000457056 4082 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.19□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 AC233263.6-201ENST00000631132 1963 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 ADGRG1-202ENST00000456916 3860 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 ZBTB20-203ENST00000462705 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 AC093909.5-201ENST00000621839 1799 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 AC016909.2-201ENST00000424510 1711 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 NUDT5-207ENST00000491614 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 TBCK-203ENST00000394706 3349 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 GNAI1-205ENST00000457358 1633 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 ADAMTS9-AS1-203ENST00000471990 1606 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 LINC00963-202ENST00000419300 9557 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 PLA2G2C-201ENST00000247992 453 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 AC211476.4-201ENST00000275546 699 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 RIT2-201ENST00000326695 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 RAB19-201ENST00000356407 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 IGHV1-24-201ENST00000390610 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 EIF4A1P8-201ENST00000394444 1190 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 PMS2P5-201ENST00000398065 516 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 RPSAP35-201ENST00000413753 818 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 OR2L6P-201ENST00000416377 940 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 RBMY2JP-201ENST00000425544 1059 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 TXNP5-201ENST00000441043 315 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 PLCB1-IT1-201ENST00000441231 373 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 AL096855.1-201ENST00000449895 516 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 AC117462.1-201ENST00000461186 554 ntTSL 4 BASIC10.19□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 AP006259.1-201ENST00000528520 561 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 CBX5-204ENST00000550411 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 LINC02321-201ENST00000555975 384 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 AC010536.2-201ENST00000563036 338 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 AL049634.2-203ENST00000564763 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC10.19□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 LINC01444-202ENST00000581211 654 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 AC105224.1-201ENST00000587055 421 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 LINC01081-201ENST00000597373 465 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 AC011416.3-201ENST00000603971 355 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 AL136097.3-201ENST00000611097 505 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 RASSF8-215ENST00000611440 852 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 STRADA-224ENST00000617949 705 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 AC010378.1-201ENST00000619270 362 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 ADD3-AS1-203ENST00000625954 472 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 EAF1-AS1-212ENST00000626521 561 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 AC025678.3-201ENST00000623619 4824 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 TNFRSF10D-201ENST00000312584 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 SLC17A4-202ENST00000397076 2331 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 NCOA4-207ENST00000585132 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 LILRA2-201ENST00000251376 4429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 SLC19A3-201ENST00000258403 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 SH3GLB1-203ENST00000535010 6227 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 SPIN4-201ENST00000374884 4117 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 ITGA11-202ENST00000423218 10192 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 SIRT5-205ENST00000606117 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 AC079949.2-201ENST00000617117 2933 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 HK1-206ENST00000448642 3868 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 AC007731.1-202ENST00000610338 1870 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 STRADA-226ENST00000638276 1865 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 OR6K3-201ENST00000368145 1844 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 EIF4BP6-201ENST00000431936 1828 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 TXNDC8-201ENST00000374507 1787 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 PDZPH1P-201ENST00000412514 1783 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 COL6A3-204ENST00000392003 3464 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 MAGEB16-205ENST00000399992 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 LDB2-201ENST00000304523 2548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 MAK-201ENST00000313243 3984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 ZNF608-203ENST00000504926 4726 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 ENTPD1-210ENST00000543964 1579 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 RAD17-219ENST00000521422 2323 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 SLC8A1-202ENST00000402441 3065 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 RERE-203ENST00000400907 2973 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 AC099792.1-203ENST00000634701 2183 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 ANXA2-204ENST00000451270 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 GABRA1-219ENST00000638112 2818 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 PABPC4L-201ENST00000421491 4944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 OPTN-204ENST00000378752 3488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 RPL23AP7-202ENST00000416673 2078 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 TTC5-201ENST00000258821 4779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 ELOVL2-201ENST00000354666 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 AC092125.1-201ENST00000562568 1995 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 RNA5SP240-201ENST00000365355 128 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 FABP9-201ENST00000379071 497 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 RNU6-903P-201ENST00000391270 109 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 AL391417.1-201ENST00000404100 426 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 AL078604.1-201ENST00000404609 466 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 RNU4-25P-201ENST00000410569 230 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 AL359853.3-201ENST00000423879 544 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 PSMA6P3-201ENST00000428242 164 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 SNAI1P1-201ENST00000428587 777 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 AC073346.1-202ENST00000430610 544 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 BSNDP4-201ENST00000436076 388 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 AC005019.1-201ENST00000436455 431 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 AC092106.2-201ENST00000436597 487 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 MTND6P15-201ENST00000441157 521 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 AC006463.1-201ENST00000445929 232 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102 ms