Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 AC012594.1-254ENST00000628002 438 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 SAMMSON-227ENST00000642114 1199 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 SLC26A9-201ENST00000340781 4510 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 PCNX1-201ENST00000304743 12919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 ELOVL5-201ENST00000304434 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 RBM5-201ENST00000347869 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 OR2T10-202ENST00000642090 3519 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 GOSR2-238ENST00000640495 3395 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 AC245505.2-201ENST00000553572 3055 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 CD101-201ENST00000256652 3283 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 MTRNR2L7-201ENST00000544824 1535 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 SOSTDC1-202ENST00000396652 2411 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 COPS4-201ENST00000264389 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 IGF1R-206ENST00000558762 11726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 DCAF5-205ENST00000554215 4803 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 TTC21A-205ENST00000440121 3941 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 PTPRD-204ENST00000397606 5038 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 PTPRD-211ENST00000486161 5039 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 TGIF1-204ENST00000400167 1352 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 OR51D1-202ENST00000641817 3561 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 ACTBP13-201ENST00000423971 3959 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 MRO-211ENST00000610511 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 NLRP14-201ENST00000299481 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 XAF1-202ENST00000361842 3623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 AKT3-203ENST00000366539 5127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 SPTAN1-222ENST00000630804 7812 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 OAS2-207ENST00000620097 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 YIPF5-201ENST00000274496 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 FBXO11-202ENST00000403359 4055 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 AP003972.1-201ENST00000625192 5446 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 ZNF568-214ENST00000616085 3542 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 MAPK10-252ENST00000640970 2620 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 AC022150.4-201ENST00000598322 2848 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 HSFY1-202ENST00000309834 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 SULT1C3-201ENST00000329106 915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 HSFY2-202ENST00000344884 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 C1orf189-201ENST00000368525 387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 FABP9-201ENST00000379071 497 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 HMGB3P1-201ENST00000393368 573 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 RNU4-55P-201ENST00000410731 137 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 AL161742.1-201ENST00000418154 584 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 RPSAP1-201ENST00000421328 880 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 LINC01675-201ENST00000426519 701 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 AL591475.1-201ENST00000429060 489 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 VDAC2P3-201ENST00000430995 828 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 AL355357.1-201ENST00000433531 417 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 AC068533.3-201ENST00000435524 404 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 RPS26P30-201ENST00000443431 335 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 RPS10P28-201ENST00000480396 498 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 RPS3AP14-201ENST00000483907 780 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 LINC01322-202ENST00000494915 594 ntTSL 4 BASIC7.46□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 AC113383.1-205ENST00000502253 792 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 LYRM7-202ENST00000507584 317 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 LINC01085-203ENST00000511195 326 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
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CLN3Q13286 AC044839.1-209ENST00000529769 878 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 LINC01146-203ENST00000555996 459 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 AC092868.1-201ENST00000557949 802 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 CCDC32-210ENST00000559911 677 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
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CLN3Q13286 LINC01584-203ENST00000567231 646 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 AC027796.1-201ENST00000575593 512 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 AC006504.5-202ENST00000586784 656 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 RPL23AP77-201ENST00000588044 463 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 LINC02028-206ENST00000593326 810 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
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CLN3Q13286 TAS2R6P-201ENST00000605022 826 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 HNF4A-AS1-202ENST00000609152 413 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 AC243571.1-201ENST00000615743 478 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 TUG1_3.1-201ENST00000616187 237 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 AL160413.1-201ENST00000622780 310 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 NPLOC4-221ENST00000625705 405 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 SEPT14P19-202ENST00000632397 370 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 ATE1-AS1-202ENST00000636460 506 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 KCNK2-201ENST00000391894 1491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 SERPINA9-204ENST00000424550 1462 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 C2orf66-201ENST00000342506 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 TMEM108-203ENST00000508711 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 AC010886.1-201ENST00000437380 2869 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 LIMK2-201ENST00000331728 3670 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 TMEM144-216ENST00000514558 3699 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 AKAP3-201ENST00000228850 3339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 POU2F3-201ENST00000260264 2903 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 WDR87-202ENST00000447313 9009 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 NOX1-201ENST00000217885 1734 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 LINC01139-201ENST00000400946 1537 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 DCAF13P1-201ENST00000495256 1330 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 CEACAM1-213ENST00000599389 1342 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 OPALIN-205ENST00000536387 3392 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 PRICKLE2-201ENST00000295902 7918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 PBLD-202ENST00000309049 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 SPATS2L-227ENST00000619961 6115 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 AC092329.4-202ENST00000638174 1989 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 CHAF1B-201ENST00000314103 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 OR5AU1-202ENST00000641039 8232 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
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