Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 LINC01793-201ENST00000409590 2036 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PTPN11Q06124 AL023806.3-201ENST00000638502 2704 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPN11Q06124 UTP15-201ENST00000296792 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPN11Q06124 SYNPO2-203ENST00000434046 3588 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPN11Q06124 GDPD4-202ENST00000376217 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPN11Q06124 LINC00517-202ENST00000554257 3460 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPN11Q06124 AC121761.1-201ENST00000547326 1482 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPN11Q06124 ETV1-201ENST00000242066 6348 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPN11Q06124 FCF1-201ENST00000341162 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPN11Q06124 UTY-212ENST00000545955 6817 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPN11Q06124 AL355974.1-201ENST00000618896 1708 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPN11Q06124 KIAA1549L-201ENST00000265654 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPN11Q06124 LINC02047-201ENST00000494761 1371 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPN11Q06124 OSER1-202ENST00000372970 1616 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPN11Q06124 FGG-205ENST00000407946 1636 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPN11Q06124 YES1P1-201ENST00000418510 1628 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPN11Q06124 SLC26A5-208ENST00000393730 2498 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPN11Q06124 TMC5-206ENST00000561503 2487 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPN11Q06124 BLOC1S2-206ENST00000618916 2470 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPN11Q06124 LINC01699-201ENST00000319701 259 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPN11Q06124 RN7SKP237-201ENST00000364663 301 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPN11Q06124 AL590867.1-201ENST00000392385 1212 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPN11Q06124 AL391419.1-201ENST00000398901 1275 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPN11Q06124 LIX1L-AS1-202ENST00000412239 570 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPN11Q06124 VN1R31P-201ENST00000417498 730 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPN11Q06124 OFD1P11Y-201ENST00000418213 1177 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPN11Q06124 AL022100.2-201ENST00000422548 389 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPN11Q06124 CYP4F32P-201ENST00000426492 504 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPN11Q06124 AC079807.1-201ENST00000429993 481 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPN11Q06124 CFAP58-AS1-201ENST00000435434 795 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPN11Q06124 RAB9AP5-201ENST00000437794 597 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPN11Q06124 TRIM60P9Y-201ENST00000438459 816 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPN11Q06124 NPM1P33-201ENST00000438918 872 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPN11Q06124 DNAJA1P5-201ENST00000440278 943 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPN11Q06124 PIK3IP1-AS1-201ENST00000440456 554 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPN11Q06124 AL138878.2-201ENST00000440581 1241 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPN11Q06124 RPS10P18-201ENST00000442662 495 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPN11Q06124 RAB9AP2-201ENST00000443911 597 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPN11Q06124 TRIM60P11Y-201ENST00000445313 801 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPN11Q06124 AC144530.1-201ENST00000452862 555 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPN11Q06124 AC016724.1-201ENST00000453215 421 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPN11Q06124 RPL26P30-201ENST00000453533 435 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPN11Q06124 MTCO2P18-201ENST00000457151 658 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPN11Q06124 TNS3-209ENST00000458317 1156 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPN11Q06124 AC092754.2-201ENST00000463506 460 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPN11Q06124 AC099328.2-201ENST00000465347 455 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPN11Q06124 AC105918.1-201ENST00000474399 838 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPN11Q06124 AC004815.1-201ENST00000484185 331 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPN11Q06124 SLC9A9-AS2-201ENST00000490153 327 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPN11Q06124 RN7SL187P-201ENST00000495587 303 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPN11Q06124 AC020900.1-201ENST00000502568 565 ntTSL 4 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPN11Q06124 AC113367.2-201ENST00000505749 160 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPN11Q06124 HMGN1P16-201ENST00000508308 283 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPN11Q06124 LINC02147-201ENST00000509367 807 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPN11Q06124 AC013724.1-201ENST00000511962 783 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPN11Q06124 AC092593.2-201ENST00000513866 913 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPN11Q06124 RN7SKP248-201ENST00000516278 305 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPN11Q06124 AC090458.1-202ENST00000530387 462 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPN11Q06124 AC084816.1-202ENST00000536744 647 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
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PTPN11Q06124 AL161757.3-201ENST00000555316 807 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPN11Q06124 AC008015.1-201ENST00000555505 465 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPN11Q06124 AL132989.1-201ENST00000557322 576 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPN11Q06124 NDUFA5P11-201ENST00000567995 343 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPN11Q06124 PRELID3BP3-201ENST00000584963 545 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPN11Q06124 LINC02565-201ENST00000592678 478 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPN11Q06124 LINC01050-201ENST00000604485 760 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPN11Q06124 RMST_10.1-201ENST00000616309 154 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPN11Q06124 AC006338.2-201ENST00000616864 791 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPN11Q06124 OSER1-AS1-205ENST00000623343 827 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPN11Q06124 AC183089.2-201ENST00000637931 916 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPN11Q06124 CCDC195-201ENST00000638102 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPN11Q06124 GCNT2-218ENST00000640968 939 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPN11Q06124 AC116366.3-205ENST00000640655 8032 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPN11Q06124 LTA4H-209ENST00000552789 2025 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPN11Q06124 ITPR1-201ENST00000302640 10197 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPN11Q06124 AKR1C2-201ENST00000380753 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPN11Q06124 LINC01505-203ENST00000435485 1686 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPN11Q06124 BEST3-212ENST00000553096 2929 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPN11Q06124 TTTY2-201ENST00000417072 3168 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPN11Q06124 TTTY2B-201ENST00000450591 3168 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPN11Q06124 QTRT2-212ENST00000485050 3844 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPN11Q06124 BDNF-AS-201ENST00000499008 2324 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPN11Q06124 TBC1D23-205ENST00000475134 2074 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPN11Q06124 ZNF542P-204ENST00000482727 1305 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPN11Q06124 OR2AH1P-202ENST00000641232 2744 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPN11Q06124 MEPE-204ENST00000497649 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPN11Q06124 GABRA1-211ENST00000635880 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PTPN11Q06124 AP003119.3-201ENST00000566747 4192 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PTPN11Q06124 LINC01602-201ENST00000522992 2109 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PTPN11Q06124 C5orf34-201ENST00000306862 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PTPN11Q06124 SP140-205ENST00000420434 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PTPN11Q06124 KCNMB2-201ENST00000358316 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PTPN11Q06124 CDK1-202ENST00000373809 1613 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PTPN11Q06124 AL355306.2-202ENST00000634380 2281 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PTPN11Q06124 TRIM77-201ENST00000398290 1353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PTPN11Q06124 DDX43P1-201ENST00000510713 1763 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PTPN11Q06124 AP002001.1-202ENST00000525797 1754 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PTPN11Q06124 AC083864.3-202ENST00000570271 1755 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PTPN11Q06124 VPS13A-202ENST00000357409 9967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
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