Protein–RNA interactions for Protein: P78333

GPC5, Glypican-5, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC5P78333 MYL12B-202ENST00000400175 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
GPC5P78333 RPL23AP17-201ENST00000401064 499 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
GPC5P78333 LINC01372-201ENST00000430244 489 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
GPC5P78333 IGLV3-4-201ENST00000432300 244 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
GPC5P78333 AL096678.1-201ENST00000438877 472 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
GPC5P78333 LINC01449-201ENST00000440213 1220 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
GPC5P78333 AL035530.1-201ENST00000446887 331 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
GPC5P78333 NPM1P19-201ENST00000450070 712 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
GPC5P78333 AC073594.1-201ENST00000462065 364 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
GPC5P78333 CYP4F27P-201ENST00000514557 494 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
GPC5P78333 HAND2-AS1-235ENST00000515376 951 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
GPC5P78333 RN7SKP67-201ENST00000515905 235 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
GPC5P78333 SNORD46.2-201ENST00000516021 102 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
GPC5P78333 RNA5SP340-201ENST00000517132 107 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
GPC5P78333 AC091185.1-201ENST00000523840 528 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
GPC5P78333 AP000873.2-203ENST00000528524 549 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
GPC5P78333 UBE2N-204ENST00000549833 960 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
GPC5P78333 AL132800.1-201ENST00000555109 698 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
GPC5P78333 AL355075.2-201ENST00000555435 478 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
GPC5P78333 AC244502.3-201ENST00000555460 457 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
GPC5P78333 DAAM1-208ENST00000556135 582 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
GPC5P78333 AC007639.1-201ENST00000577281 833 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
GPC5P78333 SATB1-AS1-243ENST00000627546 589 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
GPC5P78333 COPS7B-225ENST00000631349 189 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
GPC5P78333 AC104461.1-201ENST00000637430 817 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
GPC5P78333 AC087269.2-201ENST00000641764 975 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
GPC5P78333 DNAJC16-202ENST00000375847 6069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
GPC5P78333 CFAP61-201ENST00000245957 4082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
GPC5P78333 AL359091.1-201ENST00000449048 1734 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
GPC5P78333 CHD8-202ENST00000430710 7420 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
GPC5P78333 ZNF525-201ENST00000467003 6107 ntTSL 4 BASIC6.61□□□□□ -1.35
GPC5P78333 IMMTP1-201ENST00000435590 2219 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
GPC5P78333 ZNF610-208ENST00000613461 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
GPC5P78333 NPIPB8-202ENST00000529716 2058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
GPC5P78333 MFSD8-201ENST00000296468 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
GPC5P78333 NAT1-209ENST00000541942 1948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
GPC5P78333 PSG1-206ENST00000595356 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
GPC5P78333 KIAA1109-201ENST00000264501 15896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
GPC5P78333 MOCS2-201ENST00000361377 3568 ntTSL 4 BASIC6.6□□□□□ -1.35
GPC5P78333 GNS-202ENST00000418919 4877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
GPC5P78333 GBP3-202ENST00000370481 3067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
GPC5P78333 AC019080.1-201ENST00000397057 5202 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
GPC5P78333 ZNF107-201ENST00000344930 5174 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
GPC5P78333 PPIL1-201ENST00000373699 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
GPC5P78333 OR2B6-201ENST00000244623 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
GPC5P78333 TMEM202-201ENST00000341689 1012 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
GPC5P78333 POU1F1-201ENST00000344265 1149 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
GPC5P78333 RNU1-59P-201ENST00000364829 162 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
GPC5P78333 C1orf194-203ENST00000369948 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
GPC5P78333 AC087752.1-201ENST00000391360 558 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
GPC5P78333 ESRRG-208ENST00000391890 5542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
GPC5P78333 ODF2-AS1-201ENST00000420801 407 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
GPC5P78333 AL021408.1-201ENST00000430428 552 ntTSL 4 BASIC6.6□□□□□ -1.35
GPC5P78333 LYPLA1P1-201ENST00000434514 622 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
GPC5P78333 MTND4P15-201ENST00000437913 1033 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
GPC5P78333 CATSPER2P1-205ENST00000446479 419 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
GPC5P78333 AC112187.1-201ENST00000455837 479 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
GPC5P78333 AL445687.2-201ENST00000458156 728 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
GPC5P78333 NXT1P1-201ENST00000458481 316 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
GPC5P78333 AC117386.1-201ENST00000474444 606 ntTSL 4 BASIC6.6□□□□□ -1.35
GPC5P78333 ARPP21-231ENST00000474696 572 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
GPC5P78333 RN7SL326P-201ENST00000477493 296 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
GPC5P78333 AL035690.1-201ENST00000490892 383 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
GPC5P78333 CRNDE-201ENST00000501177 614 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
GPC5P78333 AL158068.1-201ENST00000506116 616 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
GPC5P78333 MGC32805-204ENST00000509993 783 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
GPC5P78333 MOCS2-206ENST00000510818 1251 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
GPC5P78333 KHDC1P1-201ENST00000511053 508 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
GPC5P78333 OR5H7P-201ENST00000514084 930 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
GPC5P78333 SNORA26.10-201ENST00000516427 141 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
GPC5P78333 RN7SKP238-201ENST00000516483 249 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
GPC5P78333 RNA5SP271-201ENST00000516700 88 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
GPC5P78333 AC021733.2-201ENST00000518830 497 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
GPC5P78333 AC008429.4-201ENST00000521201 182 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
GPC5P78333 AC127522.1-201ENST00000560531 751 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
GPC5P78333 AP000842.3-201ENST00000564354 808 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
GPC5P78333 MTND4LP25-201ENST00000570218 163 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
GPC5P78333 NPM1P45-201ENST00000583151 559 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
GPC5P78333 MOCS2-210ENST00000584946 736 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
GPC5P78333 AL138900.3-201ENST00000607010 629 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
GPC5P78333 U1.25-201ENST00000614085 162 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
GPC5P78333 U1.34-201ENST00000618578 162 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
GPC5P78333 U1.31-201ENST00000620022 160 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
GPC5P78333 Metazoa_SRP.130-201ENST00000622625 267 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
GPC5P78333 AC079298.3-203ENST00000623269 555 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
GPC5P78333 AC099329.1-203ENST00000629885 767 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
GPC5P78333 FAR2-201ENST00000182377 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
GPC5P78333 LGSN-204ENST00000622415 1612 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
GPC5P78333 MNS1-201ENST00000260453 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
GPC5P78333 NSD1-201ENST00000347982 7688 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
GPC5P78333 AP2B1-211ENST00000610402 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
GPC5P78333 THEMIS-206ENST00000630369 2786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
GPC5P78333 GDNF-AS1-202ENST00000510986 1941 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
GPC5P78333 TBC1D32-204ENST00000398212 3824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
GPC5P78333 INTS12-211ENST00000618810 1502 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
GPC5P78333 PTBP3-202ENST00000334318 7990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
GPC5P78333 ECT2-216ENST00000540509 4406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
GPC5P78333 AHNAK2-201ENST00000333244 18254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
GPC5P78333 AL121768.1-201ENST00000613917 2544 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
GPC5P78333 RABGEF1-202ENST00000380828 3864 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 141.6 ms