Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

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Length 1,445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 CNTN5-202ENST00000418526 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
PTPRGP23470 AC006213.6-201ENST00000623722 4179 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
PTPRGP23470 SMAD5-211ENST00000545279 7012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
PTPRGP23470 SENP1-201ENST00000448372 4679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
PTPRGP23470 GABRG3-201ENST00000333743 1235 ntTSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
PTPRGP23470 DAP3-209ENST00000465375 729 ntTSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.96
PTPRGP23470 AC007686.1-201ENST00000488511 463 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
PTPRGP23470 LINC01598-206ENST00000513381 499 ntTSL 4 BASIC9.08□□□□□ -0.96
PTPRGP23470 AC073581.1-201ENST00000519036 575 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
PTPRGP23470 AC006116.3-201ENST00000592968 361 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
PTPRGP23470 AC010320.2-203ENST00000601745 574 ntTSL 4 BASIC9.08□□□□□ -0.96
PTPRGP23470 AF131216.1-201ENST00000498997 5856 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
PTPRGP23470 CTNND1-233ENST00000532787 5751 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
PTPRGP23470 AL133243.4-201ENST00000623116 3109 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
PTPRGP23470 RBFOX2-205ENST00000405409 6932 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
PTPRGP23470 DCN-204ENST00000425043 1438 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
PTPRGP23470 DOCK8-204ENST00000432829 7452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
PTPRGP23470 PARP4P1-201ENST00000435945 2337 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
PTPRGP23470 PBRM1-207ENST00000409767 4849 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
PTPRGP23470 DLGAP1-AS2-202ENST00000573177 1388 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
PTPRGP23470 EIF5AL1-201ENST00000520547 3840 ntAPPRIS P1 BASIC9.08□□□□□ -0.96
PTPRGP23470 DNA2-208ENST00000551118 3468 ntTSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
PTPRGP23470 PARN-201ENST00000341484 2100 ntTSL 2 BASIC9.07□□□□□ -0.96
PTPRGP23470 RNU4-2-201ENST00000365668 141 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
PTPRGP23470 MRRF-207ENST00000373729 870 ntTSL 3 BASIC9.07□□□□□ -0.96
PTPRGP23470 MIR141-201ENST00000384975 95 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
PTPRGP23470 AC006335.2-201ENST00000437993 330 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
PTPRGP23470 AC015983.1-201ENST00000441577 373 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
PTPRGP23470 AC009220.1-201ENST00000451614 275 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
PTPRGP23470 CEACAMP10-202ENST00000495431 496 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
PTPRGP23470 AC106864.2-201ENST00000505632 740 ntTSL 2 BASIC9.07□□□□□ -0.96
PTPRGP23470 AC018709.1-201ENST00000509111 700 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.07□□□□□ -0.96
PTPRGP23470 NOP10-202ENST00000557912 436 ntTSL 2 BASIC9.07□□□□□ -0.96
PTPRGP23470 LINC02563-201ENST00000579474 277 ntTSL 3 BASIC9.07□□□□□ -0.96
PTPRGP23470 AC011840.5-201ENST00000582125 771 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
PTPRGP23470 AC024589.2-201ENST00000605642 1294 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
PTPRGP23470 GOLT1B-210ENST00000631252 223 ntTSL 3 BASIC9.07□□□□□ -0.96
PTPRGP23470 RAPH1-209ENST00000439222 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
PTPRGP23470 SCN8A-203ENST00000545061 11433 ntTSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
PTPRGP23470 IMMTP1-201ENST00000435590 2219 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
PTPRGP23470 SOX6-201ENST00000316399 8808 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
PTPRGP23470 MROH2B-203ENST00000506092 3745 ntTSL 2 BASIC9.07□□□□□ -0.96
PTPRGP23470 LINC02044-201ENST00000490139 2502 ntTSL 2 BASIC9.07□□□□□ -0.96
PTPRGP23470 PHIP-201ENST00000275034 10460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
PTPRGP23470 TESPA1-203ENST00000524622 4188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
PTPRGP23470 ZMYM2-210ENST00000610343 10200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
PTPRGP23470 ZNF480-204ENST00000490272 2238 ntTSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
PTPRGP23470 OR2J1-201ENST00000377171 1273 ntAPPRIS P1 BASIC9.06□□□□□ -0.96
PTPRGP23470 AC092675.1-201ENST00000409490 561 ntTSL 4 BASIC9.06□□□□□ -0.96
PTPRGP23470 NIFKP3-201ENST00000417799 865 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
PTPRGP23470 AL133325.1-201ENST00000421090 382 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
PTPRGP23470 RSRC1-207ENST00000475278 1195 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
PTPRGP23470 RPL7P6-201ENST00000480903 738 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
PTPRGP23470 LINC02224-201ENST00000505706 584 ntTSL 4 BASIC9.06□□□□□ -0.96
PTPRGP23470 NSMCE2-202ENST00000517315 996 ntTSL 3 BASIC9.06□□□□□ -0.96
PTPRGP23470 AC064807.2-201ENST00000521188 672 ntTSL 3 BASIC9.06□□□□□ -0.96
PTPRGP23470 PACRG-210ENST00000611387 279 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
PTPRGP23470 AC063952.1-204ENST00000635496 927 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
PTPRGP23470 MIA3-201ENST00000340535 2735 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
PTPRGP23470 G6PC-201ENST00000253801 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
PTPRGP23470 NPHP3-AS1-202ENST00000504440 2507 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
PTPRGP23470 ATXN2-215ENST00000542287 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
PTPRGP23470 PRRC2C-201ENST00000338920 10355 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
PTPRGP23470 ADAM21-201ENST00000603540 2658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.06□□□□□ -0.96
PTPRGP23470 LINC01722-201ENST00000456265 3033 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
PTPRGP23470 SEC31A-226ENST00000508479 3397 ntTSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
PTPRGP23470 CACNA2D3-212ENST00000620722 3296 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
PTPRGP23470 SLC15A2-205ENST00000489711 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
PTPRGP23470 DNAJC28-202ENST00000381947 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
PTPRGP23470 PCDH15-231ENST00000617271 6425 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
PTPRGP23470 NEDD9-202ENST00000379446 4536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
PTPRGP23470 POLR2B-202ENST00000381227 4108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
PTPRGP23470 ZNF286A-202ENST00000395894 5443 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
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PTPRGP23470 LINC01504-201ENST00000436054 2078 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
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PTPRGP23470 AL035416.1-201ENST00000443012 767 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
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PTPRGP23470 RPS18P6-201ENST00000476880 458 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
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PTPRGP23470 KCTD9P4-201ENST00000526766 1166 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
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PTPRGP23470 AC007448.2-201ENST00000583452 380 ntTSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
PTPRGP23470 FAM25E-202ENST00000608562 189 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
PTPRGP23470 AL731566.2-201ENST00000618971 317 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
PTPRGP23470 AP002799.1-201ENST00000623552 423 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
PTPRGP23470 LINC01739-205ENST00000641890 573 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
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PTPRGP23470 ZNF733P-202ENST00000444809 1573 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
PTPRGP23470 ZNF652-201ENST00000362063 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
PTPRGP23470 NSUN3-201ENST00000314622 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
PTPRGP23470 MCM8-205ENST00000610722 7486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
PTPRGP23470 INTS2-202ENST00000444766 5878 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
PTPRGP23470 UGT3A1-207ENST00000625798 3097 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
PTPRGP23470 RNF145-201ENST00000274542 3364 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
PTPRGP23470 DLC1-202ENST00000316609 1837 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
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