Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 535 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 REREP1Y-201ENST00000422655 198 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 MORF4L1P7-201ENST00000426038 703 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 AL136980.1-201ENST00000426764 543 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 AL035665.1-201ENST00000428495 1669 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 AC117944.1-201ENST00000430748 641 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 AL022324.2-201ENST00000434827 780 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 AC092106.2-201ENST00000436597 487 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 REREP2Y-201ENST00000439103 200 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 AC003685.1-201ENST00000440430 466 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 AC234771.4-201ENST00000441416 730 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 COL11A2P1-205ENST00000441798 676 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 DNAJC19P5-201ENST00000443295 316 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 AC114814.1-201ENST00000444926 691 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 MOB1AP2-201ENST00000446060 614 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 CABYRP1-201ENST00000465493 1045 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 NPM1P27-201ENST00000502784 830 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 PCNAP1-201ENST00000505363 709 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 AL158068.1-201ENST00000506116 616 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 AC093870.1-201ENST00000506837 213 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 AC124017.1-201ENST00000508112 1594 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 AC026782.2-201ENST00000510845 636 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 MTCO3P27-201ENST00000514397 196 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 RNU6-491P-201ENST00000516099 110 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 RNU6-889P-201ENST00000517189 103 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 AC113191.1-201ENST00000517759 403 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 AC018541.1-202ENST00000518687 584 ntTSL 4 BASIC6.12□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 FBXO16-207ENST00000518734 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 PKIA-AS1-201ENST00000519242 995 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 AC090103.1-201ENST00000520386 485 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 AC131254.2-201ENST00000521908 550 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 AC245519.1-201ENST00000522799 512 ntTSL 4 BASIC6.12□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 SOX5P1-201ENST00000524155 1127 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 C1DP5-201ENST00000525775 383 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 AP005639.1-201ENST00000526939 192 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 LGALS8-222ENST00000527974 1349 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 AC020611.2-201ENST00000535594 671 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 AC126755.2-201ENST00000545114 1522 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 AC090115.2-201ENST00000548060 883 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 AC139697.1-201ENST00000548429 745 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 OR11H2-201ENST00000556246 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.12□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 AL133163.3-201ENST00000556448 504 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 LINC00640-204ENST00000557295 708 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 AL096869.1-201ENST00000557622 559 ntTSL 4 BASIC6.12□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 AC027281.1-201ENST00000574178 758 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 TVP23B-209ENST00000581733 1258 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 AP000919.2-202ENST00000584431 673 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 ZNF780A-205ENST00000594395 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 AC019257.2-201ENST00000605539 497 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 BMS1P14-201ENST00000615056 606 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 AMY2A-204ENST00000622339 1862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 CU459211.1-201ENST00000635667 749 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 PHACTR2P1-202ENST00000636592 773 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 AC119674.1-213ENST00000641177 1386 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 FBXO25-204ENST00000382824 10386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 CAMSAP2-201ENST00000236925 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 GPR1-209ENST00000612892 2565 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.12□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 SETDB2-201ENST00000258672 2138 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 AC116158.1-201ENST00000560231 2129 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 CDKL5-205ENST00000623535 12533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 PTPRD-214ENST00000540109 6210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 DYNAP-201ENST00000321600 2027 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 POLK-210ENST00000508526 2019 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 TMEM133-201ENST00000303130 1953 ntAPPRIS P1 BASIC6.11□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 OR1A1-203ENST00000641732 3832 ntAPPRIS P1 BASIC6.11□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 ZCCHC6-201ENST00000277141 5724 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 CR1-201ENST00000367049 7470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 ICE2P1-201ENST00000512800 1849 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 MTO1-212ENST00000498286 10857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 KIAA2012-205ENST00000541917 3543 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 DDX47-201ENST00000352940 1698 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 AC021237.1-201ENST00000504175 1643 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 ASXL2-203ENST00000435504 12878 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 EIF1AY-201ENST00000361365 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 CASC19-255ENST00000641733 1385 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 SEPT7P7-201ENST00000420492 1301 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 OR8A1-201ENST00000284287 1146 ntAPPRIS P1 BASIC6.11□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 CLDN10-201ENST00000299339 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 HIST1H1T-201ENST00000338379 718 ntAPPRIS P1 BASIC6.11□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 OR5B21-201ENST00000360374 931 ntAPPRIS P1 BASIC6.11□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 RNU6-792P-201ENST00000363490 107 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 SNORD115-48-201ENST00000364764 76 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 AL353625.1-202ENST00000366273 571 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 PRR9-201ENST00000368744 1229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 SAMD13-203ENST00000370670 565 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.11□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 KLRC2-201ENST00000381901 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 KLRC2-202ENST00000381902 1221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 RNU6-1257P-201ENST00000384625 110 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 MRPL35-203ENST00000409180 651 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 GLS-203ENST00000409215 632 ntTSL 4 BASIC6.11□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 LURAP1L-AS1-201ENST00000417638 799 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 RPL12P43-201ENST00000420608 499 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 ZNF880-203ENST00000424032 558 ntTSL 4 BASIC6.11□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 E2F3-IT1-201ENST00000433182 400 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 LINC01878-201ENST00000434559 769 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 AL513321.1-201ENST00000441175 761 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 AL355355.1-201ENST00000442900 793 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 AL139161.1-201ENST00000443207 190 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 AL020997.1-201ENST00000446554 349 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 AL590399.3-202ENST00000448491 495 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 AL731661.2-201ENST00000448824 806 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
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