Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 SUCLG1-201ENST00000393868 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 CAST-202ENST00000325674 3356 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 CSDE1-201ENST00000261443 3228 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 FGFR1OP-202ENST00000366847 14166 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 TRRAP-202ENST00000359863 12677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 SUN3-203ENST00000412142 1448 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 SPANXN1-201ENST00000370493 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 AL589647.1-201ENST00000402485 466 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 AC113412.1-201ENST00000425840 504 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 AC097721.1-201ENST00000427150 1253 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 AL450023.1-201ENST00000450868 751 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 AC021678.3-201ENST00000517893 476 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 NRBF2P4-201ENST00000520874 850 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 POLR2K-203ENST00000522439 543 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 AC126177.5-201ENST00000549599 178 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 AC145423.1-201ENST00000605712 336 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 AL163952.1-201ENST00000612704 916 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 FAM47E-202ENST00000502320 6249 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 AFP-201ENST00000226359 1914 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 C4orf17-201ENST00000326581 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 AKAP5-202ENST00000394718 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 LINC01787-201ENST00000435311 1994 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 AC137056.2-201ENST00000624055 1958 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 ZNF701-202ENST00000391785 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 KIAA1210-201ENST00000402510 7824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 EIF4G2-208ENST00000526148 4001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 PLEKHA1-204ENST00000392799 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 OSBPL9-206ENST00000453295 2842 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 OR8K1-201ENST00000279783 1087 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 AMELX-202ENST00000380712 835 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 AMELX-203ENST00000380714 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 TRAJ58-201ENST00000390481 63 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 LYST-AS1-201ENST00000412098 521 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 AL139128.1-201ENST00000413921 941 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 GPC5-AS2-201ENST00000417589 401 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 CYCSP6-201ENST00000434498 302 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 CUBNP2-201ENST00000443534 1139 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 LINC01344-202ENST00000449842 571 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 BIRC6-AS1-201ENST00000455572 697 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 LDHBP2-201ENST00000456969 1005 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 LINC02083-201ENST00000462835 515 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 AC073288.1-201ENST00000466291 469 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 AC099521.1-201ENST00000482557 334 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 LINC02006-201ENST00000488210 524 ntTSL 4 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 LDHBP3-201ENST00000514909 822 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 RNA5SP400-201ENST00000517155 111 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 AC013644.1-202ENST00000523166 499 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 AP002336.3-201ENST00000526017 367 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 SNHG1-204ENST00000537068 629 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 AJ003147.1-201ENST00000576762 454 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 AC104996.1-201ENST00000583250 591 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 AC015878.1-201ENST00000584611 679 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 AC004448.4-204ENST00000585389 743 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 AL121612.2-201ENST00000612261 482 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 AL445528.2-201ENST00000620582 470 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 PRKCQ-AS1-218ENST00000624974 1132 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 PLCH1-206ENST00000494598 3525 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 MGAM-208ENST00000549489 6525 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 PLA2R1-201ENST00000283243 14371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 BX322650.1-201ENST00000332359 2143 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 LINC00598-211ENST00000636621 3241 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 CEACAMP10-201ENST00000489959 1721 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 CSNK2A1-204ENST00000400227 1499 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 AC062029.1-202ENST00000606164 3651 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 CCR6-201ENST00000341935 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 TCF12-214ENST00000559710 1314 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 AC096921.2-201ENST00000561507 1916 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 PTK2-201ENST00000340930 4414 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 AC105749.1-201ENST00000631338 2008 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 AMOT-206ENST00000524145 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 FGA-201ENST00000302053 3678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 C15orf54-202ENST00000625107 3078 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 GRIK1-201ENST00000327783 3179 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 ANGPT1-205ENST00000520052 1523 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 EIF4A2-205ENST00000440191 1889 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 NBPF14-209ENST00000620240 2656 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 RN7SKP103-201ENST00000363848 320 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 OR51B6-201ENST00000380219 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 AC096669.1-202ENST00000413708 616 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 PTCD2P2-201ENST00000415579 1095 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 VDAC1P2-201ENST00000423609 850 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 AL353148.1-202ENST00000424701 551 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 DPH5-204ENST00000427040 609 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 AL772161.1-201ENST00000439130 476 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 EIF4EBP2P1-201ENST00000450009 343 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 AC034195.1-203ENST00000455703 728 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 GYG1P1-201ENST00000460864 698 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 RN7SL97P-201ENST00000486780 299 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 BACH1-IT1-201ENST00000504298 821 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 LINC02147-201ENST00000509367 807 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 ZNF346-IT1-201ENST00000515264 745 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 AC087664.2-202ENST00000521274 515 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 DCN-210ENST00000547568 823 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 SLC25A3P1-203ENST00000563752 460 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 TTN-AS1-222ENST00000587576 399 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 IGLCOR22-2-201ENST00000605398 313 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 AL158211.2-201ENST00000607282 395 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 AC092953.2-201ENST00000608000 699 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 AL392046.2-202ENST00000635301 1113 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PTF1AQ7RTS3 IFIT1-202ENST00000546318 4613 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
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