Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYG4

BBS9, Protein PTHB1, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS9Q3SYG4 LRRC37A3-203ENST00000339474 2589 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 RBPJ-214ENST00000507561 1689 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 DDX18P5-201ENST00000534547 1306 ntBASIC7.02□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 KCNJ15-201ENST00000328656 8399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 ELMO1-202ENST00000396040 1982 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 AL133268.1-201ENST00000405676 1401 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 ADAM18-206ENST00000520772 1429 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 CASC19-243ENST00000641588 1546 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 FAM111B-201ENST00000343597 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 FRYL-202ENST00000358350 11706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 FGFR2-205ENST00000357555 3690 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 CYP51A1-204ENST00000450723 1729 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 AC005034.3-201ENST00000604845 1747 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 AC112243.1-201ENST00000623949 3851 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 CEACAM5-202ENST00000398599 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 ARL14EPL-201ENST00000601302 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 LINC02197-201ENST00000502659 2767 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 CLEC4A-204ENST00000360500 597 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 Y_RNA.51-201ENST00000362725 102 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 RNU6-236P-201ENST00000363886 106 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 RNU5A-2P-201ENST00000384337 116 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 GSTA8P-201ENST00000404253 637 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 OFD1P11Y-201ENST00000418213 1177 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 AC118470.1-201ENST00000419891 453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 AL589946.1-201ENST00000421465 420 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 GTF2IP2-201ENST00000424290 697 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 LINC01522-201ENST00000428999 429 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 AC092811.1-202ENST00000433058 656 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 TRIM60P9Y-201ENST00000438459 816 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 AC016644.1-201ENST00000438553 434 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 AC016396.1-201ENST00000440189 328 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 NPM1P23-201ENST00000440193 849 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 TRIM60P11Y-201ENST00000445313 801 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 AC104978.1-201ENST00000449387 391 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 AL358612.1-201ENST00000452911 481 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 AL391422.2-202ENST00000454396 347 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 AC244505.3-201ENST00000454598 187 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 AC010878.1-201ENST00000456500 1047 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 RPLP0P1-201ENST00000457002 361 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 CTSLP6-201ENST00000458273 1002 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 RPL5P13-201ENST00000462840 709 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 AC008620.1-201ENST00000468453 592 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 AC079944.1-201ENST00000485426 495 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 AC063943.2-201ENST00000495697 534 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 RN7SL182P-201ENST00000496499 300 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 PGRMC2-204ENST00000503872 1028 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 AC021220.1-201ENST00000507445 630 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 AC016559.1-201ENST00000511420 199 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 LINC02057-202ENST00000511794 577 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 AC097460.2-201ENST00000511857 741 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 AC097535.1-201ENST00000515263 332 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 RNU6-1129P-201ENST00000515964 104 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 RN7SKP34-201ENST00000516142 244 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 RN7SKP141-201ENST00000516167 338 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 AC083967.1-201ENST00000522354 515 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 HMGB1P1-201ENST00000522557 636 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 ASPH-224ENST00000522603 842 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 AF117829.1-205ENST00000524190 383 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 EEF1A1P17-201ENST00000547505 1275 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 LYZ-202ENST00000548839 558 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 AL391156.1-201ENST00000554965 554 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 FRMD6-AS2-202ENST00000557625 581 ntTSL 4 BASIC7.02□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 IDH3A-223ENST00000561366 389 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 AC244034.2-201ENST00000562504 509 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 AL354943.1-201ENST00000572103 781 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 AC021506.1-201ENST00000581971 597 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 AC061975.3-201ENST00000583209 244 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 STARD6-204ENST00000584040 660 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 AC015688.2-201ENST00000584523 262 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 AC005323.1-203ENST00000585303 566 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 TPGS2-204ENST00000587129 841 ntTSL 4 BASIC7.02□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 LINC02565-201ENST00000592678 478 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 AL020997.3-201ENST00000602843 359 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 AC095055.1-201ENST00000603472 1113 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 AL136139.1-201ENST00000605568 222 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 GMDS-AS1-215ENST00000606884 580 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 AL591686.2-201ENST00000608241 475 ntTSL 4 BASIC7.02□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 AC006338.2-201ENST00000616864 791 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 KBTBD2-208ENST00000621876 1196 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 CGA-204ENST00000627148 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 AL596275.2-207ENST00000641188 675 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 AC008957.3-201ENST00000624112 2242 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 A1CF-206ENST00000395489 9517 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 ATF7IP-201ENST00000261168 8878 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 PHF11-201ENST00000357596 1471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 LINC01011-204ENST00000605901 1573 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 AL390726.6-201ENST00000637760 1654 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 SMC1A-202ENST00000375340 9930 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 LINC00922-203ENST00000569736 1760 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 TCF7L2-218ENST00000538897 4000 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 ATP10D-203ENST00000504445 2550 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 LINC01232-204ENST00000626729 2796 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 DLG2-230ENST00000532653 2891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 ANKRD44-202ENST00000328737 3686 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 TTC3-201ENST00000354749 9084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 GOT2P1-201ENST00000440922 1309 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 ADA2-206ENST00000449907 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 ACACA-240ENST00000617649 7912 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 CASP10-208ENST00000448480 1603 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
BBS9Q3SYG4 HBS1L-206ENST00000415177 2636 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
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