Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 INPP4B-206ENST00000506217 673 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 AC109588.1-201ENST00000507759 726 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 AC116345.3-201ENST00000508255 449 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 C4orf22-205ENST00000508675 753 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 FABP5P6-201ENST00000510588 409 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 AC097515.1-201ENST00000512370 435 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 AC093772.1-201ENST00000513519 506 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 AC079015.1-201ENST00000521793 596 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 AC018953.1-201ENST00000523265 730 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 OR4V1P-201ENST00000525394 1140 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 LINC00640-204ENST00000557295 708 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 AC022405.1-201ENST00000559841 516 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 AC024361.3-201ENST00000570919 333 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 MIR378C-201ENST00000578683 81 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 LINC00663-202ENST00000586816 306 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 AC006305.3-201ENST00000590589 454 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 AC010487.1-201ENST00000594408 1172 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 AL513327.3-201ENST00000602618 469 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 AC004805.3-201ENST00000603178 310 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 AC242628.1-201ENST00000606810 391 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 AC110792.4-201ENST00000609843 298 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 PLSCR2-207ENST00000613069 1208 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 AL132821.1-201ENST00000616029 394 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 ALKAL2-208ENST00000619265 496 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 AL138693.1-201ENST00000622219 129 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 AL139220.2-221ENST00000628123 395 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 GBP3-202ENST00000370481 3067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 DNM3OS-201ENST00000417354 4358 ntTSL 4 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 AC007938.2-201ENST00000604666 2634 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 AC007750.1-202ENST00000418968 4098 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 SMAD5-211ENST00000545279 7012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 LINC00598-206ENST00000615947 3541 ntTSL 4 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 LINC02019-201ENST00000608605 2060 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 TNFSF4-202ENST00000367718 3429 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 BRIP1-201ENST00000259008 6048 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 OR8J3-204ENST00000642058 3806 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 RYR3-208ENST00000622037 15564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 CASC19-238ENST00000641523 1558 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 SDAD1-203ENST00000395711 2513 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 ELMO1-203ENST00000396045 2524 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 AC120036.2-201ENST00000509729 1474 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 ZNF215-205ENST00000529903 1396 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 N4BP2L2-IT2-201ENST00000629393 4890 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 GPR174-201ENST00000276077 1258 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 SPATA45-201ENST00000332912 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 OR2AK2-201ENST00000366480 1154 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 STMN1-202ENST00000374291 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 CD200R1L-201ENST00000398214 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 AL355143.1-201ENST00000407101 841 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 RNA5SP431-201ENST00000410312 120 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 RANP6-201ENST00000413691 644 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 NIF3L1-206ENST00000416651 967 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 HYALP1-201ENST00000417674 1279 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 AC096711.3-201ENST00000420721 582 ntTSL 4 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 RPS7P14-201ENST00000426405 583 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 AC083862.1-201ENST00000427378 1242 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 AC108479.1-201ENST00000431142 427 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 NIP7P1-201ENST00000433227 512 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 RPL14P5-201ENST00000436474 730 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 AC096632.2-201ENST00000438139 1239 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 AL159174.1-201ENST00000438267 811 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 LINC01449-201ENST00000440213 1220 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 AL512593.1-201ENST00000444758 779 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 LINC00349-201ENST00000448748 841 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 AL136982.3-201ENST00000454709 688 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 AL353633.1-201ENST00000458480 382 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 AC016489.1-201ENST00000461109 375 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 AC092902.1-201ENST00000486999 259 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 CD200R1-205ENST00000490004 778 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 AC078785.1-205ENST00000491578 482 ntTSL 4 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 RPL24-206ENST00000495401 478 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 LNCPRESS2-201ENST00000502518 616 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 AC108866.1-203ENST00000504106 529 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 AC093763.2-201ENST00000505334 1223 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 CFI-204ENST00000510800 667 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 LNX1-AS1-204ENST00000514364 495 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 GAPDHP62-201ENST00000515313 990 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 SEPT10P1-201ENST00000517342 1162 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 IGHV4-55-201ENST00000520889 368 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 MYRFL-202ENST00000535034 881 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 AL121594.2-201ENST00000541658 472 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 LSM3P2-201ENST00000551246 273 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 AL132989.1-201ENST00000557322 576 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 AC068408.1-201ENST00000577406 1144 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 LINC01892-201ENST00000579141 507 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 WDR45BP1-201ENST00000583470 1029 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 MIR5682-201ENST00000584864 76 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 AC008507.3-201ENST00000585753 472 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 AP005131.5-201ENST00000585817 498 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 AC119403.2-201ENST00000590960 598 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 BNIP3P27-201ENST00000599991 412 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 AC012213.4-201ENST00000606457 354 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 AC141002.1-201ENST00000607025 279 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 AL590426.2-201ENST00000607287 786 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 CR589904.2-201ENST00000612533 440 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 AL163051.2-201ENST00000618976 735 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 MIR7854-201ENST00000620068 65 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 SATB1-AS1-237ENST00000626982 735 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 DARS-AS1-227ENST00000627442 633 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CTF1Q16619 CCR6-201ENST00000341935 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.2 ms