Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 AC095038.1-201ENST00000429248 1591 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 FAM71F1-207ENST00000485070 1574 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 FAM71F1-209ENST00000621392 1591 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 OR51E2-203ENST00000641638 2626 ntAPPRIS P1 BASIC6.56□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 ALG13-202ENST00000371979 2770 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 CEP290-202ENST00000397838 2421 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 VNN3-202ENST00000367927 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 ADGRL3-207ENST00000507625 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 RSC1A1-201ENST00000345034 1854 ntAPPRIS P1 BASIC6.56□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 CASC19-243ENST00000641588 1546 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 ARPP21-220ENST00000441454 2880 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 GTF2H3-201ENST00000228955 1472 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 THAP12P8-201ENST00000447914 2115 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 TRIM6-202ENST00000380097 3403 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 CDK15-201ENST00000260967 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 TMEM170B-201ENST00000379426 8362 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 MTURN-202ENST00000324489 5605 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 AC087430.1-201ENST00000451707 3699 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 BPIFC-203ENST00000397452 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 LINC00700-201ENST00000413603 2097 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 TAS2R7-201ENST00000240687 1096 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 OR52E6-201ENST00000329322 970 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 RN7SKP191-201ENST00000364713 306 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 STMN1-202ENST00000374291 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 ZNF603P-201ENST00000405613 487 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 RPS3AP24-201ENST00000407896 734 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 PPP1R1C-203ENST00000409702 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 NME1P1-201ENST00000420914 382 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 FAM96B-201ENST00000422424 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 F10-AS1-201ENST00000424635 417 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 AC004039.1-201ENST00000431165 502 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 AC092598.1-201ENST00000431708 797 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 HSFX3-201ENST00000431993 1264 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 LINC00390-201ENST00000432331 340 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 AC129850.1-201ENST00000436203 508 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 RPEP4-201ENST00000437636 602 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 RPS24P1-201ENST00000438550 371 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 AL122019.1-201ENST00000438575 798 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 AC092393.1-201ENST00000439625 742 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 AC064874.1-202ENST00000440101 287 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 LRTOMT-209ENST00000440313 253 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 AC106874.1-201ENST00000440495 646 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 RBMX2P4-201ENST00000441256 376 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 AL671855.1-201ENST00000446875 1203 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 ENTPD3-AS1-204ENST00000452768 724 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 RN7SKP198-201ENST00000459286 306 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 UOX-201ENST00000471089 899 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 FAM104B-204ENST00000472571 1109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 RN7SL836P-201ENST00000476140 296 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 RN7SL259P-201ENST00000478499 253 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 RPL23AP8-201ENST00000479812 475 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 RPL5P33-201ENST00000487833 905 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 AC009567.2-201ENST00000502989 349 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 AC114324.2-202ENST00000503812 134 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 AC092349.1-201ENST00000504903 310 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 AC026780.1-201ENST00000512237 952 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 LINC02465-204ENST00000514892 481 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 AC093668.1-201ENST00000514917 911 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 NREP-223ENST00000515855 801 ntTSL 4 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 IGLVVII-41-1-201ENST00000518405 151 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 AC012613.1-201ENST00000522685 387 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 AP004247.1-201ENST00000531556 1289 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 LINC02290-203ENST00000556662 577 ntTSL 4 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 ACTR3BP3-201ENST00000565577 979 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 AC015908.3-202ENST00000579367 457 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 CCDC178-208ENST00000579916 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 LINC01919-203ENST00000581198 598 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 CT45A1-201ENST00000594117 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 AC009955.2-201ENST00000597288 542 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 CT45A3-201ENST00000597510 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 AP002906.1-201ENST00000603405 233 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 AC024060.1-201ENST00000607052 494 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 AC091965.4-201ENST00000607691 587 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 AL021707.7-201ENST00000607991 416 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 TUG1_1.1-201ENST00000610654 145 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 MIR6885-201ENST00000612241 66 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 Metazoa_SRP.181-201ENST00000616636 288 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 DAPL1-204ENST00000621326 671 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 AC048338.2-201ENST00000623601 684 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 AC011346.1-204ENST00000638089 1210 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 AC068137.3-201ENST00000639191 341 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 AC002115.2-201ENST00000640449 603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 AC073869.6-201ENST00000640656 341 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 OR6C3-203ENST00000641740 1093 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 ANGPTL5-201ENST00000334289 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 RGS1-201ENST00000367459 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 PCAT19-201ENST00000588495 3472 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 CD86-209ENST00000493101 1572 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 RAPGEF6-208ENST00000509018 8357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 RPE65-201ENST00000262340 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 LINC01252-201ENST00000499291 3673 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 IL13RA2-201ENST00000243213 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 AC111188.2-201ENST00000529697 1387 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 ICE2P1-201ENST00000512800 1849 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 TTC39B-208ENST00000512701 10483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 CACNB4-245ENST00000637284 2423 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 TRRAP-201ENST00000355540 12590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 SLC4A4-204ENST00000425175 7596 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 LMO3-225ENST00000541295 3498 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 DNM1L-203ENST00000381000 4397 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
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