Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 LINC00556-201ENST00000569603 412 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
ALCAMQ13740 MIR4776-2-201ENST00000580204 80 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
ALCAMQ13740 AC010271.1-201ENST00000599050 558 ntTSL 4 BASIC6.51□□□□□ -1.37
ALCAMQ13740 AC112211.1-201ENST00000607832 305 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
ALCAMQ13740 Metazoa_SRP.111-201ENST00000614073 259 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
ALCAMQ13740 CDKN2B-AS_3.1-201ENST00000617587 144 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
ALCAMQ13740 PCBP1-AS1-360ENST00000630377 598 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
ALCAMQ13740 AC092574.2-201ENST00000631198 753 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
ALCAMQ13740 PAPD4-203ENST00000428308 2204 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
ALCAMQ13740 TMEM257-201ENST00000408967 2441 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
ALCAMQ13740 ZNF638-201ENST00000264447 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
ALCAMQ13740 ZC3H7A-214ENST00000575984 2632 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
ALCAMQ13740 RAP1GDS1-202ENST00000339360 2092 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
ALCAMQ13740 TNFSF4-201ENST00000281834 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
ALCAMQ13740 MPDZ-219ENST00000546205 6342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
ALCAMQ13740 CEP128-202ENST00000281129 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
ALCAMQ13740 ESRRG-205ENST00000366937 5365 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
ALCAMQ13740 AC099506.1-201ENST00000567359 4037 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
ALCAMQ13740 ZCCHC6-201ENST00000277141 5724 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
ALCAMQ13740 ATP6V1A-201ENST00000273398 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
ALCAMQ13740 KIF27-204ENST00000413982 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
ALCAMQ13740 AC127164.1-201ENST00000548738 4196 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
ALCAMQ13740 SEPT7-203ENST00000399035 4066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
ALCAMQ13740 ZNF761-203ENST00000454407 3967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
ALCAMQ13740 PLEKHA1-201ENST00000368988 3872 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
ALCAMQ13740 TBC1D15-201ENST00000319106 2159 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
ALCAMQ13740 LINC01504-201ENST00000436054 2078 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
ALCAMQ13740 OR12D2-207ENST00000642051 1496 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
ALCAMQ13740 NUCB2-220ENST00000622082 1369 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
ALCAMQ13740 CLEC2D-202ENST00000261340 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
ALCAMQ13740 AC090616.2-201ENST00000358484 431 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
ALCAMQ13740 RNA5SP433-201ENST00000364491 114 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
ALCAMQ13740 GKN1-201ENST00000377938 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
ALCAMQ13740 LINC00396-201ENST00000411690 439 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
ALCAMQ13740 BX284656.2-201ENST00000414483 498 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
ALCAMQ13740 LINC00446-201ENST00000414743 459 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
ALCAMQ13740 FO393401.1-203ENST00000416260 486 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
ALCAMQ13740 LINC00701-201ENST00000418295 742 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
ALCAMQ13740 AC096775.1-201ENST00000437724 448 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
ALCAMQ13740 CST12P-201ENST00000457644 362 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
ALCAMQ13740 RPL38P3-201ENST00000484463 213 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
ALCAMQ13740 AC025458.1-201ENST00000506046 166 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
ALCAMQ13740 LINC01091-201ENST00000508111 645 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
ALCAMQ13740 GAPDHP71-201ENST00000511530 1003 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
ALCAMQ13740 AC139722.1-201ENST00000512502 782 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
ALCAMQ13740 AC097537.1-201ENST00000514864 1213 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
ALCAMQ13740 CREBZF-209ENST00000534224 545 ntTSL 4 BASIC6.5□□□□□ -1.37
ALCAMQ13740 AC079905.1-201ENST00000549280 475 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
ALCAMQ13740 OTX2-203ENST00000554559 715 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
ALCAMQ13740 TXNP4-201ENST00000575018 310 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
ALCAMQ13740 AC100863.1-201ENST00000584843 560 ntTSL 4 BASIC6.5□□□□□ -1.37
ALCAMQ13740 AC092070.2-201ENST00000597550 545 ntTSL 4 BASIC6.5□□□□□ -1.37
ALCAMQ13740 ZNF528-211ENST00000598192 625 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
ALCAMQ13740 AC087468.1-201ENST00000604365 630 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
ALCAMQ13740 AC239809.3-208ENST00000611452 531 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
ALCAMQ13740 AC025262.3-201ENST00000623666 360 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
ALCAMQ13740 AJ009632.2-209ENST00000634853 933 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
ALCAMQ13740 HECW2-201ENST00000260983 11809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
ALCAMQ13740 MATR3-215ENST00000510056 3040 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
ALCAMQ13740 PDZRN4-203ENST00000539469 3041 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
ALCAMQ13740 TRPC5OS-201ENST00000371970 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
ALCAMQ13740 WDR72-203ENST00000557913 5900 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
ALCAMQ13740 AC021092.1-201ENST00000592946 3199 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
ALCAMQ13740 RRM1-201ENST00000300738 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
ALCAMQ13740 DNHD1-201ENST00000254579 14862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
ALCAMQ13740 CTAGE5-217ENST00000557038 2869 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
ALCAMQ13740 OR5AQ1P-202ENST00000641257 1534 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
ALCAMQ13740 IFIT1P1-201ENST00000400497 1449 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
ALCAMQ13740 GPX8-201ENST00000296734 3245 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
ALCAMQ13740 SCAPER-207ENST00000563290 5028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
ALCAMQ13740 ZEB1-201ENST00000320985 5423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
ALCAMQ13740 AP002001.1-201ENST00000526101 1759 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
ALCAMQ13740 FAM197Y2-202ENST00000448006 2338 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
ALCAMQ13740 AC124017.1-201ENST00000508112 1594 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
ALCAMQ13740 AF287957.1-201ENST00000607368 1595 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
ALCAMQ13740 C15orf41-201ENST00000338183 2578 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
ALCAMQ13740 GDNF-AS1-202ENST00000510986 1941 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
ALCAMQ13740 TMED3-202ENST00000424155 16555 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
ALCAMQ13740 SELENOI-205ENST00000613142 8126 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
ALCAMQ13740 CRYGS-201ENST00000307944 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
ALCAMQ13740 RN7SKP275-201ENST00000364626 301 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
ALCAMQ13740 AC004386.1-201ENST00000393214 761 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
ALCAMQ13740 AL160163.1-201ENST00000417465 403 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
ALCAMQ13740 LINC01363-202ENST00000428030 930 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
ALCAMQ13740 C1orf140-201ENST00000434398 645 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
ALCAMQ13740 MACROD2-IT1-201ENST00000448536 665 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
ALCAMQ13740 RNU7-157P-201ENST00000459600 66 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
ALCAMQ13740 SYPL1-205ENST00000470347 1193 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
ALCAMQ13740 AC099521.1-201ENST00000482557 334 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
ALCAMQ13740 RN7SL193P-201ENST00000491708 276 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
ALCAMQ13740 AC091917.2-201ENST00000505002 744 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
ALCAMQ13740 AC011396.3-201ENST00000508845 512 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
ALCAMQ13740 AC096577.1-202ENST00000515649 448 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
ALCAMQ13740 LINC00861-202ENST00000517869 606 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
ALCAMQ13740 WASHC5-AS1-201ENST00000519140 587 ntTSL 4 BASIC6.49□□□□□ -1.37
ALCAMQ13740 AC079089.1-202ENST00000528800 1256 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
ALCAMQ13740 AC090424.1-201ENST00000535243 736 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
ALCAMQ13740 PCED1B-AS1-203ENST00000547626 420 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
ALCAMQ13740 AC234775.3-201ENST00000564612 656 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
ALCAMQ13740 AC009063.2-203ENST00000567860 745 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
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