Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 AC010240.2-201ENST00000445363 1205 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CUL4AQ13619 AC105384.2-201ENST00000508433 640 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CUL4AQ13619 GLUD1P3-202ENST00000508551 200 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CUL4AQ13619 AC021146.10-201ENST00000515628 706 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CUL4AQ13619 IGHVIII-47-1-201ENST00000518187 331 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CUL4AQ13619 LINC02422-201ENST00000535163 852 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CUL4AQ13619 AC089998.2-201ENST00000551856 277 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CUL4AQ13619 AL035661.1-201ENST00000620459 1144 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CUL4AQ13619 AC245187.2-201ENST00000631520 475 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CUL4AQ13619 AC073488.6-201ENST00000632293 754 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CUL4AQ13619 DHX32-201ENST00000284690 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
CUL4AQ13619 CPS1-204ENST00000451903 4770 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
CUL4AQ13619 LINC01524-201ENST00000428009 4390 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
CUL4AQ13619 ZC3H7A-214ENST00000575984 2632 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
CUL4AQ13619 PAPD4-203ENST00000428308 2204 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CUL4AQ13619 KYAT3-203ENST00000370491 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CUL4AQ13619 STON1-202ENST00000406226 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
CUL4AQ13619 PTBP3-207ENST00000458258 7995 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
CUL4AQ13619 PSG10P-201ENST00000501199 1500 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CUL4AQ13619 CPED1-203ENST00000423795 2189 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
CUL4AQ13619 MEMO1-202ENST00000379383 1498 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
CUL4AQ13619 F9-201ENST00000218099 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
CUL4AQ13619 PSG9-202ENST00000270077 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
CUL4AQ13619 CEP85L-201ENST00000360290 1736 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
CUL4AQ13619 VEZF1-204ENST00000584396 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
CUL4AQ13619 ZNF93-201ENST00000343769 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
CUL4AQ13619 LINC02141-201ENST00000568279 6586 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
CUL4AQ13619 CD47-201ENST00000355354 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
CUL4AQ13619 ZNF480-204ENST00000490272 2238 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
CUL4AQ13619 LINC01951-201ENST00000377300 1925 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
CUL4AQ13619 ALKBH3-AS1-201ENST00000499194 1906 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
CUL4AQ13619 C1orf185-201ENST00000371759 915 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
CUL4AQ13619 IFNB1-201ENST00000380232 859 ntAPPRIS P1 BASIC6.84□□□□□ -1.31
CUL4AQ13619 HSD17B7P1-201ENST00000412419 1017 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
CUL4AQ13619 LINC01058-201ENST00000420694 448 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
CUL4AQ13619 VN1R21P-201ENST00000426703 765 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
CUL4AQ13619 TEX41-206ENST00000432608 661 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
CUL4AQ13619 GAPDHP48-201ENST00000436626 961 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
CUL4AQ13619 MTND2P40-201ENST00000436718 841 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
CUL4AQ13619 MED28P3-201ENST00000444288 531 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
CUL4AQ13619 AL451063.1-201ENST00000450164 1133 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
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CUL4AQ13619 TRIM36-IT1-201ENST00000503723 881 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
CUL4AQ13619 AC111000.6-201ENST00000514471 709 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
CUL4AQ13619 COX6C-205ENST00000520468 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
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CUL4AQ13619 DLG2-207ENST00000398309 7890 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
CUL4AQ13619 PUM2-202ENST00000338086 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
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CUL4AQ13619 MGAT4D-203ENST00000511113 1125 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
CUL4AQ13619 AC096577.1-202ENST00000515649 448 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
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CUL4AQ13619 INO80-AS1-201ENST00000558967 312 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
CUL4AQ13619 AC009117.3-202ENST00000563825 557 ntTSL 4 BASIC6.83□□□□□ -1.32
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CUL4AQ13619 AC106729.1-201ENST00000567777 466 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
CUL4AQ13619 LYRM1-211ENST00000569023 769 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
CUL4AQ13619 RN7SL66P-201ENST00000582099 264 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
CUL4AQ13619 LINC01906-201ENST00000582962 499 ntTSL 4 BASIC6.83□□□□□ -1.32
CUL4AQ13619 LINC01533-204ENST00000590719 435 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
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CUL4AQ13619 BPIFA4P-204ENST00000605211 656 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
CUL4AQ13619 AC026786.2-201ENST00000606110 392 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
CUL4AQ13619 MIR6809-201ENST00000612189 116 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
CUL4AQ13619 AL021918.2-201ENST00000613415 194 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
CUL4AQ13619 FAM49B-229ENST00000615041 750 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
CUL4AQ13619 AC005899.6-201ENST00000620729 297 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
CUL4AQ13619 AP2B1-222ENST00000628168 192 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
CUL4AQ13619 TANC2-202ENST00000424789 11721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
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