Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 FRG2FP-204ENST00000453982 852 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
TMPOP42166 ATP5J-207ENST00000457143 589 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
TMPOP42166 AC105384.2-201ENST00000508433 640 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
TMPOP42166 UGT2A3P7-201ENST00000510485 734 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
TMPOP42166 AP003037.1-201ENST00000537594 267 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
TMPOP42166 AL390816.1-201ENST00000553990 322 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
TMPOP42166 AC063977.5-201ENST00000601044 974 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
TMPOP42166 Metazoa_SRP.43-201ENST00000616394 271 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
TMPOP42166 Metazoa_SRP.130-201ENST00000622625 267 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
TMPOP42166 AC103703.1-201ENST00000634783 663 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
TMPOP42166 IGLV10-54-202ENST00000640991 351 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
TMPOP42166 MIR193BHG-214ENST00000641765 509 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
TMPOP42166 BRCA1-210ENST00000471181 5936 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
TMPOP42166 HEMK1-203ENST00000434410 17064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
TMPOP42166 AC099506.1-201ENST00000567359 4037 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
TMPOP42166 ZNF248-201ENST00000357328 4795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.2
TMPOP42166 CLCC1-204ENST00000369968 4151 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.2
TMPOP42166 ST7-203ENST00000393443 2360 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.2
TMPOP42166 KRT222-202ENST00000394052 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
TMPOP42166 RAB6C-AS1-201ENST00000412425 2454 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
TMPOP42166 CLSPN-202ENST00000318121 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
TMPOP42166 CAPRIN2-202ENST00000395805 4156 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
TMPOP42166 C6orf163-202ENST00000388923 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
TMPOP42166 AC117409.1-201ENST00000470499 1310 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
TMPOP42166 SENP8-202ENST00000542035 1672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
TMPOP42166 ESRRG-205ENST00000366937 5365 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
TMPOP42166 RALYL-206ENST00000521376 1457 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
TMPOP42166 SNORA64.1-201ENST00000362600 132 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
TMPOP42166 AL355339.1-202ENST00000417542 458 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
TMPOP42166 TSSK4-203ENST00000428351 576 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
TMPOP42166 BX119321.1-201ENST00000428912 797 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
TMPOP42166 AC074011.1-201ENST00000431376 581 ntTSL 4 BASIC7.58□□□□□ -1.2
TMPOP42166 AL355339.1-201ENST00000434386 435 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
TMPOP42166 ITGA9-AS1-207ENST00000445429 532 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
TMPOP42166 PPIAP19-201ENST00000486414 492 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
TMPOP42166 KATNBL1P4-201ENST00000503545 918 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
TMPOP42166 HGNC:24955-208ENST00000521585 1260 ntTSL 4 BASIC7.58□□□□□ -1.2
TMPOP42166 SCARNA9-201ENST00000530422 353 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
TMPOP42166 SLC7A7-210ENST00000554517 1158 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
TMPOP42166 FRMD6-AS2-201ENST00000556617 548 ntTSL 4 BASIC7.58□□□□□ -1.2
TMPOP42166 AC073964.1-201ENST00000558938 308 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
TMPOP42166 MIR4260-201ENST00000583107 67 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
TMPOP42166 AL049840.6-201ENST00000604583 345 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
TMPOP42166 AC026124.2-201ENST00000621847 656 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
TMPOP42166 TTC3-201ENST00000354749 9084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
TMPOP42166 ANKRD26P1-204ENST00000571006 4741 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
TMPOP42166 THEMIS-206ENST00000630369 2786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
TMPOP42166 TCF7L2-219ENST00000542695 4136 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
TMPOP42166 PRRC2C-202ENST00000367742 10366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
TMPOP42166 ZNF766-201ENST00000439461 6298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
TMPOP42166 OR10G4-202ENST00000641521 3623 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
TMPOP42166 CCDC178-209ENST00000579947 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
TMPOP42166 GTF2IP4-201ENST00000453092 2054 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
TMPOP42166 SNORA70.9-201ENST00000384370 135 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
TMPOP42166 NIFKP3-201ENST00000417799 865 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
TMPOP42166 OR4K3-201ENST00000425829 947 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
TMPOP42166 AL162385.2-201ENST00000437864 285 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
TMPOP42166 RPL31P15-201ENST00000449770 338 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
TMPOP42166 RSU1P1-201ENST00000453416 441 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
TMPOP42166 RNU1-88P-201ENST00000459274 128 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
TMPOP42166 LINC02339-201ENST00000472649 752 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
TMPOP42166 RN7SL273P-201ENST00000481561 299 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
TMPOP42166 MTATP6P1-201ENST00000514057 681 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
TMPOP42166 IGKV3D-34-201ENST00000522638 302 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
TMPOP42166 MRPS16P1-201ENST00000523462 412 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
TMPOP42166 CCDC60-203ENST00000536742 886 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
TMPOP42166 GPRC5D-AS1-205ENST00000540198 404 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
TMPOP42166 AC126615.2-201ENST00000553003 515 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
TMPOP42166 AC114488.3-201ENST00000581333 480 ntTSL 4 BASIC7.57□□□□□ -1.2
TMPOP42166 AC012588.1-201ENST00000583852 358 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
TMPOP42166 AC135983.2-201ENST00000604301 628 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
TMPOP42166 AC127024.6-201ENST00000621598 424 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
TMPOP42166 MAP4K4-221ENST00000634702 3800 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
TMPOP42166 PIGX-210ENST00000639143 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
TMPOP42166 SLC4A10-201ENST00000272716 3414 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
TMPOP42166 HSPA13-201ENST00000285667 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
TMPOP42166 C3orf35-203ENST00000425564 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
TMPOP42166 KCNJ15-201ENST00000328656 8399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
TMPOP42166 FAM135A-202ENST00000361499 5042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
TMPOP42166 AL357568.1-201ENST00000421530 1963 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
TMPOP42166 TMEM257-201ENST00000408967 2441 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
TMPOP42166 AC092958.1-201ENST00000467198 2569 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
TMPOP42166 TLR2-201ENST00000260010 4200 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
TMPOP42166 MARCH6-201ENST00000274140 9569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
TMPOP42166 RORA-203ENST00000335670 10844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
TMPOP42166 RPS2P45-201ENST00000469997 2057 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
TMPOP42166 AL355306.2-206ENST00000635233 1903 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
TMPOP42166 ADGB-205ENST00000397944 5325 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
TMPOP42166 ZNF195-201ENST00000005082 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
TMPOP42166 PAGE2-202ENST00000374968 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
TMPOP42166 CEACAM7-202ENST00000401731 1236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
TMPOP42166 AL662874.1-201ENST00000426065 230 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
TMPOP42166 AL022331.1-201ENST00000429025 477 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
TMPOP42166 AC064862.4-201ENST00000442180 334 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
TMPOP42166 AP000281.1-201ENST00000444036 316 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
TMPOP42166 RNF219-AS1-202ENST00000444769 590 ntTSL 4 BASIC7.56□□□□□ -1.2
TMPOP42166 RPL36AP39-201ENST00000445859 318 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
TMPOP42166 HMGN1P36-201ENST00000446623 298 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
TMPOP42166 AC016724.1-201ENST00000453215 421 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
TMPOP42166 MRE11P1-201ENST00000464884 2127 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.8 ms