Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 HSPD1P7-201ENST00000447985 1686 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CASQ1P31415 DDHD2-202ENST00000517385 4113 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CASQ1P31415 DENND4A-201ENST00000431932 5875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
CASQ1P31415 SAMD9L-204ENST00000437805 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
CASQ1P31415 MAPRE2-202ENST00000413393 4173 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CASQ1P31415 ZNF611-201ENST00000319783 3153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CASQ1P31415 AC124312.1-201ENST00000551312 1325 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CASQ1P31415 ZNF675-201ENST00000359788 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
CASQ1P31415 SDAD1-203ENST00000395711 2513 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CASQ1P31415 SAMD3-205ENST00000457563 1877 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CASQ1P31415 CABYR-204ENST00000399499 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
CASQ1P31415 AC104823.1-201ENST00000413290 989 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
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CASQ1P31415 RPL21P50-201ENST00000417698 477 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CASQ1P31415 NMD3P2-201ENST00000421815 761 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CASQ1P31415 AL136231.1-201ENST00000429407 730 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CASQ1P31415 FECHP1-201ENST00000431896 1214 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CASQ1P31415 AC016582.1-203ENST00000433142 502 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
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CASQ1P31415 AL391097.2-201ENST00000435057 485 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CASQ1P31415 TRGC2-201ENST00000436911 1013 ntAPPRIS P1 BASIC6.31□□□□□ -1.4
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CASQ1P31415 HIGD1AP16-201ENST00000450986 258 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CASQ1P31415 AL157896.1-201ENST00000451617 790 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
CASQ1P31415 USP12-AS2-201ENST00000452222 279 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CASQ1P31415 RPL38P3-201ENST00000484463 213 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CASQ1P31415 OR11I1P-201ENST00000486033 954 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CASQ1P31415 AC112496.1-201ENST00000497961 562 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CASQ1P31415 AC093664.1-201ENST00000511779 289 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CASQ1P31415 LNX1-AS1-204ENST00000514364 495 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CASQ1P31415 ATP6V0E1-202ENST00000517669 502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
CASQ1P31415 OR7E158P-201ENST00000524483 910 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CASQ1P31415 ASB8-202ENST00000535055 657 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CASQ1P31415 ASB8-203ENST00000535988 679 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CASQ1P31415 SNHG1-218ENST00000541615 748 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CASQ1P31415 AL358913.1-201ENST00000554342 121 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CASQ1P31415 OTX2-203ENST00000554559 715 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CASQ1P31415 AC020892.1-201ENST00000559918 855 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CASQ1P31415 AC020661.4-201ENST00000561388 500 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CASQ1P31415 AC135050.4-201ENST00000568708 504 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
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CASQ1P31415 LINC01906-201ENST00000582962 499 ntTSL 4 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CASQ1P31415 KDM5DP1-201ENST00000622542 298 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CASQ1P31415 PTPRD-213ENST00000537002 8224 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
CASQ1P31415 APAF1-205ENST00000547045 3744 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
CASQ1P31415 DNA2-201ENST00000358410 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
CASQ1P31415 AC026523.2-201ENST00000625039 7739 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
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CASQ1P31415 AC087473.1-201ENST00000561320 2471 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
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CASQ1P31415 FAM72A-208ENST00000607379 1139 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CASQ1P31415 RDM1-226ENST00000619828 687 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CASQ1P31415 SNHG5-214ENST00000623001 598 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CASQ1P31415 VIPR1-AS1-221ENST00000626992 602 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CASQ1P31415 UNC80-203ENST00000439458 13562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CASQ1P31415 AC092111.2-201ENST00000611627 1414 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CASQ1P31415 CACNB4-221ENST00000636130 7748 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CASQ1P31415 CYP3A7-CYP3A51P-202ENST00000620220 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CASQ1P31415 KLHL13-206ENST00000469946 2353 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CASQ1P31415 ZNF440-201ENST00000304060 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CASQ1P31415 PTPRD-205ENST00000397611 8242 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CASQ1P31415 RBMY1HP-201ENST00000382759 1389 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CASQ1P31415 MRRF-208ENST00000394315 1501 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CASQ1P31415 WAC-209ENST00000428935 1320 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CASQ1P31415 EIF3H-209ENST00000521861 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
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