Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 EIF4ENIF1-205ENST00000397523 3420 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
HOXD10P28358 TCF12-207ENST00000557843 4076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
HOXD10P28358 SLF1-201ENST00000265140 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
HOXD10P28358 DOCK10-202ENST00000409592 7288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
HOXD10P28358 AL596244.1-201ENST00000567068 3779 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
HOXD10P28358 MSANTD2-204ENST00000526629 3086 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
HOXD10P28358 AL157831.2-201ENST00000564681 3095 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
HOXD10P28358 AL137058.3-201ENST00000624531 3099 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
HOXD10P28358 EBF1-211ENST00000622875 4430 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
HOXD10P28358 ADAM18-202ENST00000379866 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
HOXD10P28358 AC005332.9-201ENST00000620266 2921 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
HOXD10P28358 TANK-205ENST00000405852 2155 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
HOXD10P28358 ZNF329-201ENST00000358067 3290 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
HOXD10P28358 NRXN1-211ENST00000406859 2553 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
HOXD10P28358 PHC3-203ENST00000467570 2595 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
HOXD10P28358 OFD1P8Y-201ENST00000449148 1433 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
HOXD10P28358 CASC19-248ENST00000641674 1356 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
HOXD10P28358 NRCAM-201ENST00000351718 6228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
HOXD10P28358 CHRM3-AS2-201ENST00000427859 2431 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
HOXD10P28358 ANGPTL5-201ENST00000334289 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
HOXD10P28358 DLG1-210ENST00000422288 2854 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
HOXD10P28358 TRBV23-1-201ENST00000390396 347 ntAPPRIS P1 BASIC6.86□□□□□ -1.31
HOXD10P28358 DPPA2P2-201ENST00000418220 897 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
HOXD10P28358 AL137005.1-201ENST00000452944 719 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
HOXD10P28358 RN7SL329P-201ENST00000467740 299 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
HOXD10P28358 AC099521.1-201ENST00000482557 334 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
HOXD10P28358 AADACP1-204ENST00000483636 1285 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
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HOXD10P28358 AC091979.1-201ENST00000517595 706 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
HOXD10P28358 AP003080.1-202ENST00000526526 915 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
HOXD10P28358 AC127526.3-201ENST00000534291 450 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
HOXD10P28358 DCN-209ENST00000546745 1026 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
HOXD10P28358 LINC01234-204ENST00000550905 589 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
HOXD10P28358 AC113208.4-201ENST00000563568 206 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
HOXD10P28358 AC136944.1-201ENST00000567464 560 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
HOXD10P28358 AC012588.1-201ENST00000583852 358 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
HOXD10P28358 LINC01476-202ENST00000584262 635 ntTSL 4 BASIC6.86□□□□□ -1.31
HOXD10P28358 AC002398.1-201ENST00000589397 427 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
HOXD10P28358 Z98949.1-207ENST00000609157 814 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
HOXD10P28358 RAPH1-204ENST00000418114 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
HOXD10P28358 RAPH1-205ENST00000419464 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
HOXD10P28358 AC008560.1-201ENST00000510585 1766 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
HOXD10P28358 AC007744.1-201ENST00000607540 2289 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
HOXD10P28358 ZNF790-206ENST00000613249 2183 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.86□□□□□ -1.31
HOXD10P28358 HORMAD2-202ENST00000403975 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
HOXD10P28358 DCTN5-201ENST00000300087 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
HOXD10P28358 SETX-201ENST00000224140 11100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
HOXD10P28358 RPL37-201ENST00000274242 7686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
HOXD10P28358 LRRC37A16P-202ENST00000586022 3725 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
HOXD10P28358 DGKB-201ENST00000399322 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
HOXD10P28358 TRAF5-201ENST00000261464 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
HOXD10P28358 SNW1-205ENST00000555761 1855 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
HOXD10P28358 FMO4-201ENST00000367749 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
HOXD10P28358 HELZ-207ENST00000580168 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
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HOXD10P28358 SYT4-201ENST00000255224 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
HOXD10P28358 LINC00326-202ENST00000457339 2515 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
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HOXD10P28358 TBC1D23-205ENST00000475134 2074 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
HOXD10P28358 TTC26-203ENST00000464848 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
HOXD10P28358 BPESC1-201ENST00000418282 3522 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
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HOXD10P28358 SNORA58-201ENST00000505219 137 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
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HOXD10P28358 AC068672.3-201ENST00000524017 824 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
HOXD10P28358 OR4A13P-201ENST00000529316 942 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
HOXD10P28358 AP002754.2-201ENST00000542121 462 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
HOXD10P28358 HAUS8P1-201ENST00000549005 542 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
HOXD10P28358 AC026992.1-201ENST00000558269 571 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
HOXD10P28358 TAT-AS1-201ENST00000561529 873 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
HOXD10P28358 SLC25A3P1-203ENST00000563752 460 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
HOXD10P28358 AC026471.4-201ENST00000569291 449 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
HOXD10P28358 AC008115.3-201ENST00000614874 549 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
HOXD10P28358 AC007204.2-201ENST00000615022 616 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
HOXD10P28358 OR7A1P-202ENST00000641542 1158 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
HOXD10P28358 AL449283.1-201ENST00000602631 3403 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
HOXD10P28358 LINC01527-201ENST00000419578 1997 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
HOXD10P28358 SLC35F1-202ENST00000621341 4481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
HOXD10P28358 LINC01722-201ENST00000456265 3033 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
HOXD10P28358 PARP4P2-201ENST00000446672 3326 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
HOXD10P28358 IBTK-201ENST00000306270 6054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
HOXD10P28358 AL358394.2-201ENST00000427229 3637 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
HOXD10P28358 AC119674.1-202ENST00000641333 1860 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
HOXD10P28358 GRIA2-204ENST00000393815 5260 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
HOXD10P28358 PJA2-201ENST00000361189 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
HOXD10P28358 PCAT19-201ENST00000588495 3472 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
HOXD10P28358 MYBL1-206ENST00000524176 2148 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
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