Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 EEF1E1-BLOC1S5-201ENST00000397456 768 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 IL6-203ENST00000401651 539 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 RPL31P52-201ENST00000407532 367 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 RNU6-77P-201ENST00000410554 91 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 LINC00427-201ENST00000412722 430 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 TEX38-202ENST00000415500 566 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 AC017104.2-201ENST00000417000 321 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 AC069213.1-202ENST00000417011 810 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 LINC01752-201ENST00000417299 438 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 AL354824.1-201ENST00000424931 349 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 AC000362.1-201ENST00000433725 425 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 AC005208.1-201ENST00000435112 599 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 LINC00578-201ENST00000439009 542 ntTSL 4 BASIC4.5□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 NQO1-204ENST00000439109 924 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 ACTR3P2-201ENST00000439585 1257 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 AL645638.1-201ENST00000440519 361 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 MTND1P33-201ENST00000446251 917 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 AL133215.1-201ENST00000447344 342 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 LINC02527-201ENST00000449069 762 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 EIF4A1P11-201ENST00000451239 222 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 AL137802.1-201ENST00000452795 327 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 BBIP1-208ENST00000454061 812 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 AF129075.1-201ENST00000457162 794 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 AC104164.3-201ENST00000467363 1258 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 TMEM196-205ENST00000493519 687 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 AC063943.2-201ENST00000495697 534 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 PPP4R1L-209ENST00000497138 4680 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 RN7SL775P-201ENST00000498361 336 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 LINC01088-203ENST00000507476 785 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 AC008494.2-201ENST00000514544 370 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 RNU6-276P-201ENST00000516114 96 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 AC021451.1-201ENST00000523498 1129 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 AC055860.1-201ENST00000525523 688 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 GCSAML-207ENST00000527541 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 GOLT1B-205ENST00000540141 1055 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC4.5□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 AC090673.2-201ENST00000544279 454 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 LINC02443-204ENST00000544717 754 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 NDUFA3P4-201ENST00000560814 250 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 LINC01572-205ENST00000570152 360 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 AC006441.4-202ENST00000577621 510 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 RN7SL786P-201ENST00000579130 298 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 AC090312.2-201ENST00000582687 378 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 AC005757.1-201ENST00000591432 472 ntTSL 4 BASIC4.5□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 AC011447.3-202ENST00000593655 555 ntTSL 4 BASIC4.5□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 AC003002.3-201ENST00000597410 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 AC006262.2-201ENST00000599127 612 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 AC009948.4-201ENST00000604692 675 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 AC026979.4-201ENST00000606555 645 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 MIR7848-201ENST00000617402 101 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 AC018926.3-201ENST00000618841 406 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 AC078909.2-201ENST00000620584 398 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 AP003485.1-201ENST00000625093 753 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 AL450326.2-201ENST00000421913 1962 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 VPS39-202ENST00000348544 2661 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 VPS13B-203ENST00000358544 14094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 DAZ1-203ENST00000426000 1846 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 MRRFP1-201ENST00000435941 1675 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 SMAD4-202ENST00000398417 8495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 MTCO1P6-201ENST00000481192 1384 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 LINC00507-201ENST00000540882 1935 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 TXNRD1-212ENST00000526390 3808 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 CTNNA1P1-201ENST00000515849 2728 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 ZNF143-201ENST00000299606 2562 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 CFHR3-201ENST00000367425 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 ADAMTS9-AS1-203ENST00000471990 1606 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 SLC25A12-202ENST00000422440 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 NCOR1-204ENST00000395851 7950 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 FOCAD-202ENST00000380249 6096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 DMD-202ENST00000343523 5623 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 MAPK10-207ENST00000395166 3085 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 NLRP11-204ENST00000592953 3077 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 TTI1-202ENST00000373448 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 OPALIN-201ENST00000371172 3557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 LRRC37B-201ENST00000327564 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 GOLGB1-202ENST00000393667 11198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 ZMYND11-204ENST00000381604 4066 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 CCDC125-202ENST00000396496 4198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 ZNF711-202ENST00000360700 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 OR5AN1-203ENST00000641998 7647 ntAPPRIS P1 BASIC4.49□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 ADGRE1-203ENST00000381404 3056 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 GUCY2C-201ENST00000261170 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 AHSP-201ENST00000302312 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 OR8B3-201ENST00000354597 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.49□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 RNU5E-10P-201ENST00000363506 118 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 ZBTB8OS-202ENST00000373501 598 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 OR8B2-201ENST00000375013 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.49□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 MIR525-201ENST00000384978 85 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 SNORA35-201ENST00000386104 128 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 TRAV27-201ENST00000390457 425 ntAPPRIS P1 BASIC4.49□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 SRSF7-202ENST00000409276 1050 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 RNA5SP296-201ENST00000410523 111 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 LINC00463-201ENST00000413501 1147 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 AL359475.1-201ENST00000414505 292 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 AL391811.1-201ENST00000416908 423 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 USP9YP21-201ENST00000420603 432 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 AL158070.1-201ENST00000421614 631 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 HCG25-217ENST00000422366 702 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 LINC01980-202ENST00000425195 491 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 AC005008.2-201ENST00000431501 715 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
VPREB1P12018 RPSAP62-201ENST00000432596 833 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.7 ms